RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000250974.9

ABHD17A-201, Transcript of abhydrolase domain containing 17A, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ABHD17A, Length 1,630 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABHD17A-201ENST00000250974 NISCHQ9Y2I1 1504 aa63.45■■■■■ 7.75
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ABHD17A-201ENST00000250974 MYO15BQ96JP2 1530 aa52.35■■■■■ 5.97
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ABHD17A-201ENST00000250974 SCRIBQ14160 1630 aa51.08■■■■■ 5.77
ABHD17A-201ENST00000250974 UNC13AQ9UPW8 1703 aa50.95■■■■■ 5.75
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ABHD17A-201ENST00000250974 SMARCA4P51532 1647 aa49■■■■■ 5.43
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ABHD17A-201ENST00000250974 WIZO95785 1651 aa48.49■■■■■ 5.35
ABHD17A-201ENST00000250974 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa48.49■■■■■ 5.35
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ABHD17A-201ENST00000250974 SMARCA2P51531 1590 aa48.41■■■■■ 5.34
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ABHD17A-201ENST00000250974 NCAPD3P42695 1498 aa48.19■■■■■ 5.31
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ABHD17A-201ENST00000250974 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa46.75■■■■■ 5.07
ABHD17A-201ENST00000250974 PRDM2Q13029 1718 aa46.67■■■■■ 5.06
ABHD17A-201ENST00000250974 NESP48681 1621 aa46.67■■■■■ 5.06
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ABHD17A-201ENST00000250974 CEP164Q9UPV0 1460 aa46.13■■■■■ 4.98
ABHD17A-201ENST00000250974 ABCC8Q09428 1581 aa46.09■■■■■ 4.97
ABHD17A-201ENST00000250974 ERCC6Q03468 1493 aa46.01■■■■■ 4.96
ABHD17A-201ENST00000250974 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP45.97■■■■■ 4.955e-7■■□□□ 14.1
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ABHD17A-201ENST00000250974 CUX1P39880 1505 aa45.83■■■■■ 4.93
ABHD17A-201ENST00000250974 MRC2Q9UBG0 1479 aa45.81■■■■■ 4.92
ABHD17A-201ENST00000250974 SYNJ1O43426 1573 aa45.81■■■■■ 4.92
ABHD17A-201ENST00000250974 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP45.78■■■■■ 4.92
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ABHD17A-201ENST00000250974 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa45.77■■■■■ 4.92
ABHD17A-201ENST00000250974 TRIM41Q8WV44 630 aa45.72■■■■■ 4.91
ABHD17A-201ENST00000250974 TOPBP1Q92547 1522 aa45.72■■■■■ 4.91
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ABHD17A-201ENST00000250974 CUX2O14529 1486 aa45.23■■■■■ 4.83
ABHD17A-201ENST00000250974 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa45.19■■■■■ 4.82
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ABHD17A-201ENST00000250974 IFT140Q96RY7 1462 aa45.12■■■■■ 4.81
ABHD17A-201ENST00000250974 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa45.1■■■■■ 4.81
ABHD17A-201ENST00000250974 WDR97A6NE52 1622 aa45.09■■■■■ 4.81
ABHD17A-201ENST00000250974 KIF27Q86VH2 1401 aa44.91■■■■■ 4.78
ABHD17A-201ENST00000250974 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa44.89■■■■■ 4.78
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ABHD17A-201ENST00000250974 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP44.82■■■■■ 4.77
ABHD17A-201ENST00000250974 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa44.82■■■■■ 4.77
ABHD17A-201ENST00000250974 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP44.81■■■■■ 4.76
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ABHD17A-201ENST00000250974 PBRM1Q86U86 1689 aa44.62■■■■■ 4.73
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ABHD17A-201ENST00000250974 KIF21BO75037 1637 aa44.33■■■■■ 4.69
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ABHD17A-201ENST00000250974 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP44.01■■■■■ 4.64
ABHD17A-201ENST00000250974 GRIN2AQ12879 1464 aa44■■■■■ 4.63
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