Protein–RNA interactions for Protein: P41240

CSK, Tyrosine-protein kinase CSK, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSKP41240 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CSKP41240 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CSKP41240 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CSKP41240 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CSKP41240 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CSKP41240 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CSKP41240 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CSKP41240 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CSKP41240 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CSKP41240 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CSKP41240 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CSKP41240 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CSKP41240 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CSKP41240 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CSKP41240 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CSKP41240 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CSKP41240 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CSKP41240 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CSKP41240 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CSKP41240 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CSKP41240 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CSKP41240 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CSKP41240 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CSKP41240 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CSKP41240 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CSKP41240 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CSKP41240 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CSKP41240 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CSKP41240 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CSKP41240 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CSKP41240 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CSKP41240 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CSKP41240 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CSKP41240 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CSKP41240 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CSKP41240 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CSKP41240 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CSKP41240 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CSKP41240 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CSKP41240 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CSKP41240 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CSKP41240 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CSKP41240 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CSKP41240 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CSKP41240 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CSKP41240 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CSKP41240 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CSKP41240 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CSKP41240 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CSKP41240 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CSKP41240 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CSKP41240 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CSKP41240 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CSKP41240 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CSKP41240 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CSKP41240 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CSKP41240 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CSKP41240 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CSKP41240 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CSKP41240 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CSKP41240 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CSKP41240 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CSKP41240 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CSKP41240 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CSKP41240 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CSKP41240 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CSKP41240 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CSKP41240 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CSKP41240 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CSKP41240 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CSKP41240 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CSKP41240 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CSKP41240 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CSKP41240 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CSKP41240 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CSKP41240 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CSKP41240 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CSKP41240 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CSKP41240 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CSKP41240 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CSKP41240 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CSKP41240 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CSKP41240 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
CSKP41240 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CSKP41240 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CSKP41240 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CSKP41240 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CSKP41240 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CSKP41240 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CSKP41240 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CSKP41240 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CSKP41240 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CSKP41240 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CSKP41240 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CSKP41240 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CSKP41240 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CSKP41240 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CSKP41240 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CSKP41240 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CSKP41240 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms