Protein–RNA interactions for Protein: Q96EE4

CCDC126, Coiled-coil domain-containing protein 126, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC126Q96EE4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC126Q96EE4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC126Q96EE4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC126Q96EE4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC126Q96EE4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC126Q96EE4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC126Q96EE4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC126Q96EE4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC126Q96EE4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC126Q96EE4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC126Q96EE4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC126Q96EE4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC126Q96EE4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC126Q96EE4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC126Q96EE4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC126Q96EE4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC126Q96EE4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC126Q96EE4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC126Q96EE4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC126Q96EE4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC126Q96EE4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC126Q96EE4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC126Q96EE4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC126Q96EE4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC126Q96EE4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC126Q96EE4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC126Q96EE4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC126Q96EE4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC126Q96EE4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC126Q96EE4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC126Q96EE4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC126Q96EE4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC126Q96EE4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC126Q96EE4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC126Q96EE4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC126Q96EE4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC126Q96EE4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC126Q96EE4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC126Q96EE4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC126Q96EE4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC126Q96EE4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC126Q96EE4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC126Q96EE4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC126Q96EE4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC126Q96EE4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC126Q96EE4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC126Q96EE4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC126Q96EE4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC126Q96EE4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC126Q96EE4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC126Q96EE4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC126Q96EE4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC126Q96EE4 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC126Q96EE4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC126Q96EE4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC126Q96EE4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC126Q96EE4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC126Q96EE4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC126Q96EE4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC126Q96EE4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC126Q96EE4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC126Q96EE4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC126Q96EE4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC126Q96EE4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC126Q96EE4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC126Q96EE4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC126Q96EE4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC126Q96EE4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC126Q96EE4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC126Q96EE4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC126Q96EE4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC126Q96EE4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC126Q96EE4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC126Q96EE4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC126Q96EE4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC126Q96EE4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC126Q96EE4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC126Q96EE4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC126Q96EE4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC126Q96EE4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC126Q96EE4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC126Q96EE4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC126Q96EE4 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC126Q96EE4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC126Q96EE4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC126Q96EE4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC126Q96EE4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC126Q96EE4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC126Q96EE4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC126Q96EE4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC126Q96EE4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC126Q96EE4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC126Q96EE4 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC126Q96EE4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC126Q96EE4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC126Q96EE4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC126Q96EE4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC126Q96EE4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC126Q96EE4 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC126Q96EE4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms