Protein–RNA interactions for Protein: P24539

ATP5F1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5F1P24539 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP5F1P24539 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP5F1P24539 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP5F1P24539 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP5F1P24539 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP5F1P24539 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP5F1P24539 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP5F1P24539 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP5F1P24539 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP5F1P24539 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP5F1P24539 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP5F1P24539 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP5F1P24539 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP5F1P24539 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP5F1P24539 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP5F1P24539 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP5F1P24539 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP5F1P24539 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP5F1P24539 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP5F1P24539 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ATP5F1P24539 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ATP5F1P24539 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP5F1P24539 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP5F1P24539 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP5F1P24539 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP5F1P24539 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP5F1P24539 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP5F1P24539 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP5F1P24539 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP5F1P24539 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP5F1P24539 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP5F1P24539 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP5F1P24539 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP5F1P24539 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP5F1P24539 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP5F1P24539 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP5F1P24539 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP5F1P24539 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP5F1P24539 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP5F1P24539 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP5F1P24539 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP5F1P24539 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP5F1P24539 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP5F1P24539 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP5F1P24539 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP5F1P24539 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP5F1P24539 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ATP5F1P24539 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP5F1P24539 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP5F1P24539 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP5F1P24539 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP5F1P24539 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP5F1P24539 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP5F1P24539 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP5F1P24539 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP5F1P24539 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP5F1P24539 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP5F1P24539 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP5F1P24539 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP5F1P24539 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP5F1P24539 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP5F1P24539 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP5F1P24539 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP5F1P24539 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP5F1P24539 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP5F1P24539 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP5F1P24539 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP5F1P24539 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP5F1P24539 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP5F1P24539 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP5F1P24539 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP5F1P24539 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP5F1P24539 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP5F1P24539 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATP5F1P24539 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATP5F1P24539 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATP5F1P24539 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP5F1P24539 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP5F1P24539 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP5F1P24539 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP5F1P24539 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP5F1P24539 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP5F1P24539 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP5F1P24539 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP5F1P24539 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP5F1P24539 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP5F1P24539 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP5F1P24539 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP5F1P24539 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP5F1P24539 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP5F1P24539 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP5F1P24539 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP5F1P24539 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP5F1P24539 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP5F1P24539 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ATP5F1P24539 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP5F1P24539 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP5F1P24539 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP5F1P24539 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP5F1P24539 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms