Protein–RNA interactions for Protein: Q58FG1

HSP90AA4P, Putative heat shock protein HSP 90-alpha A4, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AA4PQ58FG1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HSP90AA4PQ58FG1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HSP90AA4PQ58FG1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
HSP90AA4PQ58FG1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
HSP90AA4PQ58FG1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
HSP90AA4PQ58FG1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HSP90AA4PQ58FG1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HSP90AA4PQ58FG1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HSP90AA4PQ58FG1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
HSP90AA4PQ58FG1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HSP90AA4PQ58FG1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HSP90AA4PQ58FG1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HSP90AA4PQ58FG1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HSP90AA4PQ58FG1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HSP90AA4PQ58FG1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HSP90AA4PQ58FG1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HSP90AA4PQ58FG1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
HSP90AA4PQ58FG1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
HSP90AA4PQ58FG1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.12
HSP90AA4PQ58FG1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
HSP90AA4PQ58FG1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HSP90AA4PQ58FG1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
HSP90AA4PQ58FG1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HSP90AA4PQ58FG1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
HSP90AA4PQ58FG1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
HSP90AA4PQ58FG1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HSP90AA4PQ58FG1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
HSP90AA4PQ58FG1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HSP90AA4PQ58FG1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
HSP90AA4PQ58FG1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
HSP90AA4PQ58FG1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HSP90AA4PQ58FG1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
HSP90AA4PQ58FG1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
HSP90AA4PQ58FG1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
HSP90AA4PQ58FG1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
HSP90AA4PQ58FG1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
HSP90AA4PQ58FG1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HSP90AA4PQ58FG1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HSP90AA4PQ58FG1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HSP90AA4PQ58FG1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HSP90AA4PQ58FG1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
HSP90AA4PQ58FG1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HSP90AA4PQ58FG1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HSP90AA4PQ58FG1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HSP90AA4PQ58FG1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HSP90AA4PQ58FG1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HSP90AA4PQ58FG1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HSP90AA4PQ58FG1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HSP90AA4PQ58FG1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HSP90AA4PQ58FG1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HSP90AA4PQ58FG1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HSP90AA4PQ58FG1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HSP90AA4PQ58FG1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HSP90AA4PQ58FG1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HSP90AA4PQ58FG1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HSP90AA4PQ58FG1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HSP90AA4PQ58FG1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HSP90AA4PQ58FG1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HSP90AA4PQ58FG1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HSP90AA4PQ58FG1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HSP90AA4PQ58FG1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HSP90AA4PQ58FG1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HSP90AA4PQ58FG1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HSP90AA4PQ58FG1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HSP90AA4PQ58FG1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HSP90AA4PQ58FG1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HSP90AA4PQ58FG1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HSP90AA4PQ58FG1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HSP90AA4PQ58FG1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
HSP90AA4PQ58FG1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
HSP90AA4PQ58FG1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
HSP90AA4PQ58FG1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
HSP90AA4PQ58FG1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HSP90AA4PQ58FG1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HSP90AA4PQ58FG1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HSP90AA4PQ58FG1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HSP90AA4PQ58FG1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HSP90AA4PQ58FG1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HSP90AA4PQ58FG1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HSP90AA4PQ58FG1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HSP90AA4PQ58FG1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HSP90AA4PQ58FG1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HSP90AA4PQ58FG1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HSP90AA4PQ58FG1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HSP90AA4PQ58FG1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HSP90AA4PQ58FG1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
HSP90AA4PQ58FG1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HSP90AA4PQ58FG1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HSP90AA4PQ58FG1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HSP90AA4PQ58FG1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HSP90AA4PQ58FG1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HSP90AA4PQ58FG1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HSP90AA4PQ58FG1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HSP90AA4PQ58FG1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HSP90AA4PQ58FG1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HSP90AA4PQ58FG1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HSP90AA4PQ58FG1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HSP90AA4PQ58FG1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
HSP90AA4PQ58FG1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
HSP90AA4PQ58FG1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.7 ms