Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZQ6

EDEM3, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDEM3Q9BZQ6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
EDEM3Q9BZQ6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
EDEM3Q9BZQ6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
EDEM3Q9BZQ6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
EDEM3Q9BZQ6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
EDEM3Q9BZQ6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
EDEM3Q9BZQ6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
EDEM3Q9BZQ6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
EDEM3Q9BZQ6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
EDEM3Q9BZQ6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
EDEM3Q9BZQ6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
EDEM3Q9BZQ6 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
EDEM3Q9BZQ6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
EDEM3Q9BZQ6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
EDEM3Q9BZQ6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
EDEM3Q9BZQ6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
EDEM3Q9BZQ6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
EDEM3Q9BZQ6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
EDEM3Q9BZQ6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
EDEM3Q9BZQ6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
EDEM3Q9BZQ6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
EDEM3Q9BZQ6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
EDEM3Q9BZQ6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
EDEM3Q9BZQ6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
EDEM3Q9BZQ6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
EDEM3Q9BZQ6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
EDEM3Q9BZQ6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
EDEM3Q9BZQ6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
EDEM3Q9BZQ6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
EDEM3Q9BZQ6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
EDEM3Q9BZQ6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
EDEM3Q9BZQ6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
EDEM3Q9BZQ6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
EDEM3Q9BZQ6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
EDEM3Q9BZQ6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
EDEM3Q9BZQ6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
EDEM3Q9BZQ6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
EDEM3Q9BZQ6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
EDEM3Q9BZQ6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
EDEM3Q9BZQ6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
EDEM3Q9BZQ6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
EDEM3Q9BZQ6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
EDEM3Q9BZQ6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
EDEM3Q9BZQ6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
EDEM3Q9BZQ6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
EDEM3Q9BZQ6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
EDEM3Q9BZQ6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
EDEM3Q9BZQ6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
EDEM3Q9BZQ6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
EDEM3Q9BZQ6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
EDEM3Q9BZQ6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
EDEM3Q9BZQ6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
EDEM3Q9BZQ6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
EDEM3Q9BZQ6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
EDEM3Q9BZQ6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
EDEM3Q9BZQ6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
EDEM3Q9BZQ6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
EDEM3Q9BZQ6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
EDEM3Q9BZQ6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
EDEM3Q9BZQ6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
EDEM3Q9BZQ6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
EDEM3Q9BZQ6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
EDEM3Q9BZQ6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
EDEM3Q9BZQ6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
EDEM3Q9BZQ6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
EDEM3Q9BZQ6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.54■■■□□ 2
EDEM3Q9BZQ6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
EDEM3Q9BZQ6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
EDEM3Q9BZQ6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
EDEM3Q9BZQ6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
EDEM3Q9BZQ6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
EDEM3Q9BZQ6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.52■■■□□ 2
EDEM3Q9BZQ6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
EDEM3Q9BZQ6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
EDEM3Q9BZQ6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.52■■■□□ 2
EDEM3Q9BZQ6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
EDEM3Q9BZQ6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
EDEM3Q9BZQ6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
EDEM3Q9BZQ6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
EDEM3Q9BZQ6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.52■■■□□ 2
EDEM3Q9BZQ6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
EDEM3Q9BZQ6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
EDEM3Q9BZQ6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
EDEM3Q9BZQ6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
EDEM3Q9BZQ6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
EDEM3Q9BZQ6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
EDEM3Q9BZQ6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
EDEM3Q9BZQ6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
EDEM3Q9BZQ6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
EDEM3Q9BZQ6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
EDEM3Q9BZQ6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
EDEM3Q9BZQ6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
EDEM3Q9BZQ6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
EDEM3Q9BZQ6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
EDEM3Q9BZQ6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
EDEM3Q9BZQ6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
EDEM3Q9BZQ6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
EDEM3Q9BZQ6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
EDEM3Q9BZQ6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
EDEM3Q9BZQ6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms