RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416021.5

SH3BP4-204, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 593 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-204ENST00000416021 NISCHQ9Y2I1 1504 aa51.22■■■■■ 5.79
SH3BP4-204ENST00000416021 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa45.39■■■■■ 4.86
SH3BP4-204ENST00000416021 ABCC9O60706 1549 aa44.79■■■■■ 4.76
SH3BP4-204ENST00000416021 DCAF8L2P0C7V8 631 aa43.14■■■■■ 4.5
SH3BP4-204ENST00000416021 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa42.91■■■■■ 4.46
SH3BP4-204ENST00000416021 NACADO15069 1562 aa42.85■■■■■ 4.45
SH3BP4-204ENST00000416021 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP42.58■■■■■ 4.41
SH3BP4-204ENST00000416021 MYO15BQ96JP2 1530 aa42.55■■■■■ 4.4
SH3BP4-204ENST00000416021 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa42.31■■■■■ 4.36
SH3BP4-204ENST00000416021 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP41.99■■■■■ 4.31
SH3BP4-204ENST00000416021 UNC13AQ9UPW8 1703 aa41.77■■■■■ 4.28
SH3BP4-204ENST00000416021 BICRAQ9NZM4 1560 aa41.62■■■■■ 4.25
SH3BP4-204ENST00000416021 SCRIBQ14160 1630 aa41.52■■■■■ 4.24
SH3BP4-204ENST00000416021 DNAJC5BQ9UF47 199 aa41.39■■■■■ 4.22
SH3BP4-204ENST00000416021 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa41.12■■■■■ 4.17
SH3BP4-204ENST00000416021 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP40.54■■■■■ 4.08
SH3BP4-204ENST00000416021 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa40.41■■■■■ 4.06
SH3BP4-204ENST00000416021 CECR2Q9BXF3 1484 aa40.26■■■■■ 4.03
SH3BP4-204ENST00000416021 SMARCA4P51532 1647 aa39.69■■■■□ 3.94
SH3BP4-204ENST00000416021 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP39.66■■■■□ 3.94
SH3BP4-204ENST00000416021 NCAPD3P42695 1498 aa39.63■■■■□ 3.94
SH3BP4-204ENST00000416021 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa39.62■■■■□ 3.93
SH3BP4-204ENST00000416021 SMARCA2P51531 1590 aa39.49■■■■□ 3.91
SH3BP4-204ENST00000416021 MROH2BQ7Z745 1585 aa39.48■■■■□ 3.91
SH3BP4-204ENST00000416021 PEG3Q9GZU2 1588 aa39.29■■■■□ 3.88
SH3BP4-204ENST00000416021 HMGXB3Q12766 1538 aa39.29■■■■□ 3.88
SH3BP4-204ENST00000416021 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP39.26■■■■□ 3.88
SH3BP4-204ENST00000416021 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP39.05■■■■□ 3.84
SH3BP4-204ENST00000416021 WIZO95785 1651 aa38.98■■■■□ 3.83
SH3BP4-204ENST00000416021 NESP48681 1621 aa38.71■■■■□ 3.79
SH3BP4-204ENST00000416021 ERCC6Q03468 1493 aa38.6■■■■□ 3.77
SH3BP4-204ENST00000416021 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP38.56■■■■□ 3.76
SH3BP4-204ENST00000416021 CADPSQ9ULU8 1353 aa38.52■■■■□ 3.76
SH3BP4-204ENST00000416021 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa38.49■■■■□ 3.75
SH3BP4-204ENST00000416021 PDS5BQ9NTI5 1447 aa38.38■■■■□ 3.73
SH3BP4-204ENST00000416021 CCDC88BA6NC98 1476 aa38.23■■■■□ 3.71
SH3BP4-204ENST00000416021 CFTRP13569 1480 aa38.2■■■■□ 3.71
SH3BP4-204ENST00000416021 CUX2O14529 1486 aa38.19■■■■□ 3.7
SH3BP4-204ENST00000416021 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP38.12■■■■□ 3.69
SH3BP4-204ENST00000416021 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa38.06■■■■□ 3.68
SH3BP4-204ENST00000416021 FANCD2Q9BXW9 1451 aa38.01■■■■□ 3.67
SH3BP4-204ENST00000416021 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP37.98■■■■□ 3.67
SH3BP4-204ENST00000416021 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.94■■■■□ 3.66
SH3BP4-204ENST00000416021 MRC2Q9UBG0 1479 aa37.91■■■■□ 3.66
SH3BP4-204ENST00000416021 WDR62O43379 1518 aa37.73■■■■□ 3.63
SH3BP4-204ENST00000416021 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP37.61■■■■□ 3.61
SH3BP4-204ENST00000416021 PRDM2Q13029 1718 aa37.58■■■■□ 3.61
SH3BP4-204ENST00000416021 ABCC8Q09428 1581 aa37.38■■■■□ 3.57
SH3BP4-204ENST00000416021 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa37.37■■■■□ 3.57
