Protein–RNA interactions for Protein: P56182

RRP1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1P56182 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
RRP1P56182 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
RRP1P56182 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC33.16■■■□□ 2.9
RRP1P56182 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
RRP1P56182 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
RRP1P56182 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
RRP1P56182 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
RRP1P56182 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
RRP1P56182 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
RRP1P56182 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
RRP1P56182 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
RRP1P56182 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
RRP1P56182 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
RRP1P56182 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
RRP1P56182 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
RRP1P56182 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
RRP1P56182 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC33.09■■■□□ 2.89
RRP1P56182 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
RRP1P56182 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
RRP1P56182 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
RRP1P56182 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
RRP1P56182 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
RRP1P56182 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
RRP1P56182 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
RRP1P56182 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC33.05■■■□□ 2.88
RRP1P56182 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
RRP1P56182 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
RRP1P56182 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
RRP1P56182 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
RRP1P56182 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
RRP1P56182 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
RRP1P56182 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
RRP1P56182 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
RRP1P56182 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
RRP1P56182 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
RRP1P56182 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
RRP1P56182 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33.01■■■□□ 2.87
RRP1P56182 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
RRP1P56182 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
RRP1P56182 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
RRP1P56182 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC32.99■■■□□ 2.87
RRP1P56182 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
RRP1P56182 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
RRP1P56182 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
RRP1P56182 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
RRP1P56182 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
RRP1P56182 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
RRP1P56182 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
RRP1P56182 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
RRP1P56182 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
RRP1P56182 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
RRP1P56182 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
RRP1P56182 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
RRP1P56182 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC32.95■■■□□ 2.87
RRP1P56182 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.86
RRP1P56182 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
RRP1P56182 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
RRP1P56182 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
RRP1P56182 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
RRP1P56182 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
RRP1P56182 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC32.92■■■□□ 2.86
RRP1P56182 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC32.92■■■□□ 2.86
RRP1P56182 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
RRP1P56182 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC32.92■■■□□ 2.86
RRP1P56182 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
RRP1P56182 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC32.91■■■□□ 2.86
RRP1P56182 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
RRP1P56182 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
RRP1P56182 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
RRP1P56182 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
RRP1P56182 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
RRP1P56182 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
RRP1P56182 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
RRP1P56182 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.85
RRP1P56182 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
RRP1P56182 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
RRP1P56182 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
RRP1P56182 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
RRP1P56182 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
RRP1P56182 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
RRP1P56182 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
RRP1P56182 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
RRP1P56182 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
RRP1P56182 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
RRP1P56182 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
RRP1P56182 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
RRP1P56182 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
RRP1P56182 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
RRP1P56182 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
RRP1P56182 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
RRP1P56182 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
RRP1P56182 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
RRP1P56182 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
RRP1P56182 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
RRP1P56182 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
RRP1P56182 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
RRP1P56182 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
RRP1P56182 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
RRP1P56182 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
RRP1P56182 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms