RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607361.5

UBA2-210, Transcript of ubiquitin like modifier activating enzyme 2, humanhuman

TSL 2

Gene UBA2, Length 754 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA2-210ENST00000607361 NISCHQ9Y2I1 1504 aa64.3■■■■■ 7.88
UBA2-210ENST00000607361 ABCC9O60706 1549 aa58.3■■■■■ 6.92
UBA2-210ENST00000607361 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa57.83■■■■■ 6.85
UBA2-210ENST00000607361 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa55.25■■■■■ 6.44
UBA2-210ENST00000607361 DNAJC5BQ9UF47 199 aa55.02■■■■■ 6.4
UBA2-210ENST00000607361 NACADO15069 1562 aa54.76■■■■■ 6.36
UBA2-210ENST00000607361 DCAF8L2P0C7V8 631 aa54.51■■■■■ 6.32
UBA2-210ENST00000607361 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP54.23■■■■■ 6.27
UBA2-210ENST00000607361 UNC13AQ9UPW8 1703 aa54.05■■■■■ 6.24
UBA2-210ENST00000607361 MYO15BQ96JP2 1530 aa53.83■■■■■ 6.21
UBA2-210ENST00000607361 BICRAQ9NZM4 1560 aa53.7■■■■■ 6.19
UBA2-210ENST00000607361 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP53.22■■■■■ 6.11
UBA2-210ENST00000607361 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa53.02■■■■■ 6.08
UBA2-210ENST00000607361 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa52.82■■■■■ 6.05
UBA2-210ENST00000607361 SCRIBQ14160 1630 aa52.77■■■■■ 6.04
UBA2-210ENST00000607361 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa52.62■■■■■ 6.01
UBA2-210ENST00000607361 CECR2Q9BXF3 1484 aa52.52■■■■■ 6
UBA2-210ENST00000607361 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP52.4■■■■■ 5.98
UBA2-210ENST00000607361 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa50.72■■■■■ 5.71
UBA2-210ENST00000607361 NCAPD3P42695 1498 aa50.57■■■■■ 5.69
UBA2-210ENST00000607361 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa50.39■■■■■ 5.66
UBA2-210ENST00000607361 ERCC6Q03468 1493 aa50.33■■■■■ 5.65
UBA2-210ENST00000607361 CUX2O14529 1486 aa50.31■■■■■ 5.64
UBA2-210ENST00000607361 SMARCA4P51532 1647 aa50.26■■■■■ 5.64
UBA2-210ENST00000607361 SMARCA2P51531 1590 aa50.21■■■■■ 5.63
UBA2-210ENST00000607361 HMGXB3Q12766 1538 aa50.16■■■■■ 5.62
UBA2-210ENST00000607361 NESP48681 1621 aa49.98■■■■■ 5.59
UBA2-210ENST00000607361 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP49.92■■■■■ 5.58
UBA2-210ENST00000607361 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP49.89■■■■■ 5.58
UBA2-210ENST00000607361 PEG3Q9GZU2 1588 aa49.72■■■■■ 5.55
UBA2-210ENST00000607361 MROH2BQ7Z745 1585 aa49.58■■■■■ 5.53
UBA2-210ENST00000607361 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP49.52■■■■■ 5.52
UBA2-210ENST00000607361 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa49.49■■■■■ 5.51
UBA2-210ENST00000607361 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa49.31■■■■■ 5.48
UBA2-210ENST00000607361 PDS5BQ9NTI5 1447 aa49.21■■■■■ 5.47
UBA2-210ENST00000607361 CADPSQ9ULU8 1353 aa49.02■■■■■ 5.44
UBA2-210ENST00000607361 WIZO95785 1651 aa48.98■■■■■ 5.43
UBA2-210ENST00000607361 MRC2Q9UBG0 1479 aa48.85■■■■■ 5.41
UBA2-210ENST00000607361 WDR62O43379 1518 aa48.73■■■■■ 5.39
UBA2-210ENST00000607361 CEP164Q9UPV0 1460 aa48.58■■■■■ 5.37
UBA2-210ENST00000607361 FANCD2Q9BXW9 1451 aa48.5■■■■■ 5.35
UBA2-210ENST00000607361 TRIM41Q8WV44 630 aa48.44■■■■■ 5.34
UBA2-210ENST00000607361 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP48.41■■■■■ 5.34
UBA2-210ENST00000607361 CFTRP13569 1480 aa48.39■■■■■ 5.34
UBA2-210ENST00000607361 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP48.3■■■■■ 5.32
UBA2-210ENST00000607361 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP48.15■■■■■ 5.3
UBA2-210ENST00000607361 OSCARQ8IYS5 282 aa47.96■■■■■ 5.27
UBA2-210ENST00000607361 PRDM2Q13029 1718 aa47.87■■■■■ 5.25
UBA2-210ENST00000607361 CCDC88BA6NC98 1476 aa47.78■■■■■ 5.24
UBA2-210ENST00000607361 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP47.63■■■■■ 5.22
UBA2-210ENST00000607361 IFT140Q96RY7 1462 aa47.6■■■■■ 5.21
UBA2-210ENST00000607361 TOPBP1Q92547 1522 aa47.55■■■■■ 5.2
UBA2-210ENST00000607361 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa47.43■■■■■ 5.18
UBA2-210ENST00000607361 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa47.43■■■■■ 5.18
UBA2-210ENST00000607361 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa47.43■■■■■ 5.18
UBA2-210ENST00000607361 ABCC8Q09428 1581 aa47.34■■■■■ 5.17
UBA2-210ENST00000607361 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP47.33■■■■■ 5.17
UBA2-210ENST00000607361 DNMBPQ6XZF7 1577 aa47.32■■■■■ 5.17
UBA2-210ENST00000607361 ARHGEF11O15085 1522 aa47.24■■■■■ 5.15
UBA2-210ENST00000607361 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP47.15■■■■■ 5.14
UBA2-210ENST00000607361 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP47.14■■■■■ 5.143e-9■■■■□ 20.7
UBA2-210ENST00000607361 CHD1O14646 1710 aa47.05■■■■■ 5.12
UBA2-210ENST00000607361 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP47.04■■■■■ 5.12
UBA2-210ENST00000607361 FBLN2P98095 1184 aa46.93■■■■■ 5.1
UBA2-210ENST00000607361 CYB5RLQ6IPT4 315 aa46.92■■■■■ 5.1
UBA2-210ENST00000607361 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa46.91■■■■■ 5.1
UBA2-210ENST00000607361 SOGA1O94964 1423 aa46.8■■■■■ 5.08
UBA2-210ENST00000607361 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP46.8■■■■■ 5.08
UBA2-210ENST00000607361 ARAP1Q96P48 1450 aa46.76■■■■■ 5.08
UBA2-210ENST00000607361 FGD5Q6ZNL6 1462 aa46.7■■■■■ 5.07
UBA2-210ENST00000607361 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa46.65■■■■■ 5.06
UBA2-210ENST00000607361 CUX1P39880 1505 aa46.61■■■■■ 5.05
UBA2-210ENST00000607361 WDR97A6NE52 1622 aa46.56■■■■■ 5.04
UBA2-210ENST00000607361 TRHP20396 242 aaPredicted RBP46.53■■■■■ 5.04
UBA2-210ENST00000607361 CLASP1Q7Z460 1538 aa46.49■■■■■ 5.03
UBA2-210ENST00000607361 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP46.47■■■■■ 5.03
UBA2-210ENST00000607361 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP46.45■■■■■ 5.03
UBA2-210ENST00000607361 GRIN2BQ13224 1484 aa46.43■■■■■ 5.02
UBA2-210ENST00000607361 SYNJ1O43426 1573 aa46.4■■■■■ 5.02
UBA2-210ENST00000607361 SYNJ2O15056 1496 aa46.32■■■■■ 5.01
UBA2-210ENST00000607361 PBRM1Q86U86 1689 aa46.25■■■■■ 4.99
UBA2-210ENST00000607361 GAPVD1Q14C86 1478 aa46.23■■■■■ 4.99
UBA2-210ENST00000607361 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa46.12■■■■■ 4.97
UBA2-210ENST00000607361 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa46.1■■■■■ 4.97
UBA2-210ENST00000607361 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP46.05■■■■■ 4.96
UBA2-210ENST00000607361 GRIN2AQ12879 1464 aa45.86■■■■■ 4.93
UBA2-210ENST00000607361 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP45.86■■■■■ 4.934e-7■□□□□ 9.1
UBA2-210ENST00000607361 ADAMTS12P58397 1594 aa45.79■■■■■ 4.92
UBA2-210ENST00000607361 ERCC6L2Q5T890 1561 aa45.79■■■■■ 4.92
UBA2-210ENST00000607361 CEP170Q5SW79 1584 aa45.73■■■■■ 4.91
UBA2-210ENST00000607361 TOP2BQ02880 1626 aa45.73■■■■■ 4.91
UBA2-210ENST00000607361 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa45.73■■■■■ 4.91
UBA2-210ENST00000607361 NUP160Q12769 1436 aa45.69■■■■■ 4.91
UBA2-210ENST00000607361 FHAD1B1AJZ9 1412 aa45.61■■■■■ 4.89
UBA2-210ENST00000607361 SHROOM2Q13796 1616 aa45.54■■■■■ 4.88
UBA2-210ENST00000607361 ERICH3Q5RHP9 1530 aa45.52■■■■■ 4.88
UBA2-210ENST00000607361 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP45.42■■■■■ 4.86
UBA2-210ENST00000607361 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP45.32■■■■■ 4.85
UBA2-210ENST00000607361 JPH4Q96JJ6 628 aa45.22■■■■■ 4.83
UBA2-210ENST00000607361 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa45.16■■■■■ 4.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.8 ms