Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NME5P56597 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NME5P56597 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NME5P56597 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NME5P56597 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NME5P56597 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NME5P56597 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NME5P56597 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NME5P56597 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
NME5P56597 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NME5P56597 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NME5P56597 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NME5P56597 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NME5P56597 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NME5P56597 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NME5P56597 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NME5P56597 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NME5P56597 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NME5P56597 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NME5P56597 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NME5P56597 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NME5P56597 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NME5P56597 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NME5P56597 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NME5P56597 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NME5P56597 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NME5P56597 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NME5P56597 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NME5P56597 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NME5P56597 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NME5P56597 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
NME5P56597 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NME5P56597 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NME5P56597 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NME5P56597 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NME5P56597 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NME5P56597 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NME5P56597 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NME5P56597 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NME5P56597 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NME5P56597 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NME5P56597 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NME5P56597 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NME5P56597 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NME5P56597 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NME5P56597 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NME5P56597 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NME5P56597 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NME5P56597 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NME5P56597 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NME5P56597 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NME5P56597 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NME5P56597 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NME5P56597 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NME5P56597 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
NME5P56597 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NME5P56597 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NME5P56597 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NME5P56597 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NME5P56597 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NME5P56597 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NME5P56597 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NME5P56597 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NME5P56597 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NME5P56597 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NME5P56597 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NME5P56597 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NME5P56597 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NME5P56597 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NME5P56597 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NME5P56597 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NME5P56597 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NME5P56597 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NME5P56597 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NME5P56597 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NME5P56597 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NME5P56597 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NME5P56597 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NME5P56597 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NME5P56597 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NME5P56597 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NME5P56597 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NME5P56597 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NME5P56597 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NME5P56597 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NME5P56597 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NME5P56597 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NME5P56597 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NME5P56597 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NME5P56597 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NME5P56597 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NME5P56597 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NME5P56597 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NME5P56597 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NME5P56597 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NME5P56597 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NME5P56597 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NME5P56597 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NME5P56597 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NME5P56597 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms