Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W9

C11orf54, Ester hydrolase C11orf54, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf54Q9H0W9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C11orf54Q9H0W9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C11orf54Q9H0W9 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C11orf54Q9H0W9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C11orf54Q9H0W9 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C11orf54Q9H0W9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C11orf54Q9H0W9 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C11orf54Q9H0W9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C11orf54Q9H0W9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C11orf54Q9H0W9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C11orf54Q9H0W9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C11orf54Q9H0W9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C11orf54Q9H0W9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C11orf54Q9H0W9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C11orf54Q9H0W9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C11orf54Q9H0W9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C11orf54Q9H0W9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C11orf54Q9H0W9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C11orf54Q9H0W9 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C11orf54Q9H0W9 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C11orf54Q9H0W9 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C11orf54Q9H0W9 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C11orf54Q9H0W9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
C11orf54Q9H0W9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
C11orf54Q9H0W9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C11orf54Q9H0W9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C11orf54Q9H0W9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C11orf54Q9H0W9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C11orf54Q9H0W9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C11orf54Q9H0W9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C11orf54Q9H0W9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C11orf54Q9H0W9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C11orf54Q9H0W9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C11orf54Q9H0W9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C11orf54Q9H0W9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C11orf54Q9H0W9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C11orf54Q9H0W9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C11orf54Q9H0W9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C11orf54Q9H0W9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C11orf54Q9H0W9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
C11orf54Q9H0W9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C11orf54Q9H0W9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C11orf54Q9H0W9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C11orf54Q9H0W9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C11orf54Q9H0W9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
C11orf54Q9H0W9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C11orf54Q9H0W9 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C11orf54Q9H0W9 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C11orf54Q9H0W9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C11orf54Q9H0W9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
C11orf54Q9H0W9 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C11orf54Q9H0W9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
C11orf54Q9H0W9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C11orf54Q9H0W9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C11orf54Q9H0W9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C11orf54Q9H0W9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C11orf54Q9H0W9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C11orf54Q9H0W9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C11orf54Q9H0W9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C11orf54Q9H0W9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C11orf54Q9H0W9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C11orf54Q9H0W9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C11orf54Q9H0W9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C11orf54Q9H0W9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C11orf54Q9H0W9 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C11orf54Q9H0W9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C11orf54Q9H0W9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C11orf54Q9H0W9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C11orf54Q9H0W9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C11orf54Q9H0W9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C11orf54Q9H0W9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C11orf54Q9H0W9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C11orf54Q9H0W9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C11orf54Q9H0W9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C11orf54Q9H0W9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C11orf54Q9H0W9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
C11orf54Q9H0W9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
C11orf54Q9H0W9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C11orf54Q9H0W9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C11orf54Q9H0W9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C11orf54Q9H0W9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C11orf54Q9H0W9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C11orf54Q9H0W9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C11orf54Q9H0W9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C11orf54Q9H0W9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C11orf54Q9H0W9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C11orf54Q9H0W9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C11orf54Q9H0W9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C11orf54Q9H0W9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C11orf54Q9H0W9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
C11orf54Q9H0W9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C11orf54Q9H0W9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C11orf54Q9H0W9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C11orf54Q9H0W9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C11orf54Q9H0W9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C11orf54Q9H0W9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C11orf54Q9H0W9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C11orf54Q9H0W9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C11orf54Q9H0W9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C11orf54Q9H0W9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms