Protein–RNA interactions for Protein: Q5TDP6

LGSN, Lengsin, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGSNQ5TDP6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LGSNQ5TDP6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LGSNQ5TDP6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
LGSNQ5TDP6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LGSNQ5TDP6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LGSNQ5TDP6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LGSNQ5TDP6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LGSNQ5TDP6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LGSNQ5TDP6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LGSNQ5TDP6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LGSNQ5TDP6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LGSNQ5TDP6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LGSNQ5TDP6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LGSNQ5TDP6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
LGSNQ5TDP6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
LGSNQ5TDP6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LGSNQ5TDP6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LGSNQ5TDP6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LGSNQ5TDP6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LGSNQ5TDP6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LGSNQ5TDP6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LGSNQ5TDP6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LGSNQ5TDP6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LGSNQ5TDP6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LGSNQ5TDP6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LGSNQ5TDP6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
LGSNQ5TDP6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LGSNQ5TDP6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LGSNQ5TDP6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LGSNQ5TDP6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LGSNQ5TDP6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LGSNQ5TDP6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LGSNQ5TDP6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LGSNQ5TDP6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LGSNQ5TDP6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LGSNQ5TDP6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LGSNQ5TDP6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LGSNQ5TDP6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LGSNQ5TDP6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LGSNQ5TDP6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LGSNQ5TDP6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LGSNQ5TDP6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LGSNQ5TDP6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LGSNQ5TDP6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
LGSNQ5TDP6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LGSNQ5TDP6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LGSNQ5TDP6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LGSNQ5TDP6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LGSNQ5TDP6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LGSNQ5TDP6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LGSNQ5TDP6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LGSNQ5TDP6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LGSNQ5TDP6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LGSNQ5TDP6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LGSNQ5TDP6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LGSNQ5TDP6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LGSNQ5TDP6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LGSNQ5TDP6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LGSNQ5TDP6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LGSNQ5TDP6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LGSNQ5TDP6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
LGSNQ5TDP6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LGSNQ5TDP6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LGSNQ5TDP6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LGSNQ5TDP6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LGSNQ5TDP6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LGSNQ5TDP6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LGSNQ5TDP6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LGSNQ5TDP6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LGSNQ5TDP6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LGSNQ5TDP6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LGSNQ5TDP6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LGSNQ5TDP6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LGSNQ5TDP6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LGSNQ5TDP6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LGSNQ5TDP6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LGSNQ5TDP6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LGSNQ5TDP6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.68
LGSNQ5TDP6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LGSNQ5TDP6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LGSNQ5TDP6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
LGSNQ5TDP6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LGSNQ5TDP6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LGSNQ5TDP6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LGSNQ5TDP6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LGSNQ5TDP6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LGSNQ5TDP6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LGSNQ5TDP6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
LGSNQ5TDP6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LGSNQ5TDP6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LGSNQ5TDP6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LGSNQ5TDP6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LGSNQ5TDP6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LGSNQ5TDP6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LGSNQ5TDP6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LGSNQ5TDP6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LGSNQ5TDP6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LGSNQ5TDP6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LGSNQ5TDP6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LGSNQ5TDP6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms