RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476935.5

GNAS-233, Transcript of GNAS complex locus, humanhuman

TSL 3

Gene GNAS, Length 828 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNAS-233ENST00000476935 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.61■■■■■ 6.97
GNAS-233ENST00000476935 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa52.36■■■■■ 5.97
GNAS-233ENST00000476935 ABCC9O60706 1549 aa51.71■■■■■ 5.87
GNAS-233ENST00000476935 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.54■■■■■ 5.52
GNAS-233ENST00000476935 NACADO15069 1562 aa49.36■■■■■ 5.49
GNAS-233ENST00000476935 DCAF8L2P0C7V8 631 aa49.19■■■■■ 5.47
GNAS-233ENST00000476935 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.92■■■■■ 5.42
GNAS-233ENST00000476935 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.67■■■■■ 5.38
GNAS-233ENST00000476935 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa48.49■■■■■ 5.35
GNAS-233ENST00000476935 UNC13AQ9UPW8 1703 aa48.43■■■■■ 5.34
GNAS-233ENST00000476935 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP48.24■■■■■ 5.31
GNAS-233ENST00000476935 BICRAQ9NZM4 1560 aa48.05■■■■■ 5.28
GNAS-233ENST00000476935 DNAJC5BQ9UF47 199 aa48.01■■■■■ 5.28
GNAS-233ENST00000476935 SCRIBQ14160 1630 aa47.67■■■■■ 5.22
GNAS-233ENST00000476935 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.53■■■■■ 5.2
GNAS-233ENST00000476935 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.82■■■■■ 5.09
GNAS-233ENST00000476935 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.77■■■■■ 5.08
GNAS-233ENST00000476935 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.55■■■■■ 5.04
GNAS-233ENST00000476935 SMARCA4P51532 1647 aa45.59■■■■■ 4.89
GNAS-233ENST00000476935 NCAPD3P42695 1498 aa45.56■■■■■ 4.88
GNAS-233ENST00000476935 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.48■■■■■ 4.87
GNAS-233ENST00000476935 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP45.46■■■■■ 4.87
GNAS-233ENST00000476935 SMARCA2P51531 1590 aa45.41■■■■■ 4.86
GNAS-233ENST00000476935 HMGXB3Q12766 1538 aa45.26■■■■■ 4.84
GNAS-233ENST00000476935 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.17■■■■■ 4.82
GNAS-233ENST00000476935 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.14■■■■■ 4.82
GNAS-233ENST00000476935 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP45.06■■■■■ 4.8
GNAS-233ENST00000476935 WIZO95785 1651 aa44.63■■■■■ 4.73
GNAS-233ENST00000476935 ERCC6Q03468 1493 aa44.62■■■■■ 4.73
GNAS-233ENST00000476935 NESP48681 1621 aa44.59■■■■■ 4.73
GNAS-233ENST00000476935 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.44■■■■■ 4.71
GNAS-233ENST00000476935 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.43■■■■■ 4.7
GNAS-233ENST00000476935 CUX2O14529 1486 aa44.39■■■■■ 4.7
GNAS-233ENST00000476935 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.2■■■■■ 4.67
GNAS-233ENST00000476935 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.17■■■■■ 4.66
GNAS-233ENST00000476935 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP44.12■■■■■ 4.65
GNAS-233ENST00000476935 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.07■■■■■ 4.64
GNAS-233ENST00000476935 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44.04■■■■■ 4.64
GNAS-233ENST00000476935 CFTRP13569 1480 aa43.82■■■■■ 4.6
GNAS-233ENST00000476935 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.71■■■■■ 4.59
GNAS-233ENST00000476935 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.71■■■■■ 4.59
GNAS-233ENST00000476935 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.67■■■■■ 4.58
GNAS-233ENST00000476935 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.66■■■■■ 4.58
GNAS-233ENST00000476935 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.62■■■■■ 4.57
GNAS-233ENST00000476935 WDR62O43379 1518 aa43.59■■■■■ 4.57
GNAS-233ENST00000476935 PRDM2Q13029 1718 aa43.46■■■■■ 4.55
GNAS-233ENST00000476935 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP43.26■■■■■ 4.52
GNAS-233ENST00000476935 ABCC8Q09428 1581 aa42.93■■■■■ 4.46
GNAS-233ENST00000476935 TOPBP1Q92547 1522 aa42.92■■■■■ 4.46
GNAS-233ENST00000476935 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.89■■■■■ 4.46
GNAS-233ENST00000476935 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.82■■■■■ 4.44
GNAS-233ENST00000476935 IFT140Q96RY7 1462 aa42.79■■■■■ 4.44
GNAS-233ENST00000476935 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.61■■■■■ 4.41
GNAS-233ENST00000476935 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.5■■■■■ 4.39
GNAS-233ENST00000476935 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.49■■■■■ 4.39
GNAS-233ENST00000476935 OSCARQ8IYS5 282 aa42.49■■■■■ 4.39
GNAS-233ENST00000476935 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.41■■■■■ 4.38
GNAS-233ENST00000476935 CUX1P39880 1505 aa42.37■■■■■ 4.37
GNAS-233ENST00000476935 SOGA1O94964 1423 aa42.35■■■■■ 4.37
GNAS-233ENST00000476935 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.32■■■■■ 4.371e-9■■■□□ 16.6
GNAS-233ENST00000476935 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.32■■■■■ 4.37
GNAS-233ENST00000476935 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.32■■■■■ 4.37
GNAS-233ENST00000476935 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.15■■■■■ 4.34
GNAS-233ENST00000476935 WDR97A6NE52 1622 aa42.15■■■■■ 4.34
GNAS-233ENST00000476935 CHD1O14646 1710 aa42.01■■■■■ 4.32
GNAS-233ENST00000476935 TRIM41Q8WV44 630 aa41.96■■■■■ 4.31
GNAS-233ENST00000476935 FBLN2P98095 1184 aa41.93■■■■■ 4.3
GNAS-233ENST00000476935 GRIN2BQ13224 1484 aa41.92■■■■■ 4.3
GNAS-233ENST00000476935 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.91■■■■■ 4.33e-6■□□□□ 10.3
GNAS-233ENST00000476935 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.9■■■■■ 4.3
GNAS-233ENST00000476935 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.9■■■■■ 4.3
GNAS-233ENST00000476935 TOP2BQ02880 1626 aa41.88■■■■■ 4.3
GNAS-233ENST00000476935 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.88■■■■■ 4.3
GNAS-233ENST00000476935 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.86■■■■■ 4.29
GNAS-233ENST00000476935 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.85■■■■■ 4.29
GNAS-233ENST00000476935 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.81■■■■■ 4.28
GNAS-233ENST00000476935 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.81■■■■■ 4.28
GNAS-233ENST00000476935 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.81■■■■■ 4.28
GNAS-233ENST00000476935 SYNJ1O43426 1573 aa41.8■■■■■ 4.28
GNAS-233ENST00000476935 PBRM1Q86U86 1689 aa41.77■■■■■ 4.28
GNAS-233ENST00000476935 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.77■■■■■ 4.28
GNAS-233ENST00000476935 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.76■■■■■ 4.28
GNAS-233ENST00000476935 ARHGEF11O15085 1522 aa41.74■■■■■ 4.27
GNAS-233ENST00000476935 SYNJ2O15056 1496 aa41.7■■■■■ 4.27
GNAS-233ENST00000476935 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.54■■■■■ 4.24
GNAS-233ENST00000476935 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.41■■■■■ 4.22
GNAS-233ENST00000476935 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.4■■■■■ 4.22
GNAS-233ENST00000476935 ADAMTS12P58397 1594 aa41.39■■■■■ 4.22
GNAS-233ENST00000476935 ARAP1Q96P48 1450 aa41.36■■■■■ 4.21
GNAS-233ENST00000476935 GRIN2AQ12879 1464 aa41.35■■■■■ 4.21
GNAS-233ENST00000476935 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.35■■■■■ 4.21
GNAS-233ENST00000476935 NUP160Q12769 1436 aa41.21■■■■■ 4.19
GNAS-233ENST00000476935 CEP170Q5SW79 1584 aa41.16■■■■■ 4.18
GNAS-233ENST00000476935 KIF27Q86VH2 1401 aa41.1■■■■■ 4.17
GNAS-233ENST00000476935 IGF1RP08069 1367 aa41■■■■■ 4.15
GNAS-233ENST00000476935 SHROOM2Q13796 1616 aa40.96■■■■■ 4.15
GNAS-233ENST00000476935 CUL7Q14999 1698 aa40.91■■■■■ 4.14
GNAS-233ENST00000476935 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.91■■■■■ 4.14
GNAS-233ENST00000476935 JPH4Q96JJ6 628 aa40.82■■■■■ 4.13
GNAS-233ENST00000476935 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.79■■■■■ 4.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 80.1 ms