RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000309340.11

MKNK2-202, Transcript of MAP kinase interacting serine/threonine kinase 2, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene MKNK2, Length 1,744 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKNK2-202ENST00000309340 NISCHQ9Y2I1 1504 aa60.4■■■■■ 7.26
MKNK2-202ENST00000309340 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa53.08■■■■■ 6.09
MKNK2-202ENST00000309340 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP50.68■■■■■ 5.7
MKNK2-202ENST00000309340 ABCC9O60706 1549 aa50.27■■■■■ 5.64
MKNK2-202ENST00000309340 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa50.06■■■■■ 5.6
MKNK2-202ENST00000309340 DCAF8L2P0C7V8 631 aa49.71■■■■■ 5.55
MKNK2-202ENST00000309340 MYO15BQ96JP2 1530 aa49.65■■■■■ 5.54
MKNK2-202ENST00000309340 NACADO15069 1562 aa49.43■■■■■ 5.5
MKNK2-202ENST00000309340 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.11■■■■■ 5.45
MKNK2-202ENST00000309340 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa48.71■■■■■ 5.39
MKNK2-202ENST00000309340 SCRIBQ14160 1630 aa48.55■■■■■ 5.36
MKNK2-202ENST00000309340 UNC13AQ9UPW8 1703 aa48.17■■■■■ 5.3
MKNK2-202ENST00000309340 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.58■■■■■ 5.21
MKNK2-202ENST00000309340 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.19■■■■■ 5.14
MKNK2-202ENST00000309340 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.86■■■■■ 5.09
MKNK2-202ENST00000309340 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP46.73■■■■■ 5.07
MKNK2-202ENST00000309340 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP46.63■■■■■ 5.06
MKNK2-202ENST00000309340 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP46.61■■■■■ 5.05
MKNK2-202ENST00000309340 MROH2BQ7Z745 1585 aa46.59■■■■■ 5.05
MKNK2-202ENST00000309340 SMARCA4P51532 1647 aa46.58■■■■■ 5.05
MKNK2-202ENST00000309340 WIZO95785 1651 aa46.24■■■■■ 4.99
MKNK2-202ENST00000309340 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.18■■■■■ 4.98
MKNK2-202ENST00000309340 PEG3Q9GZU2 1588 aa46.08■■■■■ 4.97
MKNK2-202ENST00000309340 SMARCA2P51531 1590 aa45.9■■■■■ 4.94
MKNK2-202ENST00000309340 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.84■■■■■ 4.93
MKNK2-202ENST00000309340 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP45.8■■■■■ 4.92
MKNK2-202ENST00000309340 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.6■■■■■ 4.89
MKNK2-202ENST00000309340 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP45.57■■■■■ 4.89
MKNK2-202ENST00000309340 NCAPD3P42695 1498 aa45.54■■■■■ 4.88
MKNK2-202ENST00000309340 HMGXB3Q12766 1538 aa45.54■■■■■ 4.88
MKNK2-202ENST00000309340 CCDC88BA6NC98 1476 aa45.22■■■■■ 4.83
MKNK2-202ENST00000309340 DNAJC5BQ9UF47 199 aa44.57■■■■■ 4.73
MKNK2-202ENST00000309340 CHIC1Q5VXU3 224 aa44.47■■■■■ 4.71
MKNK2-202ENST00000309340 PRDM2Q13029 1718 aa44.41■■■■■ 4.7
MKNK2-202ENST00000309340 CFTRP13569 1480 aa44.4■■■■■ 4.7
MKNK2-202ENST00000309340 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.29■■■■■ 4.68
MKNK2-202ENST00000309340 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.16■■■■■ 4.66
MKNK2-202ENST00000309340 ABCC8Q09428 1581 aa44.12■■■■■ 4.65
MKNK2-202ENST00000309340 NESP48681 1621 aa43.99■■■■■ 4.63
MKNK2-202ENST00000309340 TRIM41Q8WV44 630 aa43.96■■■■■ 4.63
MKNK2-202ENST00000309340 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP43.91■■■■■ 4.62
MKNK2-202ENST00000309340 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.83■■■■■ 4.61
MKNK2-202ENST00000309340 SYNJ1O43426 1573 aa43.79■■■■■ 4.6
MKNK2-202ENST00000309340 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.73■■■■■ 4.59
MKNK2-202ENST00000309340 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa43.72■■■■■ 4.59
MKNK2-202ENST00000309340 TOP2BQ02880 1626 aa43.71■■■■■ 4.59
MKNK2-202ENST00000309340 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.64■■■■■ 4.58
MKNK2-202ENST00000309340 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.64■■■■■ 4.58
