Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V2

TRIML1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIML1, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIML1Q8N9V2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRIML1Q8N9V2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRIML1Q8N9V2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
TRIML1Q8N9V2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRIML1Q8N9V2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRIML1Q8N9V2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRIML1Q8N9V2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRIML1Q8N9V2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRIML1Q8N9V2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRIML1Q8N9V2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRIML1Q8N9V2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRIML1Q8N9V2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRIML1Q8N9V2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRIML1Q8N9V2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRIML1Q8N9V2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRIML1Q8N9V2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRIML1Q8N9V2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRIML1Q8N9V2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
TRIML1Q8N9V2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRIML1Q8N9V2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
TRIML1Q8N9V2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRIML1Q8N9V2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRIML1Q8N9V2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRIML1Q8N9V2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRIML1Q8N9V2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRIML1Q8N9V2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRIML1Q8N9V2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRIML1Q8N9V2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRIML1Q8N9V2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRIML1Q8N9V2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRIML1Q8N9V2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRIML1Q8N9V2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRIML1Q8N9V2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRIML1Q8N9V2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRIML1Q8N9V2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRIML1Q8N9V2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRIML1Q8N9V2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRIML1Q8N9V2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRIML1Q8N9V2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRIML1Q8N9V2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
TRIML1Q8N9V2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRIML1Q8N9V2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRIML1Q8N9V2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRIML1Q8N9V2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRIML1Q8N9V2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRIML1Q8N9V2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRIML1Q8N9V2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRIML1Q8N9V2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
TRIML1Q8N9V2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRIML1Q8N9V2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRIML1Q8N9V2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRIML1Q8N9V2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
TRIML1Q8N9V2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TRIML1Q8N9V2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRIML1Q8N9V2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRIML1Q8N9V2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRIML1Q8N9V2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRIML1Q8N9V2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRIML1Q8N9V2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRIML1Q8N9V2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRIML1Q8N9V2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRIML1Q8N9V2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRIML1Q8N9V2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRIML1Q8N9V2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRIML1Q8N9V2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRIML1Q8N9V2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRIML1Q8N9V2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRIML1Q8N9V2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRIML1Q8N9V2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
TRIML1Q8N9V2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRIML1Q8N9V2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRIML1Q8N9V2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRIML1Q8N9V2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRIML1Q8N9V2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRIML1Q8N9V2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRIML1Q8N9V2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRIML1Q8N9V2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRIML1Q8N9V2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
TRIML1Q8N9V2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRIML1Q8N9V2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRIML1Q8N9V2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRIML1Q8N9V2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRIML1Q8N9V2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRIML1Q8N9V2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TRIML1Q8N9V2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
TRIML1Q8N9V2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TRIML1Q8N9V2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRIML1Q8N9V2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
TRIML1Q8N9V2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRIML1Q8N9V2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRIML1Q8N9V2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TRIML1Q8N9V2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRIML1Q8N9V2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRIML1Q8N9V2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRIML1Q8N9V2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TRIML1Q8N9V2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIML1Q8N9V2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIML1Q8N9V2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIML1Q8N9V2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TRIML1Q8N9V2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms