Protein–RNA interactions for Protein: O95476

CTDNEP1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1O95476 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CTDNEP1O95476 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CTDNEP1O95476 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CTDNEP1O95476 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CTDNEP1O95476 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CTDNEP1O95476 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CTDNEP1O95476 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CTDNEP1O95476 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CTDNEP1O95476 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
CTDNEP1O95476 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CTDNEP1O95476 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
CTDNEP1O95476 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CTDNEP1O95476 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CTDNEP1O95476 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CTDNEP1O95476 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CTDNEP1O95476 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CTDNEP1O95476 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CTDNEP1O95476 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CTDNEP1O95476 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CTDNEP1O95476 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CTDNEP1O95476 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CTDNEP1O95476 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CTDNEP1O95476 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CTDNEP1O95476 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CTDNEP1O95476 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
CTDNEP1O95476 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CTDNEP1O95476 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CTDNEP1O95476 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CTDNEP1O95476 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CTDNEP1O95476 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CTDNEP1O95476 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CTDNEP1O95476 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CTDNEP1O95476 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CTDNEP1O95476 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CTDNEP1O95476 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CTDNEP1O95476 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CTDNEP1O95476 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
CTDNEP1O95476 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CTDNEP1O95476 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CTDNEP1O95476 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CTDNEP1O95476 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CTDNEP1O95476 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CTDNEP1O95476 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CTDNEP1O95476 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CTDNEP1O95476 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CTDNEP1O95476 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CTDNEP1O95476 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CTDNEP1O95476 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
CTDNEP1O95476 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CTDNEP1O95476 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CTDNEP1O95476 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CTDNEP1O95476 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CTDNEP1O95476 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CTDNEP1O95476 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CTDNEP1O95476 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CTDNEP1O95476 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CTDNEP1O95476 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CTDNEP1O95476 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CTDNEP1O95476 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CTDNEP1O95476 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CTDNEP1O95476 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CTDNEP1O95476 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CTDNEP1O95476 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
CTDNEP1O95476 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CTDNEP1O95476 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CTDNEP1O95476 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CTDNEP1O95476 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CTDNEP1O95476 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CTDNEP1O95476 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CTDNEP1O95476 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CTDNEP1O95476 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CTDNEP1O95476 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CTDNEP1O95476 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CTDNEP1O95476 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CTDNEP1O95476 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CTDNEP1O95476 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CTDNEP1O95476 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CTDNEP1O95476 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CTDNEP1O95476 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CTDNEP1O95476 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CTDNEP1O95476 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
CTDNEP1O95476 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CTDNEP1O95476 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CTDNEP1O95476 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
CTDNEP1O95476 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CTDNEP1O95476 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CTDNEP1O95476 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CTDNEP1O95476 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.34
CTDNEP1O95476 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
CTDNEP1O95476 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CTDNEP1O95476 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CTDNEP1O95476 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CTDNEP1O95476 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CTDNEP1O95476 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CTDNEP1O95476 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CTDNEP1O95476 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CTDNEP1O95476 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CTDNEP1O95476 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CTDNEP1O95476 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
CTDNEP1O95476 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms