Protein–RNA interactions for Protein: O15260

SURF4, Surfeit locus protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF4O15260 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SURF4O15260 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SURF4O15260 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SURF4O15260 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SURF4O15260 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SURF4O15260 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SURF4O15260 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SURF4O15260 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SURF4O15260 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SURF4O15260 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SURF4O15260 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SURF4O15260 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SURF4O15260 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SURF4O15260 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SURF4O15260 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SURF4O15260 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SURF4O15260 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SURF4O15260 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SURF4O15260 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SURF4O15260 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SURF4O15260 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SURF4O15260 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SURF4O15260 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SURF4O15260 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SURF4O15260 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SURF4O15260 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SURF4O15260 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SURF4O15260 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SURF4O15260 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SURF4O15260 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SURF4O15260 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SURF4O15260 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SURF4O15260 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SURF4O15260 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SURF4O15260 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SURF4O15260 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SURF4O15260 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SURF4O15260 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SURF4O15260 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SURF4O15260 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SURF4O15260 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SURF4O15260 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SURF4O15260 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SURF4O15260 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SURF4O15260 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SURF4O15260 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SURF4O15260 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SURF4O15260 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SURF4O15260 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SURF4O15260 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SURF4O15260 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SURF4O15260 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SURF4O15260 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SURF4O15260 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SURF4O15260 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SURF4O15260 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SURF4O15260 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SURF4O15260 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SURF4O15260 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SURF4O15260 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SURF4O15260 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SURF4O15260 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SURF4O15260 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SURF4O15260 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SURF4O15260 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SURF4O15260 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SURF4O15260 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SURF4O15260 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SURF4O15260 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SURF4O15260 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SURF4O15260 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SURF4O15260 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SURF4O15260 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SURF4O15260 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SURF4O15260 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SURF4O15260 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SURF4O15260 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SURF4O15260 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SURF4O15260 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SURF4O15260 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SURF4O15260 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SURF4O15260 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SURF4O15260 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SURF4O15260 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SURF4O15260 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SURF4O15260 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SURF4O15260 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SURF4O15260 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SURF4O15260 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SURF4O15260 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SURF4O15260 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SURF4O15260 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SURF4O15260 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SURF4O15260 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SURF4O15260 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SURF4O15260 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SURF4O15260 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SURF4O15260 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SURF4O15260 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SURF4O15260 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms