RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617119.4

UBE2V1-223, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 V1, human

TSL 4 BASIC

Gene UBE2V1, Length 2,432 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBE2V1-223	ENST00000617119	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		17.6	■□□□□ 0.41
UBE2V1-223	ENST00000617119	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		15.25	■□□□□ 0.03
UBE2V1-223	ENST00000617119	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	15.03	■□□□□ -0
UBE2V1-223	ENST00000617119	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	14.95	□□□□□ -0.02
UBE2V1-223	ENST00000617119	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		14.92	□□□□□ -0.02
UBE2V1-223	ENST00000617119	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		14.83	□□□□□ -0.04
UBE2V1-223	ENST00000617119	HRC	P23327	699 aa		14.78	□□□□□ -0.04
UBE2V1-223	ENST00000617119	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		14.77	□□□□□ -0.04
UBE2V1-223	ENST00000617119	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		14.58	□□□□□ -0.07
UBE2V1-223	ENST00000617119	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	14.53	□□□□□ -0.08
UBE2V1-223	ENST00000617119	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		14.45	□□□□□ -0.1
UBE2V1-223	ENST00000617119	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		14.45	□□□□□ -0.1
UBE2V1-223	ENST00000617119	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		14.39	□□□□□ -0.11
UBE2V1-223	ENST00000617119	PELP1	Q8IZL8	1130 aa	Known RBP	14.31	□□□□□ -0.12
UBE2V1-223	ENST00000617119	ABCC9	O60706	1549 aa		14.19	□□□□□ -0.14
UBE2V1-223	ENST00000617119	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	14.19	□□□□□ -0.14
UBE2V1-223	ENST00000617119	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	14.05	□□□□□ -0.16
UBE2V1-223	ENST00000617119	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		14.02	□□□□□ -0.17
UBE2V1-223	ENST00000617119	SCRIB	Q14160	1630 aa		14.01	□□□□□ -0.17
UBE2V1-223	ENST00000617119	TRIM41	Q8WV44	630 aa		13.92	□□□□□ -0.18
UBE2V1-223	ENST00000617119	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
UBE2V1-223	ENST00000617119	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
UBE2V1-223	ENST00000617119	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19
UBE2V1-223	ENST00000617119	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		13.81	□□□□□ -0.2
UBE2V1-223	ENST00000617119	MYT1	Q01538	1121 aa		13.8	□□□□□ -0.2
UBE2V1-223	ENST00000617119	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		13.78	□□□□□ -0.2
UBE2V1-223	ENST00000617119	NACAD	O15069	1562 aa		13.76	□□□□□ -0.21
UBE2V1-223	ENST00000617119	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		13.75	□□□□□ -0.21
UBE2V1-223	ENST00000617119	WIZ	O95785	1651 aa		13.72	□□□□□ -0.21
UBE2V1-223	ENST00000617119	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
UBE2V1-223	ENST00000617119	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
UBE2V1-223	ENST00000617119	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
UBE2V1-223	ENST00000617119	NEUROD1	Q13562	356 aa		13.56	□□□□□ -0.24
UBE2V1-223	ENST00000617119	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
UBE2V1-223	ENST00000617119	CCER1	Q8TC90	406 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
UBE2V1-223	ENST00000617119	ABCC8	Q09428	1581 aa		13.51	□□□□□ -0.25
UBE2V1-223	ENST00000617119	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		13.48	□□□□□ -0.25
UBE2V1-223	ENST00000617119	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	13.48	□□□□□ -0.25
UBE2V1-223	ENST00000617119	DIEXF	Q68CQ4	756 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
UBE2V1-223	ENST00000617119	CEP162	Q5TB80	1403 aa		13.44	□□□□□ -0.26
UBE2V1-223	ENST00000617119	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
UBE2V1-223	ENST00000617119	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
UBE2V1-223	ENST00000617119	GTF3C3	Q9Y5Q9	886 aa		13.42	□□□□□ -0.26
UBE2V1-223	ENST00000617119	SMARCA2	P51531	1590 aa		13.41	□□□□□ -0.26
UBE2V1-223	ENST00000617119	SOGA1	O94964	1423 aa		13.41	□□□□□ -0.26
UBE2V1-223	ENST00000617119	SMARCA4	P51532	1647 aa		13.37	□□□□□ -0.27
UBE2V1-223	ENST00000617119	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		13.37	□□□□□ -0.27
UBE2V1-223	ENST00000617119	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		13.35	□□□□□ -0.27
UBE2V1-223	ENST00000617119	CENPB	P07199	599 aa	Predicted RBP	13.33	□□□□□ -0.28
UBE2V1-223	ENST00000617119	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		13.33	□□□□□ -0.28
UBE2V1-223	ENST00000617119	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	13.27	□□□□□ -0.29
UBE2V1-223	ENST00000617119	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		13.25	□□□□□ -0.29
UBE2V1-223	ENST00000617119	EEA1	Q15075	1411 aa		13.24	□□□□□ -0.29
UBE2V1-223	ENST00000617119	GOLGA3	Q08378	1498 aa		13.23	□□□□□ -0.29
UBE2V1-223	ENST00000617119	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	13.21	□□□□□ -0.29
UBE2V1-223	ENST00000617119	MIER1	Q8N108	512 aa		13.19	□□□□□ -0.3
UBE2V1-223	ENST00000617119	YTHDC1	Q96MU7	727 aa	Known RBP	13.19	□□□□□ -0.3
UBE2V1-223	ENST00000617119	SYNJ1	O43426	1573 aa		13.17	□□□□□ -0.3
UBE2V1-223	ENST00000617119	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		13.16	□□□□□ -0.3
UBE2V1-223	ENST00000617119	KIF21B	O75037	1637 aa		13.16	□□□□□ -0.3
UBE2V1-223	ENST00000617119	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
UBE2V1-223	ENST00000617119	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		13.12	□□□□□ -0.31
UBE2V1-223	ENST00000617119	CLIP1	P30622	1438 aa		13.1	□□□□□ -0.31
UBE2V1-223	ENST00000617119	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		13.08	□□□□□ -0.32
UBE2V1-223	ENST00000617119	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		13.08	□□□□□ -0.32
UBE2V1-223	ENST00000617119	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		13.06	□□□□□ -0.32
UBE2V1-223	ENST00000617119	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	13.03	□□□□□ -0.32
UBE2V1-223	ENST00000617119	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	12.99	□□□□□ -0.33
UBE2V1-223	ENST00000617119	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	12.96	□□□□□ -0.33
UBE2V1-223	ENST00000617119	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	12.94	□□□□□ -0.34
UBE2V1-223	ENST00000617119	TOP2B	Q02880	1626 aa		12.93	□□□□□ -0.34
UBE2V1-223	ENST00000617119	ARAP1	Q96P48	1450 aa		12.93	□□□□□ -0.34
UBE2V1-223	ENST00000617119	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		12.93	□□□□□ -0.34
UBE2V1-223	ENST00000617119	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		12.9	□□□□□ -0.34
UBE2V1-223	ENST00000617119	APLP2	Q06481	763 aa		12.89	□□□□□ -0.35
UBE2V1-223	ENST00000617119	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	12.88	□□□□□ -0.35
UBE2V1-223	ENST00000617119	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		12.87	□□□□□ -0.35
UBE2V1-223	ENST00000617119	PRX	Q9BXM0	1461 aa		12.87	□□□□□ -0.35
UBE2V1-223	ENST00000617119	CLSPN	Q9HAW4	1339 aa		12.87	□□□□□ -0.35
UBE2V1-223	ENST00000617119	SUPT16H	Q9Y5B9	1047 aa	Known RBP	12.87	□□□□□ -0.35
UBE2V1-223	ENST00000617119	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
UBE2V1-223	ENST00000617119	CUX2	O14529	1486 aa		12.82	□□□□□ -0.36
UBE2V1-223	ENST00000617119	BCL11A	Q9H165	835 aa		12.8	□□□□□ -0.36
UBE2V1-223	ENST00000617119	ANP32E	Q9BTT0	268 aa		12.79	□□□□□ -0.36
UBE2V1-223	ENST00000617119	CUX1	P39880	1505 aa		12.77	□□□□□ -0.36
UBE2V1-223	ENST00000617119	KCNH8	Q96L42	1107 aa		12.77	□□□□□ -0.37
UBE2V1-223	ENST00000617119	MAPKBP1	O60336	1514 aa		12.76	□□□□□ -0.37
UBE2V1-223	ENST00000617119	TSHZ2	Q9NRE2	1034 aa		12.75	□□□□□ -0.37
UBE2V1-223	ENST00000617119	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		12.75	□□□□□ -0.37
UBE2V1-223	ENST00000617119	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		12.73	□□□□□ -0.37
UBE2V1-223	ENST00000617119	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		12.69	□□□□□ -0.38
UBE2V1-223	ENST00000617119	ITGAE	P38570	1179 aa		12.68	□□□□□ -0.38
UBE2V1-223	ENST00000617119	KIF27	Q86VH2	1401 aa		12.67	□□□□□ -0.38
UBE2V1-223	ENST00000617119	NCAPD3	P42695	1498 aa		12.67	□□□□□ -0.38
UBE2V1-223	ENST00000617119	WDR97	A6NE52	1622 aa		12.67	□□□□□ -0.38
UBE2V1-223	ENST00000617119	TIAM1	Q13009	1591 aa		12.66	□□□□□ -0.38
UBE2V1-223	ENST00000617119	HMGXB3	Q12766	1538 aa		12.65	□□□□□ -0.38
UBE2V1-223	ENST00000617119	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		12.62	□□□□□ -0.39
UBE2V1-223	ENST00000617119	MAP3K1	Q13233	1512 aa		12.6	□□□□□ -0.39
UBE2V1-223	ENST00000617119	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		12.59	□□□□□ -0.39

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.7 ms