RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484504.5

GNAS-243, Transcript of GNAS complex locus, humanhuman

TSL 2

Gene GNAS, Length 662 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNAS-243ENST00000484504 NISCHQ9Y2I1 1504 aa67.79■■■■■ 8.44
GNAS-243ENST00000484504 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa60.27■■■■■ 7.24
GNAS-243ENST00000484504 ABCC9O60706 1549 aa58.83■■■■■ 7.01
GNAS-243ENST00000484504 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa56.69■■■■■ 6.67
GNAS-243ENST00000484504 NACADO15069 1562 aa56.66■■■■■ 6.66
GNAS-243ENST00000484504 DCAF8L2P0C7V8 631 aa56.57■■■■■ 6.65
GNAS-243ENST00000484504 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP56.46■■■■■ 6.63
GNAS-243ENST00000484504 MYO15BQ96JP2 1530 aa56.38■■■■■ 6.62
GNAS-243ENST00000484504 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa56.14■■■■■ 6.58
GNAS-243ENST00000484504 UNC13AQ9UPW8 1703 aa55.39■■■■■ 6.46
GNAS-243ENST00000484504 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP54.98■■■■■ 6.39
GNAS-243ENST00000484504 BICRAQ9NZM4 1560 aa54.94■■■■■ 6.39
GNAS-243ENST00000484504 SCRIBQ14160 1630 aa54.92■■■■■ 6.38
GNAS-243ENST00000484504 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa54.45■■■■■ 6.31
GNAS-243ENST00000484504 DNAJC5BQ9UF47 199 aa53.96■■■■■ 6.23
GNAS-243ENST00000484504 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP53.49■■■■■ 6.15
GNAS-243ENST00000484504 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa53.26■■■■■ 6.12
GNAS-243ENST00000484504 CECR2Q9BXF3 1484 aa52.89■■■■■ 6.06
GNAS-243ENST00000484504 SMARCA4P51532 1647 aa52.57■■■■■ 6.01
GNAS-243ENST00000484504 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP52.55■■■■■ 6
GNAS-243ENST00000484504 NCAPD3P42695 1498 aa52.28■■■■■ 5.96
GNAS-243ENST00000484504 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa52.28■■■■■ 5.96
GNAS-243ENST00000484504 SMARCA2P51531 1590 aa52.25■■■■■ 5.95
GNAS-243ENST00000484504 MROH2BQ7Z745 1585 aa52.21■■■■■ 5.95
GNAS-243ENST00000484504 PEG3Q9GZU2 1588 aa52.1■■■■■ 5.93
GNAS-243ENST00000484504 HMGXB3Q12766 1538 aa52.01■■■■■ 5.92
GNAS-243ENST00000484504 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP51.85■■■■■ 5.89
GNAS-243ENST00000484504 WIZO95785 1651 aa51.65■■■■■ 5.86
GNAS-243ENST00000484504 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP51.65■■■■■ 5.86
GNAS-243ENST00000484504 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP51.13■■■■■ 5.77
GNAS-243ENST00000484504 NESP48681 1621 aa50.92■■■■■ 5.74
GNAS-243ENST00000484504 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa50.88■■■■■ 5.74
GNAS-243ENST00000484504 CADPSQ9ULU8 1353 aa50.75■■■■■ 5.71
GNAS-243ENST00000484504 ERCC6Q03468 1493 aa50.73■■■■■ 5.71
GNAS-243ENST00000484504 PDS5BQ9NTI5 1447 aa50.55■■■■■ 5.68
GNAS-243ENST00000484504 CCDC88BA6NC98 1476 aa50.52■■■■■ 5.68
GNAS-243ENST00000484504 CFTRP13569 1480 aa50.46■■■■■ 5.67
GNAS-243ENST00000484504 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa50.35■■■■■ 5.65
GNAS-243ENST00000484504 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP50.35■■■■■ 5.65
GNAS-243ENST00000484504 CUX2O14529 1486 aa50.22■■■■■ 5.63
GNAS-243ENST00000484504 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP50.17■■■■■ 5.62
GNAS-243ENST00000484504 FANCD2Q9BXW9 1451 aa50.13■■■■■ 5.62
GNAS-243ENST00000484504 PRDM2Q13029 1718 aa50.1■■■■■ 5.61
GNAS-243ENST00000484504 CEP164Q9UPV0 1460 aa50.07■■■■■ 5.61
GNAS-243ENST00000484504 MRC2Q9UBG0 1479 aa49.99■■■■■ 5.59
GNAS-243ENST00000484504 WDR62O43379 1518 aa49.82■■■■■ 5.57
GNAS-243ENST00000484504 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP49.61■■■■■ 5.53
GNAS-243ENST00000484504 ABCC8Q09428 1581 aa49.41■■■■■ 5.5
GNAS-243ENST00000484504 TOPBP1Q92547 1522 aa49.34■■■■■ 5.49
GNAS-243ENST00000484504 DNMBPQ6XZF7 1577 aa49.3■■■■■ 5.48
GNAS-243ENST00000484504 IFT140Q96RY7 1462 aa49.04■■■■■ 5.44
GNAS-243ENST00000484504 CUX1P39880 1505 aa48.98■■■■■ 5.43
GNAS-243ENST00000484504 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP48.92■■■■■ 5.42
GNAS-243ENST00000484504 FGD5Q6ZNL6 1462 aa48.8■■■■■ 5.4
GNAS-243ENST00000484504 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP48.8■■■■■ 5.4
GNAS-243ENST00000484504 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa48.79■■■■■ 5.4
GNAS-243ENST00000484504 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP48.76■■■■■ 5.4
GNAS-243ENST00000484504 SOGA1O94964 1423 aa48.75■■■■■ 5.39
GNAS-243ENST00000484504 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP48.7■■■■■ 5.394e-6■■□□□ 11.4
GNAS-243ENST00000484504 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa48.68■■■■■ 5.38
GNAS-243ENST00000484504 TOP2BQ02880 1626 aa48.61■■■■■ 5.37
GNAS-243ENST00000484504 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa48.6■■■■■ 5.37
GNAS-243ENST00000484504 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP48.58■■■■■ 5.37
GNAS-243ENST00000484504 SYNJ1O43426 1573 aa48.55■■■■■ 5.36
GNAS-243ENST00000484504 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP48.51■■■■■ 5.362e-10■■■■■ 32.6
GNAS-243ENST00000484504 WDR97A6NE52 1622 aa48.49■■■■■ 5.35
GNAS-243ENST00000484504 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP48.43■■■■■ 5.34
GNAS-243ENST00000484504 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa48.37■■■■■ 5.33
GNAS-243ENST00000484504 GAPVD1Q14C86 1478 aa48.18■■■■■ 5.3
GNAS-243ENST00000484504 GRIN2BQ13224 1484 aa48.17■■■■■ 5.3
GNAS-243ENST00000484504 OSCARQ8IYS5 282 aa48.17■■■■■ 5.3
GNAS-243ENST00000484504 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa48.15■■■■■ 5.3
GNAS-243ENST00000484504 PBRM1Q86U86 1689 aa48.06■■■■■ 5.28
GNAS-243ENST00000484504 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa48.06■■■■■ 5.28
GNAS-243ENST00000484504 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP48.04■■■■■ 5.28
GNAS-243ENST00000484504 CHD1O14646 1710 aa47.98■■■■■ 5.27
GNAS-243ENST00000484504 FBLN2P98095 1184 aa47.91■■■■■ 5.26
GNAS-243ENST00000484504 SYNJ2O15056 1496 aa47.85■■■■■ 5.25
GNAS-243ENST00000484504 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP47.84■■■■■ 5.25
GNAS-243ENST00000484504 ERICH3Q5RHP9 1530 aa47.81■■■■■ 5.24
GNAS-243ENST00000484504 KIF27Q86VH2 1401 aa47.7■■■■■ 5.23
GNAS-243ENST00000484504 ADAMTS12P58397 1594 aa47.68■■■■■ 5.22
GNAS-243ENST00000484504 FHAD1B1AJZ9 1412 aa47.64■■■■■ 5.22
GNAS-243ENST00000484504 TRIM41Q8WV44 630 aa47.61■■■■■ 5.21
GNAS-243ENST00000484504 GRIN2AQ12879 1464 aa47.53■■■■■ 5.2
GNAS-243ENST00000484504 IGF1RP08069 1367 aa47.5■■■■■ 5.2
GNAS-243ENST00000484504 CLASP1Q7Z460 1538 aa47.46■■■■■ 5.19
GNAS-243ENST00000484504 CUL7Q14999 1698 aa47.38■■■■■ 5.17
GNAS-243ENST00000484504 NUP160Q12769 1436 aa47.34■■■■■ 5.17
GNAS-243ENST00000484504 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa47.34■■■■■ 5.17
GNAS-243ENST00000484504 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa47.34■■■■■ 5.17
GNAS-243ENST00000484504 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa47.34■■■■■ 5.17
GNAS-243ENST00000484504 ARHGEF11O15085 1522 aa47.33■■■■■ 5.17
GNAS-243ENST00000484504 CEP170Q5SW79 1584 aa47.28■■■■■ 5.16
GNAS-243ENST00000484504 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa47.23■■■■■ 5.15
GNAS-243ENST00000484504 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa47.23■■■■■ 5.15
GNAS-243ENST00000484504 CHIC1Q5VXU3 224 aa47.06■■■■■ 5.12
GNAS-243ENST00000484504 SHROOM2Q13796 1616 aa46.97■■■■■ 5.11
GNAS-243ENST00000484504 ARAP1Q96P48 1450 aa46.95■■■■■ 5.11
GNAS-243ENST00000484504 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa46.95■■■■■ 5.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.4 ms