SH3BP4-204ENST00000416021 TOPBP1Q92547 1522 aa37.36■■■■□ 3.57
SH3BP4-204ENST00000416021 DNMBPQ6XZF7 1577 aa37.25■■■■□ 3.55
SH3BP4-204ENST00000416021 IFT140Q96RY7 1462 aa37.18■■■■□ 3.54
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP37.05■■■■□ 3.52
SH3BP4-204ENST00000416021 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP37.04■■■■□ 3.52
SH3BP4-204ENST00000416021 CUX1P39880 1505 aa37.02■■■■□ 3.52
SH3BP4-204ENST00000416021 SOGA1O94964 1423 aa37■■■■□ 3.51
SH3BP4-204ENST00000416021 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa36.94■■■■□ 3.5
SH3BP4-204ENST00000416021 FGD5Q6ZNL6 1462 aa36.94■■■■□ 3.5
SH3BP4-204ENST00000416021 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP36.89■■■■□ 3.5
SH3BP4-204ENST00000416021 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP36.88■■■■□ 3.492e-6■■□□□ 13.1
SH3BP4-204ENST00000416021 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36.82■■■■□ 3.49
SH3BP4-204ENST00000416021 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP36.8■■■■□ 3.48
SH3BP4-204ENST00000416021 OSCARQ8IYS5 282 aa36.8■■■■□ 3.48
SH3BP4-204ENST00000416021 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP36.74■■■■□ 3.47
SH3BP4-204ENST00000416021 TOP2BQ02880 1626 aa36.62■■■■□ 3.45
SH3BP4-204ENST00000416021 SYNJ1O43426 1573 aa36.61■■■■□ 3.45
SH3BP4-204ENST00000416021 FBLN2P98095 1184 aa36.57■■■■□ 3.44
SH3BP4-204ENST00000416021 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa36.57■■■■□ 3.44
SH3BP4-204ENST00000416021 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa36.56■■■■□ 3.44
SH3BP4-204ENST00000416021 WDR97A6NE52 1622 aa36.54■■■■□ 3.44
SH3BP4-204ENST00000416021 GRIN2BQ13224 1484 aa36.5■■■■□ 3.43
SH3BP4-204ENST00000416021 GAPVD1Q14C86 1478 aa36.5■■■■□ 3.43
SH3BP4-204ENST00000416021 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa36.44■■■■□ 3.42
SH3BP4-204ENST00000416021 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP36.43■■■■□ 3.42
SH3BP4-204ENST00000416021 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP36.37■■■■□ 3.41
SH3BP4-204ENST00000416021 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa36.32■■■■□ 3.4
SH3BP4-204ENST00000416021 SYNJ2O15056 1496 aa36.26■■■■□ 3.4
SH3BP4-204ENST00000416021 CHD1O14646 1710 aa36.25■■■■□ 3.39
SH3BP4-204ENST00000416021 PBRM1Q86U86 1689 aa36.21■■■■□ 3.39
SH3BP4-204ENST00000416021 TRIM41Q8WV44 630 aa36.11■■■■□ 3.37
SH3BP4-204ENST00000416021 ERICH3Q5RHP9 1530 aa36.09■■■■□ 3.37
SH3BP4-204ENST00000416021 FHAD1B1AJZ9 1412 aa36.08■■■■□ 3.37
SH3BP4-204ENST00000416021 KIF27Q86VH2 1401 aa36.06■■■■□ 3.36
SH3BP4-204ENST00000416021 IGF1RP08069 1367 aa36.01■■■■□ 3.35
SH3BP4-204ENST00000416021 GRIN2AQ12879 1464 aa35.99■■■■□ 3.35
SH3BP4-204ENST00000416021 ARHGEF11O15085 1522 aa35.99■■■■□ 3.35
SH3BP4-204ENST00000416021 ADAMTS12P58397 1594 aa35.99■■■■□ 3.35
SH3BP4-204ENST00000416021 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa35.97■■■■□ 3.35
SH3BP4-204ENST00000416021 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa35.97■■■■□ 3.35
SH3BP4-204ENST00000416021 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa35.97■■■■□ 3.35
SH3BP4-204ENST00000416021 CLASP1Q7Z460 1538 aa35.95■■■■□ 3.35
SH3BP4-204ENST00000416021 CYB5RLQ6IPT4 315 aa35.89■■■■□ 3.34
SH3BP4-204ENST00000416021 NUP160Q12769 1436 aa35.86■■■■□ 3.33
SH3BP4-204ENST00000416021 CEP170Q5SW79 1584 aa35.78■■■■□ 3.32
SH3BP4-204ENST00000416021 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa35.77■■■■□ 3.32
SH3BP4-204ENST00000416021 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa35.72■■■■□ 3.31
SH3BP4-204ENST00000416021 ARAP1Q96P48 1450 aa35.71■■■■□ 3.31
SH3BP4-204ENST00000416021 JPH4Q96JJ6 628 aa35.67■■■■□ 3.3
SH3BP4-204ENST00000416021 CUL7Q14999 1698 aa35.65■■■■□ 3.3
SH3BP4-204ENST00000416021 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa35.52■■■■□ 3.28
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