MKNK2-202ENST00000309340 CUX1P39880 1505 aa43.62■■■■■ 4.57
MKNK2-202ENST00000309340 DNMBPQ6XZF7 1577 aa43.45■■■■■ 4.55
MKNK2-202ENST00000309340 TOPBP1Q92547 1522 aa43.33■■■■■ 4.53
MKNK2-202ENST00000309340 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP43.3■■■■■ 4.52
MKNK2-202ENST00000309340 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.22■■■■■ 4.51
MKNK2-202ENST00000309340 FGD5Q6ZNL6 1462 aa43.2■■■■■ 4.51
MKNK2-202ENST00000309340 ERCC6Q03468 1493 aa43.2■■■■■ 4.51
MKNK2-202ENST00000309340 SOGA1O94964 1423 aa43.14■■■■■ 4.5
MKNK2-202ENST00000309340 EEA1Q15075 1411 aa43.14■■■■■ 4.5
MKNK2-202ENST00000309340 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP43.07■■■■■ 4.49
MKNK2-202ENST00000309340 WDR62O43379 1518 aa43.05■■■■■ 4.48
MKNK2-202ENST00000309340 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.04■■■■■ 4.48
MKNK2-202ENST00000309340 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP43.02■■■■■ 4.48
MKNK2-202ENST00000309340 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa42.99■■■■■ 4.47
MKNK2-202ENST00000309340 WDR97A6NE52 1622 aa42.88■■■■■ 4.45
MKNK2-202ENST00000309340 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.86■■■■■ 4.45
MKNK2-202ENST00000309340 KIF27Q86VH2 1401 aa42.86■■■■■ 4.45
MKNK2-202ENST00000309340 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.84■■■■■ 4.45
MKNK2-202ENST00000309340 CUX2O14529 1486 aa42.81■■■■■ 4.44
MKNK2-202ENST00000309340 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.78■■■■■ 4.44
MKNK2-202ENST00000309340 CSRNP3Q8WYN3 585 aa42.77■■■■■ 4.44
MKNK2-202ENST00000309340 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa42.66■■■■■ 4.42
MKNK2-202ENST00000309340 KIF21BO75037 1637 aa42.64■■■■■ 4.42
MKNK2-202ENST00000309340 IFT140Q96RY7 1462 aa42.62■■■■■ 4.41
MKNK2-202ENST00000309340 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.61■■■■■ 4.41
MKNK2-202ENST00000309340 GOLGA3Q08378 1498 aa42.47■■■■■ 4.39
MKNK2-202ENST00000309340 PRXQ9BXM0 1461 aa42.46■■■■■ 4.39
MKNK2-202ENST00000309340 IGF1RP08069 1367 aa42.45■■■■■ 4.39
MKNK2-202ENST00000309340 GAPVD1Q14C86 1478 aa42.44■■■■■ 4.38
MKNK2-202ENST00000309340 ERICH3Q5RHP9 1530 aa42.44■■■■■ 4.38
MKNK2-202ENST00000309340 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.42■■■■■ 4.38
MKNK2-202ENST00000309340 CUL7Q14999 1698 aa42.39■■■■■ 4.38
MKNK2-202ENST00000309340 PBRM1Q86U86 1689 aa42.38■■■■■ 4.38
MKNK2-202ENST00000309340 EHMT2Q96KQ7 1210 aa42.34■■■■■ 4.37
MKNK2-202ENST00000309340 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa42.33■■■■■ 4.37
MKNK2-202ENST00000309340 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.31■■■■■ 4.36
MKNK2-202ENST00000309340 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.3■■■■■ 4.36
MKNK2-202ENST00000309340 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.26■■■■■ 4.366e-7■■■■□ 26.1
MKNK2-202ENST00000309340 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa42.24■■■■■ 4.35
MKNK2-202ENST00000309340 TNIKQ9UKE5 1360 aa42.21■■■■■ 4.35
MKNK2-202ENST00000309340 GRIN2BQ13224 1484 aa42.2■■■■■ 4.35
MKNK2-202ENST00000309340 UBTFP17480 764 aaKnown RBP42.15■■■■■ 4.34
MKNK2-202ENST00000309340 ADAMTS12P58397 1594 aa42.08■■■■■ 4.33
MKNK2-202ENST00000309340 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.99■■■■■ 4.31
MKNK2-202ENST00000309340 CEP162Q5TB80 1403 aa41.95■■■■■ 4.31
MKNK2-202ENST00000309340 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.94■■■■■ 4.3
MKNK2-202ENST00000309340 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.94■■■■■ 4.3
MKNK2-202ENST00000309340 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa41.88■■■■■ 4.29
MKNK2-202ENST00000309340 SYNJ2O15056 1496 aa41.74■■■■■ 4.27
MKNK2-202ENST00000309340 CLIP1P30622 1438 aa41.73■■■■■ 4.27
MKNK2-202ENST00000309340 GRIN2AQ12879 1464 aa41.69■■■■■ 4.26
MKNK2-202ENST00000309340 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.52■■■■■ 4.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8 ms