Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWX5

GATA5, Transcription factor GATA-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA5Q9BWX5 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
GATA5Q9BWX5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GATA5Q9BWX5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GATA5Q9BWX5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GATA5Q9BWX5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GATA5Q9BWX5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GATA5Q9BWX5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GATA5Q9BWX5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GATA5Q9BWX5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GATA5Q9BWX5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GATA5Q9BWX5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GATA5Q9BWX5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GATA5Q9BWX5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
GATA5Q9BWX5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GATA5Q9BWX5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GATA5Q9BWX5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GATA5Q9BWX5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GATA5Q9BWX5 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GATA5Q9BWX5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GATA5Q9BWX5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GATA5Q9BWX5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
GATA5Q9BWX5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GATA5Q9BWX5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GATA5Q9BWX5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GATA5Q9BWX5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GATA5Q9BWX5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GATA5Q9BWX5 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GATA5Q9BWX5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GATA5Q9BWX5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GATA5Q9BWX5 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GATA5Q9BWX5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GATA5Q9BWX5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GATA5Q9BWX5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GATA5Q9BWX5 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
GATA5Q9BWX5 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GATA5Q9BWX5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
GATA5Q9BWX5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GATA5Q9BWX5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GATA5Q9BWX5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GATA5Q9BWX5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GATA5Q9BWX5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GATA5Q9BWX5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GATA5Q9BWX5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GATA5Q9BWX5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GATA5Q9BWX5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GATA5Q9BWX5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GATA5Q9BWX5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GATA5Q9BWX5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GATA5Q9BWX5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GATA5Q9BWX5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GATA5Q9BWX5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GATA5Q9BWX5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GATA5Q9BWX5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GATA5Q9BWX5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GATA5Q9BWX5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GATA5Q9BWX5 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GATA5Q9BWX5 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
GATA5Q9BWX5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GATA5Q9BWX5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GATA5Q9BWX5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GATA5Q9BWX5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GATA5Q9BWX5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GATA5Q9BWX5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GATA5Q9BWX5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GATA5Q9BWX5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GATA5Q9BWX5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GATA5Q9BWX5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GATA5Q9BWX5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GATA5Q9BWX5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GATA5Q9BWX5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GATA5Q9BWX5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GATA5Q9BWX5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GATA5Q9BWX5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GATA5Q9BWX5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
GATA5Q9BWX5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GATA5Q9BWX5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GATA5Q9BWX5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GATA5Q9BWX5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
GATA5Q9BWX5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GATA5Q9BWX5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GATA5Q9BWX5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GATA5Q9BWX5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GATA5Q9BWX5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GATA5Q9BWX5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GATA5Q9BWX5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GATA5Q9BWX5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GATA5Q9BWX5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GATA5Q9BWX5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GATA5Q9BWX5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GATA5Q9BWX5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GATA5Q9BWX5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GATA5Q9BWX5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GATA5Q9BWX5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GATA5Q9BWX5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
GATA5Q9BWX5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GATA5Q9BWX5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GATA5Q9BWX5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GATA5Q9BWX5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GATA5Q9BWX5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GATA5Q9BWX5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms