RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000609451.5

EBF4-210, Transcript of early B cell factor 4, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC

Gene EBF4, Length 2,012 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4-210ENST00000609451 NISCHQ9Y2I1 1504 aa52.58■■■■■ 6.01
EBF4-210ENST00000609451 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa45.45■■■■■ 4.87
EBF4-210ENST00000609451 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP44.41■■■■■ 4.7
EBF4-210ENST00000609451 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa43.81■■■■■ 4.6
EBF4-210ENST00000609451 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa43.4■■■■■ 4.54
EBF4-210ENST00000609451 DCAF8L2P0C7V8 631 aa43.29■■■■■ 4.52
EBF4-210ENST00000609451 MYO15BQ96JP2 1530 aa42.71■■■■■ 4.43
EBF4-210ENST00000609451 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.64■■■■■ 4.42
EBF4-210ENST00000609451 ABCC9O60706 1549 aa42.62■■■■■ 4.41
EBF4-210ENST00000609451 NACADO15069 1562 aa42.28■■■■■ 4.36
EBF4-210ENST00000609451 SCRIBQ14160 1630 aa41.9■■■■■ 4.3
EBF4-210ENST00000609451 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa41.8■■■■■ 4.28
EBF4-210ENST00000609451 CHIC1Q5VXU3 224 aa41.39■■■■■ 4.22
EBF4-210ENST00000609451 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP41.27■■■■■ 4.2
EBF4-210ENST00000609451 CECR2Q9BXF3 1484 aa40.88■■■■■ 4.13
EBF4-210ENST00000609451 UNC13AQ9UPW8 1703 aa40.87■■■■■ 4.13
EBF4-210ENST00000609451 MROH2BQ7Z745 1585 aa40.74■■■■■ 4.11
EBF4-210ENST00000609451 BICRAQ9NZM4 1560 aa40.5■■■■■ 4.07
EBF4-210ENST00000609451 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP40.48■■■■■ 4.07
EBF4-210ENST00000609451 WIZO95785 1651 aa40.45■■■■■ 4.07
EBF4-210ENST00000609451 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP40.35■■■■■ 4.05
EBF4-210ENST00000609451 SMARCA4P51532 1647 aa40.2■■■■■ 4.03
EBF4-210ENST00000609451 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP39.99■■■■□ 3.99
EBF4-210ENST00000609451 TRIM41Q8WV44 630 aa39.94■■■■□ 3.98
EBF4-210ENST00000609451 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa39.91■■■■□ 3.98
EBF4-210ENST00000609451 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP39.85■■■■□ 3.97
EBF4-210ENST00000609451 PEG3Q9GZU2 1588 aa39.71■■■■□ 3.95
EBF4-210ENST00000609451 SMARCA2P51531 1590 aa39.69■■■■□ 3.94
EBF4-210ENST00000609451 CCDC88BA6NC98 1476 aa39.66■■■■□ 3.94
EBF4-210ENST00000609451 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa39.47■■■■□ 3.91
EBF4-210ENST00000609451 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP39.34■■■■□ 3.89
EBF4-210ENST00000609451 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP39.27■■■■□ 3.88
EBF4-210ENST00000609451 ABCC8Q09428 1581 aa39.22■■■■□ 3.87
EBF4-210ENST00000609451 PCGF6Q9BYE7 350 aa39.19■■■■□ 3.86
EBF4-210ENST00000609451 NCAPD3P42695 1498 aa39.06■■■■□ 3.84
EBF4-210ENST00000609451 HMGXB3Q12766 1538 aa39■■■■□ 3.83
EBF4-210ENST00000609451 HRCP23327 699 aa38.94■■■■□ 3.82
EBF4-210ENST00000609451 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP38.84■■■■□ 3.81
EBF4-210ENST00000609451 EHMT2Q96KQ7 1210 aa38.8■■■■□ 3.8
EBF4-210ENST00000609451 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38.76■■■■□ 3.8
EBF4-210ENST00000609451 SOGA1O94964 1423 aa38.72■■■■□ 3.79
EBF4-210ENST00000609451 EEA1Q15075 1411 aa38.7■■■■□ 3.79
EBF4-210ENST00000609451 SYNJ1O43426 1573 aa38.61■■■■□ 3.77
EBF4-210ENST00000609451 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa38.55■■■■□ 3.76
EBF4-210ENST00000609451 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa38.54■■■■□ 3.76
EBF4-210ENST00000609451 CSRNP3Q8WYN3 585 aa38.47■■■■□ 3.75
EBF4-210ENST00000609451 TNIKQ9UKE5 1360 aa38.38■■■■□ 3.73
EBF4-210ENST00000609451 CFTRP13569 1480 aa38.33■■■■□ 3.73
EBF4-210ENST00000609451 TOP2BQ02880 1626 aa38.3■■■■□ 3.72
