RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376726.3

ACSS1-202, Transcript of acyl-CoA synthetase short chain family member 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene ACSS1, Length 2,244 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSS1-202ENST00000376726 NISCHQ9Y2I1 1504 aa52.87■■■■■ 6.05
ACSS1-202ENST00000376726 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa45.56■■■■■ 4.88
ACSS1-202ENST00000376726 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP44.59■■■■■ 4.73
ACSS1-202ENST00000376726 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa44.03■■■■■ 4.64
ACSS1-202ENST00000376726 DCAF8L2P0C7V8 631 aa43.63■■■■■ 4.57
ACSS1-202ENST00000376726 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa43.59■■■■■ 4.57
ACSS1-202ENST00000376726 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.79■■■■■ 4.44
ACSS1-202ENST00000376726 MYO15BQ96JP2 1530 aa42.7■■■■■ 4.43
ACSS1-202ENST00000376726 ABCC9O60706 1549 aa42.53■■■■■ 4.4
ACSS1-202ENST00000376726 NACADO15069 1562 aa42.25■■■■■ 4.35
ACSS1-202ENST00000376726 SCRIBQ14160 1630 aa42.24■■■■■ 4.35
ACSS1-202ENST00000376726 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa41.7■■■■■ 4.27
ACSS1-202ENST00000376726 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP41.42■■■■■ 4.22
ACSS1-202ENST00000376726 CHIC1Q5VXU3 224 aa41.36■■■■■ 4.21
ACSS1-202ENST00000376726 CECR2Q9BXF3 1484 aa41.14■■■■■ 4.18
ACSS1-202ENST00000376726 UNC13AQ9UPW8 1703 aa41.02■■■■■ 4.16
ACSS1-202ENST00000376726 MROH2BQ7Z745 1585 aa40.97■■■■■ 4.15
ACSS1-202ENST00000376726 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP40.72■■■■■ 4.11
ACSS1-202ENST00000376726 WIZO95785 1651 aa40.7■■■■■ 4.11
ACSS1-202ENST00000376726 BICRAQ9NZM4 1560 aa40.53■■■■■ 4.08
ACSS1-202ENST00000376726 SMARCA4P51532 1647 aa40.46■■■■■ 4.07
ACSS1-202ENST00000376726 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP40.37■■■■■ 4.05
ACSS1-202ENST00000376726 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP40.18■■■■■ 4.02
ACSS1-202ENST00000376726 TRIM41Q8WV44 630 aa40.07■■■■■ 4.01
ACSS1-202ENST00000376726 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa39.93■■■■□ 3.98
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ACSS1-202ENST00000376726 SMARCA2P51531 1590 aa39.89■■■■□ 3.98
ACSS1-202ENST00000376726 CCDC88BA6NC98 1476 aa39.88■■■■□ 3.97
ACSS1-202ENST00000376726 PEG3Q9GZU2 1588 aa39.85■■■■□ 3.97
ACSS1-202ENST00000376726 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa39.58■■■■□ 3.93
ACSS1-202ENST00000376726 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP39.5■■■■□ 3.91
ACSS1-202ENST00000376726 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP39.41■■■■□ 3.9
ACSS1-202ENST00000376726 ABCC8Q09428 1581 aa39.4■■■■□ 3.9
ACSS1-202ENST00000376726 PCGF6Q9BYE7 350 aa39.09■■■■□ 3.85
ACSS1-202ENST00000376726 NCAPD3P42695 1498 aa39.04■■■■□ 3.84
ACSS1-202ENST00000376726 EHMT2Q96KQ7 1210 aa39.02■■■■□ 3.84
ACSS1-202ENST00000376726 HMGXB3Q12766 1538 aa39.02■■■■□ 3.84
ACSS1-202ENST00000376726 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38.94■■■■□ 3.82
ACSS1-202ENST00000376726 HRCP23327 699 aa38.89■■■■□ 3.82
ACSS1-202ENST00000376726 SOGA1O94964 1423 aa38.85■■■■□ 3.81
ACSS1-202ENST00000376726 SYNJ1O43426 1573 aa38.79■■■■□ 3.8
ACSS1-202ENST00000376726 EEA1Q15075 1411 aa38.75■■■■□ 3.79
ACSS1-202ENST00000376726 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP38.69■■■■□ 3.78
ACSS1-202ENST00000376726 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa38.68■■■■□ 3.78
