Protein–RNA interactions for Protein: P09001

MRPL3, 39S ribosomal protein L3, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL3P09001 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MRPL3P09001 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MRPL3P09001 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MRPL3P09001 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MRPL3P09001 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MRPL3P09001 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MRPL3P09001 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
MRPL3P09001 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MRPL3P09001 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MRPL3P09001 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MRPL3P09001 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MRPL3P09001 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MRPL3P09001 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MRPL3P09001 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MRPL3P09001 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MRPL3P09001 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MRPL3P09001 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MRPL3P09001 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MRPL3P09001 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MRPL3P09001 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MRPL3P09001 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MRPL3P09001 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MRPL3P09001 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MRPL3P09001 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MRPL3P09001 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MRPL3P09001 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MRPL3P09001 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MRPL3P09001 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MRPL3P09001 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MRPL3P09001 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MRPL3P09001 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MRPL3P09001 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MRPL3P09001 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MRPL3P09001 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRPL3P09001 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRPL3P09001 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRPL3P09001 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRPL3P09001 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRPL3P09001 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MRPL3P09001 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MRPL3P09001 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MRPL3P09001 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MRPL3P09001 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MRPL3P09001 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MRPL3P09001 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MRPL3P09001 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MRPL3P09001 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MRPL3P09001 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MRPL3P09001 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MRPL3P09001 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRPL3P09001 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MRPL3P09001 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRPL3P09001 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MRPL3P09001 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRPL3P09001 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRPL3P09001 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRPL3P09001 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MRPL3P09001 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MRPL3P09001 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MRPL3P09001 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MRPL3P09001 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MRPL3P09001 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRPL3P09001 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRPL3P09001 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRPL3P09001 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MRPL3P09001 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MRPL3P09001 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MRPL3P09001 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MRPL3P09001 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MRPL3P09001 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MRPL3P09001 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MRPL3P09001 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MRPL3P09001 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MRPL3P09001 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MRPL3P09001 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MRPL3P09001 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRPL3P09001 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRPL3P09001 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRPL3P09001 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRPL3P09001 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRPL3P09001 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRPL3P09001 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MRPL3P09001 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MRPL3P09001 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MRPL3P09001 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MRPL3P09001 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MRPL3P09001 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MRPL3P09001 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MRPL3P09001 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MRPL3P09001 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MRPL3P09001 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MRPL3P09001 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MRPL3P09001 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MRPL3P09001 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MRPL3P09001 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRPL3P09001 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRPL3P09001 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRPL3P09001 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRPL3P09001 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRPL3P09001 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms