Protein–RNA interactions for Protein: P22681

CBL, E3 ubiquitin-protein ligase CBL, humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBLP22681 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CBLP22681 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CBLP22681 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CBLP22681 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CBLP22681 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CBLP22681 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CBLP22681 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CBLP22681 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CBLP22681 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CBLP22681 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CBLP22681 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CBLP22681 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CBLP22681 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CBLP22681 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CBLP22681 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CBLP22681 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CBLP22681 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CBLP22681 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CBLP22681 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CBLP22681 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CBLP22681 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CBLP22681 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CBLP22681 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CBLP22681 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CBLP22681 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CBLP22681 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CBLP22681 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CBLP22681 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CBLP22681 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CBLP22681 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CBLP22681 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CBLP22681 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CBLP22681 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CBLP22681 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CBLP22681 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CBLP22681 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CBLP22681 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CBLP22681 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CBLP22681 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CBLP22681 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CBLP22681 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CBLP22681 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CBLP22681 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CBLP22681 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CBLP22681 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CBLP22681 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CBLP22681 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CBLP22681 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CBLP22681 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CBLP22681 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CBLP22681 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CBLP22681 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CBLP22681 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CBLP22681 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CBLP22681 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CBLP22681 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CBLP22681 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CBLP22681 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CBLP22681 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CBLP22681 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CBLP22681 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CBLP22681 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CBLP22681 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CBLP22681 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CBLP22681 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CBLP22681 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CBLP22681 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CBLP22681 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CBLP22681 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CBLP22681 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
CBLP22681 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CBLP22681 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CBLP22681 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CBLP22681 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CBLP22681 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CBLP22681 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CBLP22681 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CBLP22681 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CBLP22681 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CBLP22681 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CBLP22681 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CBLP22681 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CBLP22681 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CBLP22681 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CBLP22681 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CBLP22681 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CBLP22681 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CBLP22681 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CBLP22681 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CBLP22681 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CBLP22681 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CBLP22681 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CBLP22681 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CBLP22681 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CBLP22681 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CBLP22681 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CBLP22681 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CBLP22681 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CBLP22681 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CBLP22681 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms