RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000292431.4

NACC1-201, Transcript of nucleus accumbens associated 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NACC1, Length 4,445 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NACC1-201ENST00000292431 NISCHQ9Y2I1 1504 aa29.16■■■□□ 2.26
NACC1-201ENST00000292431 DCAF8L2P0C7V8 631 aa27.12■■□□□ 1.93
NACC1-201ENST00000292431 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
NACC1-201ENST00000292431 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.8■■□□□ 1.72
NACC1-201ENST00000292431 ABCC9O60706 1549 aa24.81■■□□□ 1.56
NACC1-201ENST00000292431 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa24.68■■□□□ 1.54
NACC1-201ENST00000292431 PCGF6Q9BYE7 350 aa24.37■■□□□ 1.49
NACC1-201ENST00000292431 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
NACC1-201ENST00000292431 CHIC1Q5VXU3 224 aa24.2■■□□□ 1.47
NACC1-201ENST00000292431 EHMT2Q96KQ7 1210 aa24.15■■□□□ 1.46
NACC1-201ENST00000292431 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
NACC1-201ENST00000292431 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP24.01■■□□□ 1.43
NACC1-201ENST00000292431 TRIM41Q8WV44 630 aa24■■□□□ 1.43
NACC1-201ENST00000292431 HRCP23327 699 aa23.88■■□□□ 1.41
NACC1-201ENST00000292431 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa23.75■■□□□ 1.39
NACC1-201ENST00000292431 SCRIBQ14160 1630 aa23.71■■□□□ 1.39
NACC1-201ENST00000292431 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.39
NACC1-201ENST00000292431 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
NACC1-201ENST00000292431 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa23.65■■□□□ 1.38
NACC1-201ENST00000292431 NACADO15069 1562 aa23.63■■□□□ 1.37
NACC1-201ENST00000292431 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa23.56■■□□□ 1.36
NACC1-201ENST00000292431 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.34
NACC1-201ENST00000292431 APLP2Q06481 763 aa23.36■■□□□ 1.33
NACC1-201ENST00000292431 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
NACC1-201ENST00000292431 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
NACC1-201ENST00000292431 UBTFP17480 764 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
NACC1-201ENST00000292431 MYO15BQ96JP2 1530 aa23.16■■□□□ 1.3
NACC1-201ENST00000292431 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
NACC1-201ENST00000292431 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
NACC1-201ENST00000292431 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
NACC1-201ENST00000292431 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.24
NACC1-201ENST00000292431 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
NACC1-201ENST00000292431 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
NACC1-201ENST00000292431 CECR2Q9BXF3 1484 aa22.77■■□□□ 1.24
NACC1-201ENST00000292431 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.23
NACC1-201ENST00000292431 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
NACC1-201ENST00000292431 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
NACC1-201ENST00000292431 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
NACC1-201ENST00000292431 MROH2BQ7Z745 1585 aa22.52■■□□□ 1.2
NACC1-201ENST00000292431 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
NACC1-201ENST00000292431 CSRNP3Q8WYN3 585 aa22.5■■□□□ 1.19
NACC1-201ENST00000292431 SMARCA2P51531 1590 aa22.35■■□□□ 1.17
NACC1-201ENST00000292431 ITGAEP38570 1179 aa22.27■■□□□ 1.16
NACC1-201ENST00000292431 FBLN2P98095 1184 aa22.26■■□□□ 1.15
NACC1-201ENST00000292431 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.21■■□□□ 1.15
NACC1-201ENST00000292431 SMARCA4P51532 1647 aa22.19■■□□□ 1.14
