Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVB8

TMEM244, Transmembrane protein 244, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM244Q5VVB8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM244Q5VVB8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM244Q5VVB8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM244Q5VVB8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM244Q5VVB8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM244Q5VVB8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM244Q5VVB8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM244Q5VVB8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM244Q5VVB8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM244Q5VVB8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM244Q5VVB8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMEM244Q5VVB8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM244Q5VVB8 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM244Q5VVB8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM244Q5VVB8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM244Q5VVB8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM244Q5VVB8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM244Q5VVB8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM244Q5VVB8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM244Q5VVB8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM244Q5VVB8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM244Q5VVB8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM244Q5VVB8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM244Q5VVB8 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM244Q5VVB8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM244Q5VVB8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM244Q5VVB8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM244Q5VVB8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM244Q5VVB8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM244Q5VVB8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM244Q5VVB8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM244Q5VVB8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM244Q5VVB8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM244Q5VVB8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM244Q5VVB8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM244Q5VVB8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM244Q5VVB8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM244Q5VVB8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM244Q5VVB8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM244Q5VVB8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM244Q5VVB8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM244Q5VVB8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM244Q5VVB8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM244Q5VVB8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM244Q5VVB8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM244Q5VVB8 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM244Q5VVB8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM244Q5VVB8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM244Q5VVB8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM244Q5VVB8 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM244Q5VVB8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM244Q5VVB8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM244Q5VVB8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM244Q5VVB8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM244Q5VVB8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM244Q5VVB8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM244Q5VVB8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM244Q5VVB8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM244Q5VVB8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM244Q5VVB8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM244Q5VVB8 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM244Q5VVB8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM244Q5VVB8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM244Q5VVB8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM244Q5VVB8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM244Q5VVB8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM244Q5VVB8 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM244Q5VVB8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM244Q5VVB8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM244Q5VVB8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM244Q5VVB8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM244Q5VVB8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM244Q5VVB8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM244Q5VVB8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM244Q5VVB8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM244Q5VVB8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM244Q5VVB8 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM244Q5VVB8 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM244Q5VVB8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM244Q5VVB8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM244Q5VVB8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM244Q5VVB8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM244Q5VVB8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM244Q5VVB8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM244Q5VVB8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM244Q5VVB8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM244Q5VVB8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM244Q5VVB8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM244Q5VVB8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM244Q5VVB8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM244Q5VVB8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM244Q5VVB8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM244Q5VVB8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM244Q5VVB8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM244Q5VVB8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM244Q5VVB8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM244Q5VVB8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM244Q5VVB8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM244Q5VVB8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM244Q5VVB8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms