Protein–RNA interactions for Protein: P05114

HMGN1, Non-histone chromosomal protein HMG-14, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN1P05114 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HMGN1P05114 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HMGN1P05114 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HMGN1P05114 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HMGN1P05114 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HMGN1P05114 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HMGN1P05114 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HMGN1P05114 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HMGN1P05114 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HMGN1P05114 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HMGN1P05114 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HMGN1P05114 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HMGN1P05114 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HMGN1P05114 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HMGN1P05114 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HMGN1P05114 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HMGN1P05114 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HMGN1P05114 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HMGN1P05114 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HMGN1P05114 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HMGN1P05114 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HMGN1P05114 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
HMGN1P05114 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HMGN1P05114 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
HMGN1P05114 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HMGN1P05114 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HMGN1P05114 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HMGN1P05114 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HMGN1P05114 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HMGN1P05114 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HMGN1P05114 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HMGN1P05114 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HMGN1P05114 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HMGN1P05114 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HMGN1P05114 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HMGN1P05114 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HMGN1P05114 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HMGN1P05114 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HMGN1P05114 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HMGN1P05114 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HMGN1P05114 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HMGN1P05114 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HMGN1P05114 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HMGN1P05114 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HMGN1P05114 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HMGN1P05114 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HMGN1P05114 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HMGN1P05114 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HMGN1P05114 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HMGN1P05114 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HMGN1P05114 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HMGN1P05114 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HMGN1P05114 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HMGN1P05114 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HMGN1P05114 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HMGN1P05114 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HMGN1P05114 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HMGN1P05114 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HMGN1P05114 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HMGN1P05114 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HMGN1P05114 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HMGN1P05114 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HMGN1P05114 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HMGN1P05114 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HMGN1P05114 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HMGN1P05114 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HMGN1P05114 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HMGN1P05114 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HMGN1P05114 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HMGN1P05114 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HMGN1P05114 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HMGN1P05114 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HMGN1P05114 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HMGN1P05114 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HMGN1P05114 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMGN1P05114 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMGN1P05114 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HMGN1P05114 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HMGN1P05114 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMGN1P05114 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMGN1P05114 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMGN1P05114 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMGN1P05114 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMGN1P05114 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMGN1P05114 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMGN1P05114 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMGN1P05114 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMGN1P05114 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMGN1P05114 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HMGN1P05114 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HMGN1P05114 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HMGN1P05114 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMGN1P05114 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMGN1P05114 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMGN1P05114 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMGN1P05114 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMGN1P05114 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMGN1P05114 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMGN1P05114 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMGN1P05114 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms