Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 MACF1-203ENST00000361689 17538 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.665e-8■■■■■ 31.3
PCBP2Q15366 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.775e-8■■■■■ 31.3
PCBP2Q15366 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.041e-6■■■■■ 31.3
PCBP2Q15366 MAP4K3-206ENST00000437968 500 ntTSL 524.95■■□□□ 1.588e-7■■■■■ 31.3
PCBP2Q15366 MAP4K3-204ENST00000429397 689 ntTSL 322.66■■□□□ 1.228e-7■■■■■ 31.3
PCBP2Q15366 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.228e-7■■■■■ 31.3
PCBP2Q15366 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.218e-7■■■■■ 31.3
PCBP2Q15366 PIP4K2B-202ENST00000617499 547 ntTSL 416.16■□□□□ 0.181e-6■■■■■ 31.3
PCBP2Q15366 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.772e-6■■■■■ 31.3
PCBP2Q15366 BX322557.1-201ENST00000454115 389 ntTSL 1 (best)17.65■□□□□ 0.422e-6■■■■■ 31.3
PCBP2Q15366 PLXNB2-212ENST00000496720 913 ntTSL 316.39■□□□□ 0.211e-6■■■■■ 31.3
PCBP2Q15366 PLXNB2-202ENST00000411680 704 ntTSL 215.88■□□□□ 0.131e-6■■■■■ 31.3
PCBP2Q15366 GREB1-204ENST00000381486 8484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.65e-7■■■■■ 31.3
PCBP2Q15366 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.564e-6■■■■■ 31.3
PCBP2Q15366 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.544e-6■■■■■ 31.3
PCBP2Q15366 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.394e-6■■■■■ 31.3
PCBP2Q15366 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.214e-6■■■■■ 31.3
PCBP2Q15366 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.024e-6■■■■■ 31.3
PCBP2Q15366 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.224e-6■■■■■ 31.3
PCBP2Q15366 AC105036.3-202ENST00000565138 674 ntTSL 313.19□□□□□ -0.34e-6■■■■■ 31.3
PCBP2Q15366 AC105036.3-203ENST00000567875 652 ntTSL 213.19□□□□□ -0.34e-6■■■■■ 31.3
PCBP2Q15366 COBL-208ENST00000452534 1842 ntTSL 512.2□□□□□ -0.464e-6■■■■■ 31.3
PCBP2Q15366 EXTL3-214ENST00000523271 8257 ntTSL 211.89□□□□□ -0.514e-6■■■■■ 31.3
PCBP2Q15366 AC105036.3-204ENST00000568707 789 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.534e-6■■■■■ 31.3
PCBP2Q15366 AC105036.3-201ENST00000566032 583 ntTSL 210.56□□□□□ -0.724e-6■■■■■ 31.3
PCBP2Q15366 COBL-204ENST00000431948 4780 ntTSL 1 (best)9.83□□□□□ -0.844e-6■■■■■ 31.3
PCBP2Q15366 EXTL3-206ENST00000519886 803 ntTSL 39.12□□□□□ -0.954e-6■■■■■ 31.3
PCBP2Q15366 COBL-206ENST00000445054 4660 ntTSL 1 (best)8.52□□□□□ -1.054e-6■■■■■ 31.3
PCBP2Q15366 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.337e-7■■■■■ 31.3
PCBP2Q15366 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.137e-7■■■■■ 31.3
PCBP2Q15366 SEC24D-209ENST00000509818 1870 ntTSL 1 (best)8.93□□□□□ -0.983e-8■■■■■ 31.3
PCBP2Q15366 BRIP1-202ENST00000577598 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.432e-6■■■■■ 31.3
PCBP2Q15366 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.081e-6■■■■■ 31.3
PCBP2Q15366 SNX30-203ENST00000604751 4068 ntTSL 27.75□□□□□ -1.171e-6■■■■■ 31.3
PCBP2Q15366 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.554e-7■■■■■ 31.3
PCBP2Q15366 ACSS3-203ENST00000548058 9254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.664e-7■■■■■ 31.3
PCBP2Q15366 ACSS3-204ENST00000548324 2214 ntTSL 29.47□□□□□ -0.894e-7■■■■■ 31.3
PCBP2Q15366 ACSS3-202ENST00000546664 379 ntTSL 54.87□□□□□ -1.634e-7■■■■■ 31.3
PCBP2Q15366 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.294e-8■■■■■ 31.2
PCBP2Q15366 DIP2B-204ENST00000549620 2676 ntTSL 1 (best)18.62■□□□□ 0.579e-7■■■■■ 31.2
PCBP2Q15366 DIP2B-201ENST00000301180 8593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.229e-7■■■■■ 31.2
PCBP2Q15366 SH3BP4-204ENST00000416021 593 ntTSL 319.94■□□□□ 0.789e-7■■■■■ 31.2
PCBP2Q15366 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.289e-7■■■■■ 31.2
PCBP2Q15366 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.354e-8■■■■■ 31.2
PCBP2Q15366 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.224e-8■■■■■ 31.2
PCBP2Q15366 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.154e-8■■■■■ 31.2
PCBP2Q15366 ATXN2-226ENST00000608853 4376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.514e-8■■■■■ 31.2
PCBP2Q15366 ATXN2-210ENST00000483311 4159 ntTSL 1 (best)11.43□□□□□ -0.584e-8■■■■■ 31.2
PCBP2Q15366 ATXN2-214ENST00000535949 3205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.274e-8■■■■■ 31.2
PCBP2Q15366 ATXN2-202ENST00000389153 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.494e-8■■■■■ 31.2
