Protein–RNA interactions for Protein: P78385

KRT83, Keratin, type II cuticular Hb3, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT83P78385 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KRT83P78385 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KRT83P78385 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KRT83P78385 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
KRT83P78385 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
KRT83P78385 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KRT83P78385 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KRT83P78385 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
KRT83P78385 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
KRT83P78385 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
KRT83P78385 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
KRT83P78385 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KRT83P78385 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KRT83P78385 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KRT83P78385 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KRT83P78385 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KRT83P78385 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KRT83P78385 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
KRT83P78385 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KRT83P78385 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KRT83P78385 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KRT83P78385 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KRT83P78385 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KRT83P78385 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KRT83P78385 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KRT83P78385 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KRT83P78385 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KRT83P78385 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KRT83P78385 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KRT83P78385 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KRT83P78385 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KRT83P78385 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KRT83P78385 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KRT83P78385 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KRT83P78385 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KRT83P78385 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KRT83P78385 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KRT83P78385 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
KRT83P78385 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
KRT83P78385 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KRT83P78385 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
KRT83P78385 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.57■■■□□ 2
KRT83P78385 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KRT83P78385 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KRT83P78385 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KRT83P78385 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KRT83P78385 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
KRT83P78385 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KRT83P78385 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KRT83P78385 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KRT83P78385 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
KRT83P78385 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.53■■■□□ 2
KRT83P78385 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KRT83P78385 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KRT83P78385 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KRT83P78385 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KRT83P78385 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.52■■■□□ 2
KRT83P78385 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
KRT83P78385 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
KRT83P78385 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.52■■■□□ 2
KRT83P78385 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
KRT83P78385 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KRT83P78385 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KRT83P78385 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KRT83P78385 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KRT83P78385 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KRT83P78385 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
KRT83P78385 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KRT83P78385 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KRT83P78385 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KRT83P78385 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KRT83P78385 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KRT83P78385 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KRT83P78385 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KRT83P78385 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KRT83P78385 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KRT83P78385 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
KRT83P78385 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
KRT83P78385 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KRT83P78385 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KRT83P78385 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KRT83P78385 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KRT83P78385 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KRT83P78385 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KRT83P78385 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KRT83P78385 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KRT83P78385 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KRT83P78385 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KRT83P78385 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KRT83P78385 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KRT83P78385 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KRT83P78385 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
KRT83P78385 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
KRT83P78385 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
KRT83P78385 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
KRT83P78385 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KRT83P78385 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KRT83P78385 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KRT83P78385 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KRT83P78385 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.8 ms