Protein–RNA interactions for Protein: Q86SE9

PCGF5, Polycomb group RING finger protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF5Q86SE9 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PCGF5Q86SE9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PCGF5Q86SE9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PCGF5Q86SE9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PCGF5Q86SE9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PCGF5Q86SE9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PCGF5Q86SE9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PCGF5Q86SE9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PCGF5Q86SE9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PCGF5Q86SE9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PCGF5Q86SE9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PCGF5Q86SE9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PCGF5Q86SE9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PCGF5Q86SE9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PCGF5Q86SE9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PCGF5Q86SE9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PCGF5Q86SE9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PCGF5Q86SE9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PCGF5Q86SE9 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PCGF5Q86SE9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PCGF5Q86SE9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PCGF5Q86SE9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PCGF5Q86SE9 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PCGF5Q86SE9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PCGF5Q86SE9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PCGF5Q86SE9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PCGF5Q86SE9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PCGF5Q86SE9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PCGF5Q86SE9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PCGF5Q86SE9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PCGF5Q86SE9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PCGF5Q86SE9 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PCGF5Q86SE9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PCGF5Q86SE9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PCGF5Q86SE9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PCGF5Q86SE9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PCGF5Q86SE9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PCGF5Q86SE9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PCGF5Q86SE9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PCGF5Q86SE9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PCGF5Q86SE9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PCGF5Q86SE9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PCGF5Q86SE9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PCGF5Q86SE9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PCGF5Q86SE9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PCGF5Q86SE9 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PCGF5Q86SE9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PCGF5Q86SE9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PCGF5Q86SE9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PCGF5Q86SE9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PCGF5Q86SE9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PCGF5Q86SE9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PCGF5Q86SE9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PCGF5Q86SE9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PCGF5Q86SE9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PCGF5Q86SE9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PCGF5Q86SE9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PCGF5Q86SE9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PCGF5Q86SE9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PCGF5Q86SE9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PCGF5Q86SE9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PCGF5Q86SE9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PCGF5Q86SE9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PCGF5Q86SE9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PCGF5Q86SE9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PCGF5Q86SE9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PCGF5Q86SE9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PCGF5Q86SE9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PCGF5Q86SE9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PCGF5Q86SE9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PCGF5Q86SE9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PCGF5Q86SE9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PCGF5Q86SE9 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PCGF5Q86SE9 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PCGF5Q86SE9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PCGF5Q86SE9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PCGF5Q86SE9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PCGF5Q86SE9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PCGF5Q86SE9 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PCGF5Q86SE9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PCGF5Q86SE9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PCGF5Q86SE9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PCGF5Q86SE9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PCGF5Q86SE9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PCGF5Q86SE9 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PCGF5Q86SE9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PCGF5Q86SE9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PCGF5Q86SE9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PCGF5Q86SE9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PCGF5Q86SE9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PCGF5Q86SE9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
PCGF5Q86SE9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PCGF5Q86SE9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PCGF5Q86SE9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PCGF5Q86SE9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PCGF5Q86SE9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCGF5Q86SE9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCGF5Q86SE9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCGF5Q86SE9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCGF5Q86SE9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms