RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477931.5

GNAS-234, Transcript of GNAS complex locus, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene GNAS, Length 1,663 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNAS-234ENST00000477931 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.27■■■■■ 6.6
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GNAS-234ENST00000477931 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.95■■■■■ 5.11
GNAS-234ENST00000477931 NACADO15069 1562 aa46.64■■■■■ 5.06
GNAS-234ENST00000477931 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.59■■■■■ 5.05
GNAS-234ENST00000477931 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.49■■■■■ 5.03
GNAS-234ENST00000477931 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.46■■■■■ 5.03
GNAS-234ENST00000477931 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.61■■■■■ 4.89
GNAS-234ENST00000477931 SCRIBQ14160 1630 aa45.53■■■■■ 4.88
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GNAS-234ENST00000477931 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa44.93■■■■■ 4.78
GNAS-234ENST00000477931 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP43.96■■■■■ 4.63
GNAS-234ENST00000477931 DNAJC5BQ9UF47 199 aa43.96■■■■■ 4.63
GNAS-234ENST00000477931 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.85■■■■■ 4.61
GNAS-234ENST00000477931 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.68■■■■■ 4.58
GNAS-234ENST00000477931 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.54■■■■■ 4.56
GNAS-234ENST00000477931 SMARCA4P51532 1647 aa43.54■■■■■ 4.56
GNAS-234ENST00000477931 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.42■■■■■ 4.54
GNAS-234ENST00000477931 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.2■■■■■ 4.51
GNAS-234ENST00000477931 SMARCA2P51531 1590 aa43.12■■■■■ 4.49
GNAS-234ENST00000477931 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.1■■■■■ 4.49
GNAS-234ENST00000477931 NCAPD3P42695 1498 aa43.06■■■■■ 4.48
GNAS-234ENST00000477931 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.05■■■■■ 4.48
GNAS-234ENST00000477931 WIZO95785 1651 aa43■■■■■ 4.47
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GNAS-234ENST00000477931 HMGXB3Q12766 1538 aa42.85■■■■■ 4.45
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GNAS-234ENST00000477931 NESP48681 1621 aa41.97■■■■■ 4.31
GNAS-234ENST00000477931 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.87■■■■■ 4.29
GNAS-234ENST00000477931 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.82■■■■■ 4.29
GNAS-234ENST00000477931 CFTRP13569 1480 aa41.7■■■■■ 4.27
GNAS-234ENST00000477931 ERCC6Q03468 1493 aa41.56■■■■■ 4.24
GNAS-234ENST00000477931 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.55■■■■■ 4.24
GNAS-234ENST00000477931 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.44■■■■■ 4.22
GNAS-234ENST00000477931 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.39■■■■■ 4.22
GNAS-234ENST00000477931 PRDM2Q13029 1718 aa41.39■■■■■ 4.22
GNAS-234ENST00000477931 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.27■■■■■ 4.2
GNAS-234ENST00000477931 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.12■■■■■ 4.17
GNAS-234ENST00000477931 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.09■■■■■ 4.17
GNAS-234ENST00000477931 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.95■■■■■ 4.15
GNAS-234ENST00000477931 WDR62O43379 1518 aa40.91■■■■■ 4.14
GNAS-234ENST00000477931 CUX2O14529 1486 aa40.85■■■■■ 4.13
GNAS-234ENST00000477931 TOPBP1Q92547 1522 aa40.79■■■■■ 4.12
GNAS-234ENST00000477931 ABCC8Q09428 1581 aa40.75■■■■■ 4.11
GNAS-234ENST00000477931 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.74■■■■■ 4.11
GNAS-234ENST00000477931 CUX1P39880 1505 aa40.69■■■■■ 4.1
GNAS-234ENST00000477931 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.61■■■■■ 4.094e-6■■□□□ 11.4
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GNAS-234ENST00000477931 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.47■■■■■ 4.07
GNAS-234ENST00000477931 TOP2BQ02880 1626 aa40.43■■■■■ 4.06
GNAS-234ENST00000477931 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.42■■■■■ 4.06
GNAS-234ENST00000477931 IFT140Q96RY7 1462 aa40.37■■■■■ 4.05
GNAS-234ENST00000477931 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.36■■■■■ 4.05
GNAS-234ENST00000477931 SOGA1O94964 1423 aa40.35■■■■■ 4.05
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GNAS-234ENST00000477931 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.11■■■■■ 4.01
GNAS-234ENST00000477931 TRIM41Q8WV44 630 aa40.1■■■■■ 4.01
GNAS-234ENST00000477931 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.08■■■■■ 4.016e-9■■■■□ 21.8
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GNAS-234ENST00000477931 WDR97A6NE52 1622 aa40.05■■■■■ 4
GNAS-234ENST00000477931 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.02■■■■■ 4
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GNAS-234ENST00000477931 GRIN2BQ13224 1484 aa39.77■■■■□ 3.96
GNAS-234ENST00000477931 PBRM1Q86U86 1689 aa39.73■■■■□ 3.95
GNAS-234ENST00000477931 KIF27Q86VH2 1401 aa39.71■■■■□ 3.95
GNAS-234ENST00000477931 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.67■■■■□ 3.94
GNAS-234ENST00000477931 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.62■■■■□ 3.93
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GNAS-234ENST00000477931 IGF1RP08069 1367 aa39.53■■■■□ 3.92
GNAS-234ENST00000477931 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.48■■■■□ 3.91
GNAS-234ENST00000477931 CHD1O14646 1710 aa39.46■■■■□ 3.91
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GNAS-234ENST00000477931 CSRNP3Q8WYN3 585 aa39.25■■■■□ 3.87
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GNAS-234ENST00000477931 PRXQ9BXM0 1461 aa39.07■■■■□ 3.85
GNAS-234ENST00000477931 CEP170Q5SW79 1584 aa39.07■■■■□ 3.84
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GNAS-234ENST00000477931 CLASP1Q7Z460 1538 aa38.99■■■■□ 3.83
GNAS-234ENST00000477931 EHMT2Q96KQ7 1210 aa38.86■■■■□ 3.81
GNAS-234ENST00000477931 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa38.82■■■■□ 3.81
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