Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVJ9

TWIST2, Twist-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST2Q8WVJ9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TWIST2Q8WVJ9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TWIST2Q8WVJ9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TWIST2Q8WVJ9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TWIST2Q8WVJ9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TWIST2Q8WVJ9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TWIST2Q8WVJ9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TWIST2Q8WVJ9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TWIST2Q8WVJ9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TWIST2Q8WVJ9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TWIST2Q8WVJ9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TWIST2Q8WVJ9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TWIST2Q8WVJ9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TWIST2Q8WVJ9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TWIST2Q8WVJ9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TWIST2Q8WVJ9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TWIST2Q8WVJ9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TWIST2Q8WVJ9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TWIST2Q8WVJ9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TWIST2Q8WVJ9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TWIST2Q8WVJ9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TWIST2Q8WVJ9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TWIST2Q8WVJ9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TWIST2Q8WVJ9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TWIST2Q8WVJ9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TWIST2Q8WVJ9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TWIST2Q8WVJ9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TWIST2Q8WVJ9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TWIST2Q8WVJ9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TWIST2Q8WVJ9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TWIST2Q8WVJ9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TWIST2Q8WVJ9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TWIST2Q8WVJ9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TWIST2Q8WVJ9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TWIST2Q8WVJ9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TWIST2Q8WVJ9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TWIST2Q8WVJ9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TWIST2Q8WVJ9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TWIST2Q8WVJ9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TWIST2Q8WVJ9 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TWIST2Q8WVJ9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TWIST2Q8WVJ9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TWIST2Q8WVJ9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TWIST2Q8WVJ9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TWIST2Q8WVJ9 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TWIST2Q8WVJ9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TWIST2Q8WVJ9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TWIST2Q8WVJ9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TWIST2Q8WVJ9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TWIST2Q8WVJ9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TWIST2Q8WVJ9 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TWIST2Q8WVJ9 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TWIST2Q8WVJ9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TWIST2Q8WVJ9 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TWIST2Q8WVJ9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TWIST2Q8WVJ9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TWIST2Q8WVJ9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TWIST2Q8WVJ9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TWIST2Q8WVJ9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TWIST2Q8WVJ9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TWIST2Q8WVJ9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TWIST2Q8WVJ9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TWIST2Q8WVJ9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TWIST2Q8WVJ9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TWIST2Q8WVJ9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TWIST2Q8WVJ9 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TWIST2Q8WVJ9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TWIST2Q8WVJ9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TWIST2Q8WVJ9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TWIST2Q8WVJ9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TWIST2Q8WVJ9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TWIST2Q8WVJ9 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TWIST2Q8WVJ9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TWIST2Q8WVJ9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TWIST2Q8WVJ9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TWIST2Q8WVJ9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TWIST2Q8WVJ9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TWIST2Q8WVJ9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TWIST2Q8WVJ9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TWIST2Q8WVJ9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TWIST2Q8WVJ9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TWIST2Q8WVJ9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TWIST2Q8WVJ9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TWIST2Q8WVJ9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TWIST2Q8WVJ9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TWIST2Q8WVJ9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TWIST2Q8WVJ9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TWIST2Q8WVJ9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TWIST2Q8WVJ9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TWIST2Q8WVJ9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TWIST2Q8WVJ9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TWIST2Q8WVJ9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TWIST2Q8WVJ9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TWIST2Q8WVJ9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TWIST2Q8WVJ9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TWIST2Q8WVJ9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TWIST2Q8WVJ9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TWIST2Q8WVJ9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TWIST2Q8WVJ9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TWIST2Q8WVJ9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 199.6 ms