Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRZ4

C9orf47, Uncharacterized protein C9orf47, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf47Q6ZRZ4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C9orf47Q6ZRZ4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C9orf47Q6ZRZ4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C9orf47Q6ZRZ4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C9orf47Q6ZRZ4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C9orf47Q6ZRZ4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C9orf47Q6ZRZ4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
C9orf47Q6ZRZ4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C9orf47Q6ZRZ4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C9orf47Q6ZRZ4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C9orf47Q6ZRZ4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C9orf47Q6ZRZ4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C9orf47Q6ZRZ4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C9orf47Q6ZRZ4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C9orf47Q6ZRZ4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C9orf47Q6ZRZ4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C9orf47Q6ZRZ4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C9orf47Q6ZRZ4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C9orf47Q6ZRZ4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C9orf47Q6ZRZ4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C9orf47Q6ZRZ4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
C9orf47Q6ZRZ4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C9orf47Q6ZRZ4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C9orf47Q6ZRZ4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C9orf47Q6ZRZ4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C9orf47Q6ZRZ4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
C9orf47Q6ZRZ4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C9orf47Q6ZRZ4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C9orf47Q6ZRZ4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
C9orf47Q6ZRZ4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C9orf47Q6ZRZ4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C9orf47Q6ZRZ4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
C9orf47Q6ZRZ4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
C9orf47Q6ZRZ4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
C9orf47Q6ZRZ4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
C9orf47Q6ZRZ4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
C9orf47Q6ZRZ4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C9orf47Q6ZRZ4 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
C9orf47Q6ZRZ4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
C9orf47Q6ZRZ4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C9orf47Q6ZRZ4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C9orf47Q6ZRZ4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
C9orf47Q6ZRZ4 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
C9orf47Q6ZRZ4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C9orf47Q6ZRZ4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C9orf47Q6ZRZ4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C9orf47Q6ZRZ4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C9orf47Q6ZRZ4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C9orf47Q6ZRZ4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C9orf47Q6ZRZ4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
C9orf47Q6ZRZ4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C9orf47Q6ZRZ4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
C9orf47Q6ZRZ4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
C9orf47Q6ZRZ4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
C9orf47Q6ZRZ4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C9orf47Q6ZRZ4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C9orf47Q6ZRZ4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C9orf47Q6ZRZ4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
C9orf47Q6ZRZ4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
C9orf47Q6ZRZ4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
C9orf47Q6ZRZ4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C9orf47Q6ZRZ4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
C9orf47Q6ZRZ4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C9orf47Q6ZRZ4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
C9orf47Q6ZRZ4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
C9orf47Q6ZRZ4 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
C9orf47Q6ZRZ4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
C9orf47Q6ZRZ4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
C9orf47Q6ZRZ4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
C9orf47Q6ZRZ4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C9orf47Q6ZRZ4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C9orf47Q6ZRZ4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
C9orf47Q6ZRZ4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
C9orf47Q6ZRZ4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
C9orf47Q6ZRZ4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C9orf47Q6ZRZ4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C9orf47Q6ZRZ4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
C9orf47Q6ZRZ4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
C9orf47Q6ZRZ4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C9orf47Q6ZRZ4 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
C9orf47Q6ZRZ4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
C9orf47Q6ZRZ4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
C9orf47Q6ZRZ4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C9orf47Q6ZRZ4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C9orf47Q6ZRZ4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
C9orf47Q6ZRZ4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
C9orf47Q6ZRZ4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
C9orf47Q6ZRZ4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
C9orf47Q6ZRZ4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
C9orf47Q6ZRZ4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
C9orf47Q6ZRZ4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C9orf47Q6ZRZ4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
C9orf47Q6ZRZ4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C9orf47Q6ZRZ4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C9orf47Q6ZRZ4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C9orf47Q6ZRZ4 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C9orf47Q6ZRZ4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
C9orf47Q6ZRZ4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C9orf47Q6ZRZ4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
C9orf47Q6ZRZ4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms