Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEC23BQ15437 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEC23BQ15437 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEC23BQ15437 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEC23BQ15437 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEC23BQ15437 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEC23BQ15437 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEC23BQ15437 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEC23BQ15437 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEC23BQ15437 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEC23BQ15437 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEC23BQ15437 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEC23BQ15437 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEC23BQ15437 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEC23BQ15437 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEC23BQ15437 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEC23BQ15437 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SEC23BQ15437 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEC23BQ15437 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEC23BQ15437 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEC23BQ15437 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEC23BQ15437 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEC23BQ15437 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEC23BQ15437 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEC23BQ15437 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEC23BQ15437 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEC23BQ15437 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEC23BQ15437 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEC23BQ15437 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEC23BQ15437 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEC23BQ15437 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEC23BQ15437 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SEC23BQ15437 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SEC23BQ15437 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEC23BQ15437 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEC23BQ15437 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEC23BQ15437 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEC23BQ15437 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEC23BQ15437 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEC23BQ15437 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEC23BQ15437 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEC23BQ15437 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEC23BQ15437 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEC23BQ15437 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEC23BQ15437 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEC23BQ15437 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEC23BQ15437 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC23BQ15437 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC23BQ15437 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC23BQ15437 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC23BQ15437 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC23BQ15437 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEC23BQ15437 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEC23BQ15437 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEC23BQ15437 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SEC23BQ15437 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEC23BQ15437 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEC23BQ15437 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEC23BQ15437 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEC23BQ15437 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEC23BQ15437 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEC23BQ15437 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEC23BQ15437 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEC23BQ15437 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEC23BQ15437 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEC23BQ15437 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEC23BQ15437 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEC23BQ15437 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEC23BQ15437 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEC23BQ15437 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEC23BQ15437 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEC23BQ15437 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEC23BQ15437 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEC23BQ15437 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEC23BQ15437 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEC23BQ15437 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEC23BQ15437 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEC23BQ15437 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEC23BQ15437 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SEC23BQ15437 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SEC23BQ15437 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SEC23BQ15437 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEC23BQ15437 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEC23BQ15437 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEC23BQ15437 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEC23BQ15437 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEC23BQ15437 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEC23BQ15437 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEC23BQ15437 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEC23BQ15437 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEC23BQ15437 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SEC23BQ15437 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEC23BQ15437 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEC23BQ15437 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEC23BQ15437 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEC23BQ15437 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEC23BQ15437 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEC23BQ15437 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEC23BQ15437 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEC23BQ15437 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms