Protein–RNA interactions for Protein: Q5H9J9

TCP11X2, T-complex protein 11 X-linked protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP11X2Q5H9J9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TCP11X2Q5H9J9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
TCP11X2Q5H9J9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TCP11X2Q5H9J9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TCP11X2Q5H9J9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TCP11X2Q5H9J9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TCP11X2Q5H9J9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TCP11X2Q5H9J9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TCP11X2Q5H9J9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TCP11X2Q5H9J9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TCP11X2Q5H9J9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TCP11X2Q5H9J9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TCP11X2Q5H9J9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TCP11X2Q5H9J9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TCP11X2Q5H9J9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TCP11X2Q5H9J9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TCP11X2Q5H9J9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TCP11X2Q5H9J9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TCP11X2Q5H9J9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TCP11X2Q5H9J9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TCP11X2Q5H9J9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TCP11X2Q5H9J9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TCP11X2Q5H9J9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TCP11X2Q5H9J9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TCP11X2Q5H9J9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TCP11X2Q5H9J9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TCP11X2Q5H9J9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TCP11X2Q5H9J9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TCP11X2Q5H9J9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TCP11X2Q5H9J9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TCP11X2Q5H9J9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
TCP11X2Q5H9J9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TCP11X2Q5H9J9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TCP11X2Q5H9J9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TCP11X2Q5H9J9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TCP11X2Q5H9J9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TCP11X2Q5H9J9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TCP11X2Q5H9J9 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
TCP11X2Q5H9J9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TCP11X2Q5H9J9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TCP11X2Q5H9J9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TCP11X2Q5H9J9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TCP11X2Q5H9J9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TCP11X2Q5H9J9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TCP11X2Q5H9J9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TCP11X2Q5H9J9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TCP11X2Q5H9J9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TCP11X2Q5H9J9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TCP11X2Q5H9J9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TCP11X2Q5H9J9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TCP11X2Q5H9J9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TCP11X2Q5H9J9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
TCP11X2Q5H9J9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TCP11X2Q5H9J9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TCP11X2Q5H9J9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TCP11X2Q5H9J9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TCP11X2Q5H9J9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TCP11X2Q5H9J9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TCP11X2Q5H9J9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TCP11X2Q5H9J9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TCP11X2Q5H9J9 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TCP11X2Q5H9J9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TCP11X2Q5H9J9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TCP11X2Q5H9J9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TCP11X2Q5H9J9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28■■■□□ 2.07
TCP11X2Q5H9J9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TCP11X2Q5H9J9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TCP11X2Q5H9J9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TCP11X2Q5H9J9 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TCP11X2Q5H9J9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TCP11X2Q5H9J9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TCP11X2Q5H9J9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TCP11X2Q5H9J9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
TCP11X2Q5H9J9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TCP11X2Q5H9J9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TCP11X2Q5H9J9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TCP11X2Q5H9J9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TCP11X2Q5H9J9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TCP11X2Q5H9J9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TCP11X2Q5H9J9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TCP11X2Q5H9J9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TCP11X2Q5H9J9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TCP11X2Q5H9J9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TCP11X2Q5H9J9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TCP11X2Q5H9J9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TCP11X2Q5H9J9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TCP11X2Q5H9J9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TCP11X2Q5H9J9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
TCP11X2Q5H9J9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TCP11X2Q5H9J9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TCP11X2Q5H9J9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TCP11X2Q5H9J9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TCP11X2Q5H9J9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TCP11X2Q5H9J9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TCP11X2Q5H9J9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TCP11X2Q5H9J9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TCP11X2Q5H9J9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TCP11X2Q5H9J9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TCP11X2Q5H9J9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TCP11X2Q5H9J9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.9 ms