Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT6

SSX6, Putative protein SSX6, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX6Q7RTT6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSX6Q7RTT6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SSX6Q7RTT6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSX6Q7RTT6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSX6Q7RTT6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSX6Q7RTT6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSX6Q7RTT6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SSX6Q7RTT6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSX6Q7RTT6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSX6Q7RTT6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSX6Q7RTT6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSX6Q7RTT6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSX6Q7RTT6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SSX6Q7RTT6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SSX6Q7RTT6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SSX6Q7RTT6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SSX6Q7RTT6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SSX6Q7RTT6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SSX6Q7RTT6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SSX6Q7RTT6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SSX6Q7RTT6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSX6Q7RTT6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSX6Q7RTT6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSX6Q7RTT6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSX6Q7RTT6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SSX6Q7RTT6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SSX6Q7RTT6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSX6Q7RTT6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSX6Q7RTT6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSX6Q7RTT6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSX6Q7RTT6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSX6Q7RTT6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SSX6Q7RTT6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSX6Q7RTT6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSX6Q7RTT6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSX6Q7RTT6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSX6Q7RTT6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SSX6Q7RTT6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSX6Q7RTT6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SSX6Q7RTT6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSX6Q7RTT6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SSX6Q7RTT6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSX6Q7RTT6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSX6Q7RTT6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSX6Q7RTT6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSX6Q7RTT6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SSX6Q7RTT6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSX6Q7RTT6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSX6Q7RTT6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSX6Q7RTT6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSX6Q7RTT6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSX6Q7RTT6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSX6Q7RTT6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSX6Q7RTT6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSX6Q7RTT6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSX6Q7RTT6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSX6Q7RTT6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSX6Q7RTT6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSX6Q7RTT6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSX6Q7RTT6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSX6Q7RTT6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSX6Q7RTT6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSX6Q7RTT6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSX6Q7RTT6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSX6Q7RTT6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SSX6Q7RTT6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SSX6Q7RTT6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SSX6Q7RTT6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SSX6Q7RTT6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SSX6Q7RTT6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SSX6Q7RTT6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SSX6Q7RTT6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SSX6Q7RTT6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SSX6Q7RTT6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SSX6Q7RTT6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSX6Q7RTT6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSX6Q7RTT6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSX6Q7RTT6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSX6Q7RTT6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSX6Q7RTT6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSX6Q7RTT6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSX6Q7RTT6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSX6Q7RTT6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSX6Q7RTT6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSX6Q7RTT6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSX6Q7RTT6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSX6Q7RTT6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSX6Q7RTT6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SSX6Q7RTT6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SSX6Q7RTT6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SSX6Q7RTT6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SSX6Q7RTT6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSX6Q7RTT6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSX6Q7RTT6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSX6Q7RTT6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSX6Q7RTT6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSX6Q7RTT6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSX6Q7RTT6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSX6Q7RTT6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSX6Q7RTT6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms