Protein–RNA interactions for Protein: O15524

SOCS1, Suppressor of cytokine signaling 1, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS1O15524 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SOCS1O15524 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SOCS1O15524 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SOCS1O15524 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SOCS1O15524 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SOCS1O15524 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SOCS1O15524 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SOCS1O15524 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SOCS1O15524 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SOCS1O15524 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SOCS1O15524 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SOCS1O15524 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SOCS1O15524 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SOCS1O15524 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SOCS1O15524 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SOCS1O15524 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SOCS1O15524 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SOCS1O15524 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SOCS1O15524 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SOCS1O15524 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SOCS1O15524 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SOCS1O15524 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SOCS1O15524 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SOCS1O15524 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SOCS1O15524 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SOCS1O15524 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SOCS1O15524 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SOCS1O15524 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SOCS1O15524 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SOCS1O15524 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SOCS1O15524 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SOCS1O15524 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SOCS1O15524 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SOCS1O15524 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SOCS1O15524 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SOCS1O15524 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SOCS1O15524 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SOCS1O15524 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SOCS1O15524 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SOCS1O15524 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SOCS1O15524 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SOCS1O15524 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SOCS1O15524 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SOCS1O15524 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SOCS1O15524 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SOCS1O15524 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SOCS1O15524 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SOCS1O15524 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SOCS1O15524 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SOCS1O15524 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SOCS1O15524 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SOCS1O15524 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SOCS1O15524 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SOCS1O15524 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SOCS1O15524 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SOCS1O15524 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SOCS1O15524 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SOCS1O15524 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SOCS1O15524 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SOCS1O15524 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SOCS1O15524 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SOCS1O15524 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SOCS1O15524 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SOCS1O15524 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SOCS1O15524 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SOCS1O15524 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SOCS1O15524 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SOCS1O15524 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SOCS1O15524 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SOCS1O15524 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SOCS1O15524 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SOCS1O15524 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SOCS1O15524 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SOCS1O15524 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SOCS1O15524 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SOCS1O15524 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SOCS1O15524 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SOCS1O15524 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SOCS1O15524 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SOCS1O15524 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SOCS1O15524 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SOCS1O15524 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SOCS1O15524 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SOCS1O15524 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SOCS1O15524 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SOCS1O15524 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SOCS1O15524 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SOCS1O15524 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SOCS1O15524 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SOCS1O15524 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SOCS1O15524 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SOCS1O15524 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SOCS1O15524 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SOCS1O15524 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SOCS1O15524 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SOCS1O15524 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SOCS1O15524 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SOCS1O15524 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SOCS1O15524 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SOCS1O15524 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms