RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000536531.5

PLEKHG6-206, Transcript of pleckstrin homology and RhoGEF domain containing G6, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PLEKHG6, Length 1,683 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLEKHG6-206ENST00000536531 NISCHQ9Y2I1 1504 aa62.47■■■■■ 7.59
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PLEKHG6-206ENST00000536531 MYO15BQ96JP2 1530 aa51.56■■■■■ 5.84
PLEKHG6-206ENST00000536531 NACADO15069 1562 aa51.54■■■■■ 5.84
PLEKHG6-206ENST00000536531 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa51.34■■■■■ 5.81
PLEKHG6-206ENST00000536531 SCRIBQ14160 1630 aa50.34■■■■■ 5.65
PLEKHG6-206ENST00000536531 UNC13AQ9UPW8 1703 aa50.1■■■■■ 5.61
PLEKHG6-206ENST00000536531 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa49.99■■■■■ 5.59
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PLEKHG6-206ENST00000536531 MROH2BQ7Z745 1585 aa48.19■■■■■ 5.31
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PLEKHG6-206ENST00000536531 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa47.97■■■■■ 5.27
PLEKHG6-206ENST00000536531 DNAJC5BQ9UF47 199 aa47.96■■■■■ 5.27
PLEKHG6-206ENST00000536531 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa47.8■■■■■ 5.24
PLEKHG6-206ENST00000536531 PEG3Q9GZU2 1588 aa47.75■■■■■ 5.23
PLEKHG6-206ENST00000536531 SMARCA2P51531 1590 aa47.7■■■■■ 5.23
PLEKHG6-206ENST00000536531 WIZO95785 1651 aa47.65■■■■■ 5.22
PLEKHG6-206ENST00000536531 NCAPD3P42695 1498 aa47.62■■■■■ 5.21
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PLEKHG6-206ENST00000536531 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa46.13■■■■■ 4.98
PLEKHG6-206ENST00000536531 PDS5BQ9NTI5 1447 aa45.84■■■■■ 4.93
PLEKHG6-206ENST00000536531 FANCD2Q9BXW9 1451 aa45.74■■■■■ 4.91
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PLEKHG6-206ENST00000536531 CEP164Q9UPV0 1460 aa45.56■■■■■ 4.88
PLEKHG6-206ENST00000536531 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa45.54■■■■■ 4.88
PLEKHG6-206ENST00000536531 MRC2Q9UBG0 1479 aa45.31■■■■■ 4.84
PLEKHG6-206ENST00000536531 ABCC8Q09428 1581 aa45.27■■■■■ 4.84
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PLEKHG6-206ENST00000536531 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP45.22■■■■■ 4.83
PLEKHG6-206ENST00000536531 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP45.2■■■■■ 4.83
PLEKHG6-206ENST00000536531 CUX1P39880 1505 aa45.14■■■■■ 4.82
PLEKHG6-206ENST00000536531 WDR62O43379 1518 aa45.12■■■■■ 4.81
PLEKHG6-206ENST00000536531 TOPBP1Q92547 1522 aa45.12■■■■■ 4.81
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PLEKHG6-206ENST00000536531 SYNJ1O43426 1573 aa45.01■■■■■ 4.8
PLEKHG6-206ENST00000536531 TOP2BQ02880 1626 aa44.94■■■■■ 4.78
PLEKHG6-206ENST00000536531 CHIC1Q5VXU3 224 aa44.93■■■■■ 4.78
PLEKHG6-206ENST00000536531 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa44.89■■■■■ 4.78
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PLEKHG6-206ENST00000536531 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP44.81■■■■■ 4.76
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PLEKHG6-206ENST00000536531 CUX2O14529 1486 aa44.77■■■■■ 4.76
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PLEKHG6-206ENST00000536531 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa44.63■■■■■ 4.74
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PLEKHG6-206ENST00000536531 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP44.31■■■■■ 4.68
PLEKHG6-206ENST00000536531 WDR97A6NE52 1622 aa44.31■■■■■ 4.68
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PLEKHG6-206ENST00000536531 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa44.12■■■■■ 4.65
PLEKHG6-206ENST00000536531 GAPVD1Q14C86 1478 aa44.12■■■■■ 4.65
PLEKHG6-206ENST00000536531 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP44.12■■■■■ 4.65
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PLEKHG6-206ENST00000536531 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP43.53■■■■■ 4.56
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PLEKHG6-206ENST00000536531 CHD1O14646 1710 aa43.31■■■■■ 4.52
PLEKHG6-206ENST00000536531 EHMT2Q96KQ7 1210 aa43.26■■■■■ 4.52
PLEKHG6-206ENST00000536531 GOLGA3Q08378 1498 aa43.23■■■■■ 4.51
PLEKHG6-206ENST00000536531 NUP160Q12769 1436 aa43.22■■■■■ 4.51
PLEKHG6-206ENST00000536531 CEP170Q5SW79 1584 aa43.16■■■■■ 4.5
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PLEKHG6-206ENST00000536531 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa43.11■■■■■ 4.49
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