ACSS1-202ENST00000376726 CSRNP3Q8WYN3 585 aa38.6■■■■□ 3.77
ACSS1-202ENST00000376726 TOP2BQ02880 1626 aa38.48■■■■□ 3.75
ACSS1-202ENST00000376726 CFTRP13569 1480 aa38.45■■■■□ 3.75
ACSS1-202ENST00000376726 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa38.44■■■■□ 3.74
ACSS1-202ENST00000376726 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa38.41■■■■□ 3.74
ACSS1-202ENST00000376726 TNIKQ9UKE5 1360 aa38.41■■■■□ 3.74
ACSS1-202ENST00000376726 GOLGA3Q08378 1498 aa38.34■■■■□ 3.73
ACSS1-202ENST00000376726 CEP162Q5TB80 1403 aa38.32■■■■□ 3.72
ACSS1-202ENST00000376726 KIF21BO75037 1637 aa38.25■■■■□ 3.71
ACSS1-202ENST00000376726 PRDM2Q13029 1718 aa38.25■■■■□ 3.71
ACSS1-202ENST00000376726 UBTFP17480 764 aaKnown RBP38.24■■■■□ 3.71
ACSS1-202ENST00000376726 CEP164Q9UPV0 1460 aa38.24■■■■□ 3.71
ACSS1-202ENST00000376726 CUX1P39880 1505 aa38.22■■■■□ 3.71
ACSS1-202ENST00000376726 CADPSQ9ULU8 1353 aa38.15■■■■□ 3.7
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ACSS1-202ENST00000376726 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa37.99■■■■□ 3.67
ACSS1-202ENST00000376726 KIF27Q86VH2 1401 aa37.85■■■■□ 3.65
ACSS1-202ENST00000376726 PRXQ9BXM0 1461 aa37.83■■■■□ 3.65
ACSS1-202ENST00000376726 ERICH3Q5RHP9 1530 aa37.81■■■■□ 3.64
ACSS1-202ENST00000376726 CLIP1P30622 1438 aa37.8■■■■□ 3.64
ACSS1-202ENST00000376726 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.75■■■■□ 3.63
ACSS1-202ENST00000376726 FGD5Q6ZNL6 1462 aa37.66■■■■□ 3.62
ACSS1-202ENST00000376726 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP37.64■■■■□ 3.62
ACSS1-202ENST00000376726 NESP48681 1621 aa37.64■■■■□ 3.62
ACSS1-202ENST00000376726 CUX2O14529 1486 aa37.6■■■■□ 3.61
ACSS1-202ENST00000376726 VPS8Q8N3P4 1428 aa37.57■■■■□ 3.61
ACSS1-202ENST00000376726 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP37.57■■■■□ 3.6
ACSS1-202ENST00000376726 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.54■■■■□ 3.6
ACSS1-202ENST00000376726 DNMBPQ6XZF7 1577 aa37.52■■■■□ 3.6
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ACSS1-202ENST00000376726 TOPBP1Q92547 1522 aa37.44■■■■□ 3.58
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ACSS1-202ENST00000376726 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa37.29■■■■□ 3.56
ACSS1-202ENST00000376726 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa37.29■■■■□ 3.56
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ACSS1-202ENST00000376726 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP37.25■■■■□ 3.55
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ACSS1-202ENST00000376726 WDR97A6NE52 1622 aa37.08■■■■□ 3.53
ACSS1-202ENST00000376726 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP37.06■■■■□ 3.52
ACSS1-202ENST00000376726 CUL7Q14999 1698 aa37■■■■□ 3.51
ACSS1-202ENST00000376726 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa36.92■■■■□ 3.5
ACSS1-202ENST00000376726 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP36.87■■■■□ 3.49
ACSS1-202ENST00000376726 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36.87■■■■□ 3.49
ACSS1-202ENST00000376726 GAPVD1Q14C86 1478 aa36.82■■■■□ 3.49
ACSS1-202ENST00000376726 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP36.81■■■■□ 3.48
ACSS1-202ENST00000376726 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP36.8■■■■□ 3.48
ACSS1-202ENST00000376726 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa36.77■■■■□ 3.48
ACSS1-202ENST00000376726 MRC2Q9UBG0 1479 aa36.73■■■■□ 3.47
ACSS1-202ENST00000376726 MAP3K1Q13233 1512 aa36.67■■■■□ 3.46
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