Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR4

DROSHA, Ribonuclease 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DROSHAQ9NRR4 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.623e-9■■■□□ 17
DROSHAQ9NRR4 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.553e-9■■■□□ 17
DROSHAQ9NRR4 RAB43-203ENST00000393305 4215 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.483e-9■■■□□ 17
DROSHAQ9NRR4 RAB43-205ENST00000393308 4193 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.363e-9■■■□□ 17
DROSHAQ9NRR4 RAB43-204ENST00000393307 4203 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.363e-9■■■□□ 17
DROSHAQ9NRR4 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.13e-6■■■□□ 17
DROSHAQ9NRR4 SYNJ2-208ENST00000640338 3959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.412e-6■■■□□ 17
DROSHAQ9NRR4 SYNJ2-201ENST00000355585 7378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.382e-6■■■□□ 17
DROSHAQ9NRR4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.825e-8■■■□□ 17
DROSHAQ9NRR4 KLF3-202ENST00000482150 517 ntTSL 221.91■■□□□ 1.15e-8■■■□□ 17
DROSHAQ9NRR4 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.945e-8■■■□□ 17
DROSHAQ9NRR4 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC49.38■■■■■ 5.54e-13■■■□□ 17
DROSHAQ9NRR4 PHF10-204ENST00000480008 4285 ntTSL 1 (best)22.79■■□□□ 1.244e-13■■■□□ 17
DROSHAQ9NRR4 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.214e-13■■■□□ 17
DROSHAQ9NRR4 RAB6A-206ENST00000540771 699 ntTSL 534.24■■■■□ 3.073e-11■■■□□ 17
DROSHAQ9NRR4 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.993e-11■■■□□ 17
DROSHAQ9NRR4 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.693e-11■■■□□ 17
DROSHAQ9NRR4 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.233e-11■■■□□ 17
DROSHAQ9NRR4 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.983e-11■■■□□ 17
DROSHAQ9NRR4 RAB6A-208ENST00000541795 1812 ntTSL 226.69■■□□□ 1.863e-11■■■□□ 17
DROSHAQ9NRR4 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.713e-11■■■□□ 17
DROSHAQ9NRR4 TRAF7-204ENST00000567645 737 ntTSL 522.47■■□□□ 1.193e-11■■■□□ 17
DROSHAQ9NRR4 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.113e-11■■■□□ 17
DROSHAQ9NRR4 SCARB1-209ENST00000545305 851 ntTSL 220.89■□□□□ 0.933e-11■■■□□ 17
DROSHAQ9NRR4 SCARB1-205ENST00000538291 5527 ntTSL 519.51■□□□□ 0.713e-11■■■□□ 17
DROSHAQ9NRR4 RAB6A-201ENST00000310653 3389 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.533e-11■■■□□ 17
DROSHAQ9NRR4 RAB6A-202ENST00000336083 3085 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.33e-11■■■□□ 17
DROSHAQ9NRR4 ANKS6-207ENST00000634393 2284 ntTSL 517.42■□□□□ 0.383e-7■■■□□ 16.9
DROSHAQ9NRR4 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.452e-7■■■□□ 16.9
DROSHAQ9NRR4 DNAJC5-202ENST00000470551 5287 ntTSL 217.43■□□□□ 0.382e-7■■■□□ 16.9
DROSHAQ9NRR4 MICALL2-212ENST00000487187 764 ntTSL 527.93■■■□□ 2.067e-7■■■□□ 16.9
DROSHAQ9NRR4 VCP-207ENST00000493886 2942 ntTSL 220.27■□□□□ 0.831e-6■■■□□ 16.9
DROSHAQ9NRR4 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.271e-6■■■□□ 16.9
DROSHAQ9NRR4 ULK1-204ENST00000540647 1211 ntTSL 230.54■■■□□ 2.481e-6■■■□□ 16.9
DROSHAQ9NRR4 DCUN1D4-209ENST00000505403 645 ntTSL 433.82■■■■□ 33e-6■■■□□ 16.9
DROSHAQ9NRR4 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.053e-6■■■□□ 16.9
DROSHAQ9NRR4 CDK19-208ENST00000497709 1117 ntTSL 323.33■■□□□ 1.333e-8■■■□□ 16.9
DROSHAQ9NRR4 CDK19-201ENST00000323817 6067 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.573e-8■■■□□ 16.9
DROSHAQ9NRR4 DAZAP1-206ENST00000587833 560 ntTSL 515.86■□□□□ 0.139e-8■■■□□ 16.9
DROSHAQ9NRR4 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC19.38■□□□□ 0.695e-10■■■□□ 16.9
DROSHAQ9NRR4 BCL6-210ENST00000496823 1138 ntTSL 321.25■□□□□ 0.999e-7■■■□□ 16.9
DROSHAQ9NRR4 BCL6-211ENST00000621333 3399 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.369e-7■■■□□ 16.9
DROSHAQ9NRR4 BCL6-202ENST00000406870 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.249e-7■■■□□ 16.9
DROSHAQ9NRR4 BCL6-209ENST00000480458 342 ntTSL 512.81□□□□□ -0.369e-7■■■□□ 16.9
DROSHAQ9NRR4 BCL6-207ENST00000470319 526 ntTSL 42.17□□□□□ -2.069e-7■■■□□ 16.9
DROSHAQ9NRR4 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.741e-7■■■□□ 16.9
DROSHAQ9NRR4 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.711e-7■■■□□ 16.9
DROSHAQ9NRR4 RARRES2-204ENST00000478771 1907 ntTSL 231.31■■■□□ 2.61e-7■■■□□ 16.9
DROSHAQ9NRR4 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.281e-7■■■□□ 16.9
DROSHAQ9NRR4 RARRES2-203ENST00000467793 583 ntTSL 325.1■■□□□ 1.611e-7■■■□□ 16.9
DROSHAQ9NRR4 GPI-206ENST00000587384 810 ntTSL 328.4■■■□□ 2.145e-6■■■□□ 16.9
DROSHAQ9NRR4 GPI-210ENST00000589504 536 ntTSL 228.08■■■□□ 2.095e-6■■■□□ 16.9
DROSHAQ9NRR4 GPI-216ENST00000592144 678 ntTSL 327.93■■■□□ 2.065e-6■■■□□ 16.9
DROSHAQ9NRR4 GPI-211ENST00000589640 571 ntTSL 426.53■■□□□ 1.845e-6■■■□□ 16.9
DROSHAQ9NRR4 GPI-214ENST00000590375 529 ntTSL 426.53■■□□□ 1.845e-6■■■□□ 16.9
DROSHAQ9NRR4 GPI-217ENST00000592277 615 ntTSL 426.41■■□□□ 1.825e-6■■■□□ 16.9
DROSHAQ9NRR4 GPI-209ENST00000589399 565 ntTSL 526.41■■□□□ 1.825e-6■■■□□ 16.9
DROSHAQ9NRR4 GPI-207ENST00000587521 557 ntTSL 518.04■□□□□ 0.485e-6■■■□□ 16.9
DROSHAQ9NRR4 GPI-215ENST00000591204 559 ntTSL 413.57□□□□□ -0.245e-6■■■□□ 16.9
DROSHAQ9NRR4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.595e-7■■■□□ 16.9
DROSHAQ9NRR4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.25e-7■■■□□ 16.9
DROSHAQ9NRR4 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.945e-7■■■□□ 16.9
DROSHAQ9NRR4 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.155e-7■■■□□ 16.9
DROSHAQ9NRR4 UBA2-210ENST00000607361 754 ntTSL 240.57■■■■■ 4.083e-9■■■□□ 16.9
DROSHAQ9NRR4 UBA2-203ENST00000586313 1458 ntTSL 234.66■■■■□ 3.143e-9■■■□□ 16.9
DROSHAQ9NRR4 UBA2-205ENST00000590048 847 ntTSL 322.76■■□□□ 1.233e-9■■■□□ 16.9
DROSHAQ9NRR4 UBA2-201ENST00000246548 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.983e-9■■■□□ 16.9
DROSHAQ9NRR4 UBA2-209ENST00000592841 344 ntTSL 22.13□□□□□ -2.073e-9■■■□□ 16.9
DROSHAQ9NRR4 NDST1-206ENST00000522491 777 ntTSL 232.02■■■□□ 2.721e-6■■■□□ 16.9
DROSHAQ9NRR4 NDST1-204ENST00000519157 576 ntTSL 530.76■■■□□ 2.511e-6■■■□□ 16.9
DROSHAQ9NRR4 NDST1-208ENST00000524161 437 ntTSL 223.88■■□□□ 1.411e-6■■■□□ 16.9
DROSHAQ9NRR4 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.863e-6■■■□□ 16.9
DROSHAQ9NRR4 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.882e-7■■■□□ 16.9
DROSHAQ9NRR4 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.862e-7■■■□□ 16.9
DROSHAQ9NRR4 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.552e-7■■■□□ 16.9
DROSHAQ9NRR4 RAB17-206ENST00000414278 1511 ntTSL 223.61■■□□□ 1.372e-7■■■□□ 16.9
DROSHAQ9NRR4 RAB17-202ENST00000392001 1792 ntTSL 1 (best)23.56■■□□□ 1.362e-7■■■□□ 16.9
DROSHAQ9NRR4 RAB17-205ENST00000411462 663 ntTSL 223.23■■□□□ 1.312e-7■■■□□ 16.9
DROSHAQ9NRR4 DPP7-211ENST00000485456 968 ntTSL 537.18■■■■□ 3.542e-9■■■□□ 16.9
DROSHAQ9NRR4 DPP7-205ENST00000472306 919 ntTSL 535.32■■■■□ 3.242e-9■■■□□ 16.9
DROSHAQ9NRR4 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.822e-9■■■□□ 16.9
DROSHAQ9NRR4 DPP7-206ENST00000473532 1144 ntTSL 526.27■■□□□ 1.82e-9■■■□□ 16.9
DROSHAQ9NRR4 GNAS-244ENST00000485673 715 ntTSL 542.88■■■■■ 4.454e-16■■■□□ 16.9
DROSHAQ9NRR4 GNAS-243ENST00000484504 662 ntTSL 242.88■■■■■ 4.454e-16■■■□□ 16.9
DROSHAQ9NRR4 GNAS-235ENST00000478585 543 ntTSL 240.41■■■■■ 4.064e-16■■■□□ 16.9
DROSHAQ9NRR4 GNAS-257ENST00000604005 693 ntTSL 340.41■■■■■ 4.064e-16■■■□□ 16.9
DROSHAQ9NRR4 GNAS-228ENST00000469431 702 ntTSL 540.41■■■■■ 4.064e-16■■■□□ 16.9
DROSHAQ9NRR4 GNAS-224ENST00000464960 986 ntTSL 239.4■■■■□ 3.94e-16■■■□□ 16.9
DROSHAQ9NRR4 GNAS-229ENST00000470512 913 ntTSL 538.73■■■■□ 3.794e-16■■■□□ 16.9
DROSHAQ9NRR4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.734e-16■■■□□ 16.9
DROSHAQ9NRR4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.734e-16■■■□□ 16.9
DROSHAQ9NRR4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.734e-16■■■□□ 16.9
DROSHAQ9NRR4 GNAS-237ENST00000480232 893 ntTSL 538.23■■■■□ 3.714e-16■■■□□ 16.9
DROSHAQ9NRR4 GNAS-233ENST00000476935 828 ntTSL 336.46■■■■□ 3.434e-16■■■□□ 16.9
DROSHAQ9NRR4 GNAS-234ENST00000477931 1663 ntTSL 1 (best)35.99■■■■□ 3.354e-16■■■□□ 16.9
DROSHAQ9NRR4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.124e-16■■■□□ 16.9
DROSHAQ9NRR4 GNAS-248ENST00000488652 953 ntTSL 532.77■■■□□ 2.844e-16■■■□□ 16.9
DROSHAQ9NRR4 GNAS-238ENST00000480975 1534 ntTSL 530.02■■■□□ 2.44e-16■■■□□ 16.9
DROSHAQ9NRR4 GNAS-226ENST00000467321 733 ntTSL 529.18■■■□□ 2.264e-16■■■□□ 16.9
DROSHAQ9NRR4 GNAS-240ENST00000481768 1903 ntTSL 1 (best)28.99■■■□□ 2.234e-16■■■□□ 16.9
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