NACC1-201ENST00000292431 WIZO95785 1651 aa22.19■■□□□ 1.14
NACC1-201ENST00000292431 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
NACC1-201ENST00000292431 CCDC88BA6NC98 1476 aa22.18■■□□□ 1.14
NACC1-201ENST00000292431 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa22.17■■□□□ 1.14
NACC1-201ENST00000292431 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
NACC1-201ENST00000292431 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
NACC1-201ENST00000292431 EEA1Q15075 1411 aa22.1■■□□□ 1.13
NACC1-201ENST00000292431 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa22.08■■□□□ 1.12
NACC1-201ENST00000292431 CEP162Q5TB80 1403 aa22.06■■□□□ 1.12
NACC1-201ENST00000292431 P3H3Q8IVL6 736 aa21.99■■□□□ 1.11
NACC1-201ENST00000292431 TNIKQ9UKE5 1360 aa21.99■■□□□ 1.11
NACC1-201ENST00000292431 NEFLP07196 543 aa21.96■■□□□ 1.11
NACC1-201ENST00000292431 MYT1Q01538 1121 aa21.96■■□□□ 1.11
NACC1-201ENST00000292431 GOLGA3Q08378 1498 aa21.95■■□□□ 1.1
NACC1-201ENST00000292431 KIF27Q86VH2 1401 aa21.92■■□□□ 1.1
NACC1-201ENST00000292431 ERCC6Q03468 1493 aa21.92■■□□□ 1.1
NACC1-201ENST00000292431 CLIP1P30622 1438 aa21.91■■□□□ 1.1
NACC1-201ENST00000292431 CADPSQ9ULU8 1353 aa21.9■■□□□ 1.1
NACC1-201ENST00000292431 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.1
NACC1-201ENST00000292431 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
NACC1-201ENST00000292431 PDS5BQ9NTI5 1447 aa21.87■■□□□ 1.09
NACC1-201ENST00000292431 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
NACC1-201ENST00000292431 NCAPD3P42695 1498 aa21.85■■□□□ 1.09
NACC1-201ENST00000292431 MYT1LQ9UL68 1186 aa21.84■■□□□ 1.09
NACC1-201ENST00000292431 SOGA1O94964 1423 aa21.83■■□□□ 1.09
NACC1-201ENST00000292431 NEUROD1Q13562 356 aa21.83■■□□□ 1.09
NACC1-201ENST00000292431 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
NACC1-201ENST00000292431 BICRAQ9NZM4 1560 aa21.8■■□□□ 1.08
NACC1-201ENST00000292431 ABCC8Q09428 1581 aa21.78■■□□□ 1.08
NACC1-201ENST00000292431 CEP164Q9UPV0 1460 aa21.78■■□□□ 1.08
NACC1-201ENST00000292431 ARID3CA6NKF2 412 aa21.71■■□□□ 1.07
NACC1-201ENST00000292431 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
NACC1-201ENST00000292431 CUX2O14529 1486 aa21.7■■□□□ 1.06
NACC1-201ENST00000292431 MIER1Q8N108 512 aa21.6■■□□□ 1.05
NACC1-201ENST00000292431 ERICH6Q7L0X2 663 aa21.6■■□□□ 1.05
NACC1-201ENST00000292431 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa21.59■■□□□ 1.05
NACC1-201ENST00000292431 FANCD2Q9BXW9 1451 aa21.57■■□□□ 1.04
NACC1-201ENST00000292431 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa21.54■■□□□ 1.04
NACC1-201ENST00000292431 UNC13AQ9UPW8 1703 aa21.54■■□□□ 1.04
NACC1-201ENST00000292431 HMGXB3Q12766 1538 aa21.54■■□□□ 1.04
NACC1-201ENST00000292431 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
NACC1-201ENST00000292431 VPS8Q8N3P4 1428 aa21.5■■□□□ 1.03
NACC1-201ENST00000292431 ANP32CO43423 234 aa21.49■■□□□ 1.03
NACC1-201ENST00000292431 TRIM52Q96A61 297 aa21.48■■□□□ 1.03
NACC1-201ENST00000292431 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP21.46■■□□□ 1.03
NACC1-201ENST00000292431 CLSPNQ9HAW4 1339 aa21.45■■□□□ 1.02
NACC1-201ENST00000292431 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
NACC1-201ENST00000292431 MTUS2Q5JR59 1369 aa21.43■■□□□ 1.02
NACC1-201ENST00000292431 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa21.41■■□□□ 1.02
NACC1-201ENST00000292431 CFTRP13569 1480 aa21.41■■□□□ 1.02
NACC1-201ENST00000292431 POLR3GLQ9BT43 218 aa21.39■■□□□ 1.01
NACC1-201ENST00000292431 BCANQ96GW7 911 aa21.37■■□□□ 1.01
NACC1-201ENST00000292431 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
NACC1-201ENST00000292431 TONSLQ96HA7 1378 aa21.31■■□□□ 1
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