PCBP2Q15366 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.54e-8■■■■■ 31.2
PCBP2Q15366 KCTD13-201ENST00000308768 1685 ntTSL 221.24■□□□□ 0.994e-9■■■■■ 31.2
PCBP2Q15366 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.794e-9■■■■■ 31.2
PCBP2Q15366 KCTD13-206ENST00000566842 1860 ntTSL 219.45■□□□□ 0.74e-9■■■■■ 31.2
PCBP2Q15366 KCTD13-209ENST00000568995 601 ntTSL 510.18□□□□□ -0.784e-9■■■■■ 31.2
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PCBP2Q15366 RTN3-211ENST00000542238 735 ntTSL 314.1□□□□□ -0.153e-35■■■■■ 31.2
PCBP2Q15366 RTN3-210ENST00000540798 3124 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.233e-35■■■■■ 31.2
PCBP2Q15366 RTN3-214ENST00000545432 545 ntTSL 413.56□□□□□ -0.243e-35■■■■■ 31.2
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PCBP2Q15366 RTN3-212ENST00000543123 712 ntTSL 212.14□□□□□ -0.473e-35■■■■■ 31.2
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PCBP2Q15366 RTN3-204ENST00000354497 1407 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.743e-35■■■■■ 31.2
PCBP2Q15366 RTN3-206ENST00000377819 4937 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.773e-35■■■■■ 31.2
PCBP2Q15366 RTN3-208ENST00000537981 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.83e-35■■■■■ 31.2
PCBP2Q15366 RTN3-202ENST00000339997 4886 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.033e-35■■■■■ 31.2
PCBP2Q15366 OGT-202ENST00000373719 5461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.34e-7■■■■■ 31.2
PCBP2Q15366 OGT-210ENST00000488174 7243 ntTSL 55.88□□□□□ -1.474e-7■■■■■ 31.2
PCBP2Q15366 ZNF76-206ENST00000479226 891 ntTSL 212.57□□□□□ -0.41e-6■■■■■ 31.2
PCBP2Q15366 AC022816.1-201ENST00000436469 804 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.222e-6■■■■■ 31.2
PCBP2Q15366 RPH3AL-212ENST00000573780 531 ntTSL 413.23□□□□□ -0.297e-7■■■■■ 31.2
PCBP2Q15366 RABGAP1-213ENST00000616002 1595 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.693e-13■■■■■ 31.2
PCBP2Q15366 RABGAP1-202ENST00000373647 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.883e-13■■■■■ 31.2
PCBP2Q15366 RABGAP1-212ENST00000493854 575 ntTSL 47.17□□□□□ -1.263e-13■■■■■ 31.2
PCBP2Q15366 RABGAP1-205ENST00000456584 3897 ntTSL 23.94□□□□□ -1.783e-13■■■■■ 31.2
PCBP2Q15366 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.216e-7■■■■■ 31.2
PCBP2Q15366 SYNGAP1-208ENST00000629380 9862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.46e-7■■■■■ 31.2
PCBP2Q15366 SMC1A-201ENST00000322213 9784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.344e-19■■■■■ 31.2
PCBP2Q15366 SMC1A-202ENST00000375340 9930 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.394e-19■■■■■ 31.2
PCBP2Q15366 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.027e-10■■■■■ 31.2
PCBP2Q15366 KMT2E-203ENST00000334884 6840 ntTSL 514.62□□□□□ -0.077e-10■■■■■ 31.2
PCBP2Q15366 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.077e-10■■■■■ 31.2
PCBP2Q15366 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.193e-29■■■■■ 31.2
PCBP2Q15366 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.271e-24■■■■■ 31.1
PCBP2Q15366 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.231e-24■■■■■ 31.1
PCBP2Q15366 UBE2V1-222ENST00000557021 2258 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.331e-24■■■■■ 31.1
PCBP2Q15366 UBE2V1-207ENST00000420027 1956 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.381e-24■■■■■ 31.1
PCBP2Q15366 UBE2V1-203ENST00000371674 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.471e-24■■■■■ 31.1
PCBP2Q15366 UBE2V1-206ENST00000415862 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.721e-24■■■■■ 31.1
PCBP2Q15366 UBE2V1-205ENST00000396059 1983 ntTSL 1 (best)8.6□□□□□ -1.031e-24■■■■■ 31.1
PCBP2Q15366 UBE2V1-223ENST00000617119 2432 ntTSL 4 BASIC8.58□□□□□ -1.041e-24■■■■■ 31.1
PCBP2Q15366 UBE2V1-204ENST00000371677 2459 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.131e-24■■■■■ 31.1
PCBP2Q15366 UBE2V1-202ENST00000371657 1973 ntTSL 4 BASIC7.29□□□□□ -1.241e-24■■■■■ 31.1
PCBP2Q15366 UBE2V1-201ENST00000340309 2536 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.271e-24■■■■■ 31.1
PCBP2Q15366 SP3-207ENST00000490182 459 ntTSL 419.65■□□□□ 0.745e-8■■■■■ 31.1
PCBP2Q15366 SP3-201ENST00000310015 6359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.575e-8■■■■■ 31.1
PCBP2Q15366 SP3-202ENST00000416195 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)11.4□□□□□ -0.585e-8■■■■■ 31.1
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