EBF4-210ENST00000609451 CEP162Q5TB80 1403 aa38.29■■■■□ 3.72
EBF4-210ENST00000609451 GOLGA3Q08378 1498 aa38.28■■■■□ 3.72
EBF4-210ENST00000609451 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa38.23■■■■□ 3.71
EBF4-210ENST00000609451 KIF21BO75037 1637 aa38.18■■■■□ 3.7
EBF4-210ENST00000609451 CEP164Q9UPV0 1460 aa38.15■■■■□ 3.7
EBF4-210ENST00000609451 CADPSQ9ULU8 1353 aa38.12■■■■□ 3.69
EBF4-210ENST00000609451 UBTFP17480 764 aaKnown RBP38.07■■■■□ 3.68
EBF4-210ENST00000609451 PRDM2Q13029 1718 aa38.02■■■■□ 3.68
EBF4-210ENST00000609451 CUX1P39880 1505 aa38■■■■□ 3.67
EBF4-210ENST00000609451 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP37.97■■■■□ 3.67
EBF4-210ENST00000609451 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa37.86■■■■□ 3.65
EBF4-210ENST00000609451 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP37.77■■■■□ 3.64
EBF4-210ENST00000609451 PRXQ9BXM0 1461 aa37.73■■■■□ 3.63
EBF4-210ENST00000609451 CLIP1P30622 1438 aa37.72■■■■□ 3.63
EBF4-210ENST00000609451 ERICH3Q5RHP9 1530 aa37.72■■■■□ 3.63
EBF4-210ENST00000609451 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.67■■■■□ 3.62
EBF4-210ENST00000609451 KIF27Q86VH2 1401 aa37.65■■■■□ 3.62
EBF4-210ENST00000609451 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.62■■■■□ 3.61
EBF4-210ENST00000609451 NESP48681 1621 aa37.56■■■■□ 3.6
EBF4-210ENST00000609451 VPS8Q8N3P4 1428 aa37.55■■■■□ 3.6
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EBF4-210ENST00000609451 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP37.43■■■■□ 3.58
EBF4-210ENST00000609451 FGD5Q6ZNL6 1462 aa37.4■■■■□ 3.58
EBF4-210ENST00000609451 DNMBPQ6XZF7 1577 aa37.39■■■■□ 3.58
EBF4-210ENST00000609451 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.37■■■■□ 3.57
EBF4-210ENST00000609451 CUX2O14529 1486 aa37.36■■■■□ 3.57
EBF4-210ENST00000609451 TOPBP1Q92547 1522 aa37.3■■■■□ 3.56
EBF4-210ENST00000609451 IGF1RP08069 1367 aa37.28■■■■□ 3.56
EBF4-210ENST00000609451 ARAP1Q96P48 1450 aa37.27■■■■□ 3.56
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EBF4-210ENST00000609451 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP37.17■■■■□ 3.54
EBF4-210ENST00000609451 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP37.14■■■■□ 3.54
EBF4-210ENST00000609451 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP37.12■■■■□ 3.53
EBF4-210ENST00000609451 APLP2Q06481 763 aa37.11■■■■□ 3.53
EBF4-210ENST00000609451 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa37.1■■■■□ 3.53
EBF4-210ENST00000609451 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa37.07■■■■□ 3.53
EBF4-210ENST00000609451 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa37.05■■■■□ 3.52
EBF4-210ENST00000609451 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.05■■■■□ 3.52
EBF4-210ENST00000609451 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa37.05■■■■□ 3.52
EBF4-210ENST00000609451 WDR97A6NE52 1622 aa36.83■■■■□ 3.49
EBF4-210ENST00000609451 MRC2Q9UBG0 1479 aa36.81■■■■□ 3.48
EBF4-210ENST00000609451 CUL7Q14999 1698 aa36.78■■■■□ 3.48
EBF4-210ENST00000609451 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP36.78■■■■□ 3.48
EBF4-210ENST00000609451 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP36.75■■■■□ 3.47
EBF4-210ENST00000609451 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa36.7■■■■□ 3.47
EBF4-210ENST00000609451 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36.68■■■■□ 3.46
EBF4-210ENST00000609451 GAPVD1Q14C86 1478 aa36.67■■■■□ 3.46
EBF4-210ENST00000609451 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP36.67■■■■□ 3.46
EBF4-210ENST00000609451 MAP3K1Q13233 1512 aa36.65■■■■□ 3.46
EBF4-210ENST00000609451 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP36.62■■■■□ 3.45
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