Protein–RNA interactions for Protein: O76015

KRT38, Keratin, type I cuticular Ha8, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT38O76015 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT38O76015 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT38O76015 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
KRT38O76015 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KRT38O76015 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KRT38O76015 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KRT38O76015 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT38O76015 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT38O76015 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT38O76015 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT38O76015 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT38O76015 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT38O76015 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT38O76015 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT38O76015 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT38O76015 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT38O76015 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT38O76015 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT38O76015 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT38O76015 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT38O76015 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT38O76015 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT38O76015 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT38O76015 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT38O76015 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT38O76015 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT38O76015 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT38O76015 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT38O76015 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT38O76015 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT38O76015 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT38O76015 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT38O76015 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT38O76015 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT38O76015 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT38O76015 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT38O76015 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT38O76015 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT38O76015 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT38O76015 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT38O76015 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT38O76015 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
KRT38O76015 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
KRT38O76015 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
KRT38O76015 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
KRT38O76015 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
KRT38O76015 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT38O76015 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT38O76015 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT38O76015 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT38O76015 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT38O76015 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT38O76015 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT38O76015 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT38O76015 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT38O76015 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT38O76015 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT38O76015 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT38O76015 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT38O76015 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT38O76015 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT38O76015 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT38O76015 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT38O76015 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT38O76015 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT38O76015 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT38O76015 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT38O76015 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT38O76015 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT38O76015 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT38O76015 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT38O76015 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KRT38O76015 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KRT38O76015 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KRT38O76015 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KRT38O76015 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT38O76015 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT38O76015 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT38O76015 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT38O76015 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT38O76015 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT38O76015 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT38O76015 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT38O76015 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT38O76015 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT38O76015 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT38O76015 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT38O76015 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT38O76015 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT38O76015 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT38O76015 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT38O76015 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
KRT38O76015 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
KRT38O76015 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT38O76015 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT38O76015 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT38O76015 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT38O76015 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT38O76015 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT38O76015 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms