RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480232.5

GNAS-237, Transcript of GNAS complex locus, humanhuman

TSL 5

Gene GNAS, Length 893 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNAS-237ENST00000480232 NISCHQ9Y2I1 1504 aa61.4■■■■■ 7.42
GNAS-237ENST00000480232 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa54.95■■■■■ 6.39
GNAS-237ENST00000480232 ABCC9O60706 1549 aa54.1■■■■■ 6.25
GNAS-237ENST00000480232 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa51.92■■■■■ 5.9
GNAS-237ENST00000480232 NACADO15069 1562 aa51.71■■■■■ 5.87
GNAS-237ENST00000480232 DCAF8L2P0C7V8 631 aa51.46■■■■■ 5.83
GNAS-237ENST00000480232 MYO15BQ96JP2 1530 aa51.21■■■■■ 5.79
GNAS-237ENST00000480232 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP51.07■■■■■ 5.77
GNAS-237ENST00000480232 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa50.81■■■■■ 5.72
GNAS-237ENST00000480232 UNC13AQ9UPW8 1703 aa50.76■■■■■ 5.72
GNAS-237ENST00000480232 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP50.39■■■■■ 5.66
GNAS-237ENST00000480232 BICRAQ9NZM4 1560 aa50.27■■■■■ 5.64
GNAS-237ENST00000480232 SCRIBQ14160 1630 aa50.03■■■■■ 5.6
GNAS-237ENST00000480232 DNAJC5BQ9UF47 199 aa49.93■■■■■ 5.58
GNAS-237ENST00000480232 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa49.81■■■■■ 5.56
GNAS-237ENST00000480232 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP49.03■■■■■ 5.44
GNAS-237ENST00000480232 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa48.96■■■■■ 5.43
GNAS-237ENST00000480232 CECR2Q9BXF3 1484 aa48.68■■■■■ 5.38
GNAS-237ENST00000480232 SMARCA4P51532 1647 aa47.81■■■■■ 5.24
GNAS-237ENST00000480232 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP47.69■■■■■ 5.22
GNAS-237ENST00000480232 NCAPD3P42695 1498 aa47.64■■■■■ 5.22
GNAS-237ENST00000480232 SMARCA2P51531 1590 aa47.62■■■■■ 5.21
GNAS-237ENST00000480232 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa47.6■■■■■ 5.21
GNAS-237ENST00000480232 HMGXB3Q12766 1538 aa47.46■■■■■ 5.19
GNAS-237ENST00000480232 PEG3Q9GZU2 1588 aa47.32■■■■■ 5.17
GNAS-237ENST00000480232 MROH2BQ7Z745 1585 aa47.28■■■■■ 5.16
GNAS-237ENST00000480232 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP47.25■■■■■ 5.15
GNAS-237ENST00000480232 WIZO95785 1651 aa46.81■■■■■ 5.08
GNAS-237ENST00000480232 ERCC6Q03468 1493 aa46.75■■■■■ 5.07
GNAS-237ENST00000480232 NESP48681 1621 aa46.65■■■■■ 5.06
GNAS-237ENST00000480232 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa46.56■■■■■ 5.04
GNAS-237ENST00000480232 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP46.54■■■■■ 5.04
GNAS-237ENST00000480232 CUX2O14529 1486 aa46.43■■■■■ 5.02
GNAS-237ENST00000480232 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP46.31■■■■■ 5
GNAS-237ENST00000480232 PDS5BQ9NTI5 1447 aa46.23■■■■■ 4.99
GNAS-237ENST00000480232 CADPSQ9ULU8 1353 aa46.22■■■■■ 4.99
GNAS-237ENST00000480232 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa46.2■■■■■ 4.99
GNAS-237ENST00000480232 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP46.14■■■■■ 4.98
GNAS-237ENST00000480232 CFTRP13569 1480 aa45.86■■■■■ 4.93
GNAS-237ENST00000480232 MRC2Q9UBG0 1479 aa45.8■■■■■ 4.92
GNAS-237ENST00000480232 CEP164Q9UPV0 1460 aa45.78■■■■■ 4.92
GNAS-237ENST00000480232 FANCD2Q9BXW9 1451 aa45.74■■■■■ 4.91
GNAS-237ENST00000480232 PRDM2Q13029 1718 aa45.69■■■■■ 4.9
GNAS-237ENST00000480232 CCDC88BA6NC98 1476 aa45.68■■■■■ 4.9
GNAS-237ENST00000480232 WDR62O43379 1518 aa45.66■■■■■ 4.9
GNAS-237ENST00000480232 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa45.44■■■■■ 4.86
GNAS-237ENST00000480232 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP45.29■■■■■ 4.84
GNAS-237ENST00000480232 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP44.99■■■■■ 4.79
GNAS-237ENST00000480232 ABCC8Q09428 1581 aa44.97■■■■■ 4.79
GNAS-237ENST00000480232 TOPBP1Q92547 1522 aa44.96■■■■■ 4.79
GNAS-237ENST00000480232 DNMBPQ6XZF7 1577 aa44.91■■■■■ 4.78
GNAS-237ENST00000480232 IFT140Q96RY7 1462 aa44.81■■■■■ 4.76
GNAS-237ENST00000480232 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP44.58■■■■■ 4.73
GNAS-237ENST00000480232 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP44.53■■■■■ 4.72
GNAS-237ENST00000480232 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP44.51■■■■■ 4.72
GNAS-237ENST00000480232 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP44.5■■■■■ 4.71
GNAS-237ENST00000480232 CUX1P39880 1505 aa44.41■■■■■ 4.7
GNAS-237ENST00000480232 FGD5Q6ZNL6 1462 aa44.37■■■■■ 4.69
GNAS-237ENST00000480232 OSCARQ8IYS5 282 aa44.32■■■■■ 4.69
GNAS-237ENST00000480232 SOGA1O94964 1423 aa44.32■■■■■ 4.68
GNAS-237ENST00000480232 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa44.3■■■■■ 4.68
GNAS-237ENST00000480232 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP44.27■■■■■ 4.684e-9■■■■□ 20.3
GNAS-237ENST00000480232 WDR97A6NE52 1622 aa44.23■■■■■ 4.67
GNAS-237ENST00000480232 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP44.09■■■■■ 4.65
GNAS-237ENST00000480232 CHD1O14646 1710 aa44.07■■■■■ 4.65
GNAS-237ENST00000480232 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa43.99■■■■■ 4.63
GNAS-237ENST00000480232 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP43.96■■■■■ 4.634e-6■■□□□ 11.4
GNAS-237ENST00000480232 TOP2BQ02880 1626 aa43.95■■■■■ 4.63
GNAS-237ENST00000480232 GRIN2BQ13224 1484 aa43.91■■■■■ 4.62
GNAS-237ENST00000480232 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa43.91■■■■■ 4.62
GNAS-237ENST00000480232 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa43.9■■■■■ 4.62
GNAS-237ENST00000480232 PBRM1Q86U86 1689 aa43.89■■■■■ 4.62
GNAS-237ENST00000480232 SYNJ1O43426 1573 aa43.88■■■■■ 4.62
GNAS-237ENST00000480232 FBLN2P98095 1184 aa43.87■■■■■ 4.61
GNAS-237ENST00000480232 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP43.86■■■■■ 4.61
GNAS-237ENST00000480232 GAPVD1Q14C86 1478 aa43.83■■■■■ 4.61
GNAS-237ENST00000480232 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa43.82■■■■■ 4.61
GNAS-237ENST00000480232 TRIM41Q8WV44 630 aa43.8■■■■■ 4.6
GNAS-237ENST00000480232 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa43.76■■■■■ 4.6
GNAS-237ENST00000480232 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa43.76■■■■■ 4.6
GNAS-237ENST00000480232 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa43.76■■■■■ 4.6
GNAS-237ENST00000480232 SYNJ2O15056 1496 aa43.68■■■■■ 4.58
GNAS-237ENST00000480232 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP43.67■■■■■ 4.58
GNAS-237ENST00000480232 ARHGEF11O15085 1522 aa43.67■■■■■ 4.58
GNAS-237ENST00000480232 CLASP1Q7Z460 1538 aa43.5■■■■■ 4.55
GNAS-237ENST00000480232 ADAMTS12P58397 1594 aa43.46■■■■■ 4.55
GNAS-237ENST00000480232 ERICH3Q5RHP9 1530 aa43.41■■■■■ 4.54
GNAS-237ENST00000480232 GRIN2AQ12879 1464 aa43.34■■■■■ 4.53
GNAS-237ENST00000480232 FHAD1B1AJZ9 1412 aa43.31■■■■■ 4.52
GNAS-237ENST00000480232 ARAP1Q96P48 1450 aa43.25■■■■■ 4.51
GNAS-237ENST00000480232 CYB5RLQ6IPT4 315 aa43.21■■■■■ 4.51
GNAS-237ENST00000480232 CEP170Q5SW79 1584 aa43.14■■■■■ 4.5
GNAS-237ENST00000480232 NUP160Q12769 1436 aa43.14■■■■■ 4.5
GNAS-237ENST00000480232 KIF27Q86VH2 1401 aa43.1■■■■■ 4.49
GNAS-237ENST00000480232 CUL7Q14999 1698 aa42.99■■■■■ 4.47
GNAS-237ENST00000480232 SHROOM2Q13796 1616 aa42.92■■■■■ 4.46
GNAS-237ENST00000480232 IGF1RP08069 1367 aa42.88■■■■■ 4.45
GNAS-237ENST00000480232 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa42.82■■■■■ 4.45
GNAS-237ENST00000480232 ERCC6L2Q5T890 1561 aa42.81■■■■■ 4.44
GNAS-237ENST00000480232 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa42.67■■■■■ 4.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.2 ms