Protein–RNA interactions for Protein: O75533

SF3B1, Splicing factor 3B subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B1O75533 PITPNM1-209ENST00000527370 3712 ntTSL 210.5□□□□□ -0.734e-6■■■■■ 138.7
SF3B1O75533 STIM1-215ENST00000532990 668 ntTSL 39.93□□□□□ -0.824e-6■■■■■ 138.7
SF3B1O75533 GATAD2A-205ENST00000418032 3480 ntTSL 211.33□□□□□ -0.62e-7■■■■■ 138.6
SF3B1O75533 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.172e-6■■■■■ 138.6
SF3B1O75533 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.042e-6■■■■■ 138.6
SF3B1O75533 STK40-203ENST00000373130 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.242e-6■■■■■ 138.6
SF3B1O75533 TCHP-206ENST00000544838 2077 ntTSL 221.39■■□□□ 1.013e-9■■■■■ 138.6
SF3B1O75533 TCHP-202ENST00000405876 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.493e-9■■■■■ 138.6
SF3B1O75533 TCHP-201ENST00000312777 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.583e-9■■■■■ 138.6
SF3B1O75533 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.463e-6■■■■■ 138.5
SF3B1O75533 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.399e-7■■■■■ 138.5
SF3B1O75533 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.319e-7■■■■■ 138.5
SF3B1O75533 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.29e-7■■■■■ 138.5
SF3B1O75533 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.179e-7■■■■■ 138.5
SF3B1O75533 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.169e-7■■■■■ 138.5
SF3B1O75533 TLE3-209ENST00000557919 4294 ntTSL 515.1■□□□□ 0.019e-7■■■■■ 138.5
SF3B1O75533 TLE3-221ENST00000560525 3647 ntTSL 514.01□□□□□ -0.179e-7■■■■■ 138.5
SF3B1O75533 TLE3-220ENST00000559929 3408 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.269e-7■■■■■ 138.5
SF3B1O75533 TLE3-222ENST00000560589 3509 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.579e-7■■■■■ 138.5
SF3B1O75533 ST6GAL1-211ENST00000448044 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.33e-6■■■■■ 138.4
SF3B1O75533 HDAC4-204ENST00000446876 554 ntTSL 416.16■□□□□ 0.181e-6■■■■■ 138.4
SF3B1O75533 RC3H1-202ENST00000367694 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.612e-6■■■■■ 138.3
SF3B1O75533 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.053e-6■■■■■ 138.2
SF3B1O75533 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.693e-6■■■■■ 138.2
SF3B1O75533 TRPM4-204ENST00000595071 2947 ntTSL 219.71■□□□□ 0.751e-8■■■■■ 138.1
SF3B1O75533 USP36-211ENST00000588130 602 ntTSL 29.55□□□□□ -0.884e-7■■■■■ 138.1
SF3B1O75533 ANKS6-205ENST00000471846 1103 ntTSL 225.42■■□□□ 1.663e-8■■■■■ 138
SF3B1O75533 CLEC3B-203ENST00000490386 708 ntTSL 331.81■■■□□ 2.683e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 TBC1D13-204ENST00000475097 502 ntTSL 330.51■■■□□ 2.483e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 SMARCC1-203ENST00000454240 636 ntTSL 330.33■■■□□ 2.453e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 SMAD4-213ENST00000591914 992 ntTSL 329.79■■■□□ 2.363e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 RCC1L-204ENST00000616051 1610 ntTSL 229.72■■■□□ 2.353e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.263e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.243e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 DTNBP1-211ENST00000515875 1306 ntTSL 528.76■■■□□ 2.198e-8■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 MVK-211ENST00000545774 702 ntTSL 328.72■■■□□ 2.193e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.173e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.173e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.173e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.163e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 CUL4A-211ENST00000498562 790 ntTSL 328.57■■■□□ 2.163e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.163e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.163e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.152e-11■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 AGRN-205ENST00000469403 899 ntTSL 328.45■■■□□ 2.153e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.148e-8■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 CERCAM-203ENST00000411852 1176 ntTSL 528.25■■■□□ 2.113e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 CUL4A-205ENST00000463426 893 ntTSL 328.22■■■□□ 2.113e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 RAD9A-210ENST00000621995 912 ntTSL 328.15■■■□□ 2.12e-11■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 RNF144A-205ENST00000467276 900 ntTSL 327.94■■■□□ 2.063e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.062e-8■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.058e-8■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 DAB2IP-210ENST00000489314 464 ntTSL 327.62■■■□□ 2.013e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.983e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.973e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 DTNBP1-208ENST00000511762 843 ntTSL 327.26■■□□□ 1.958e-8■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ZNF48-204ENST00000528032 555 ntTSL 427.15■■□□□ 1.943e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ATP6AP1-205ENST00000446552 571 ntTSL 427.06■■□□□ 1.923e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.923e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.925e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 LAPTM4B-202ENST00000517924 618 ntTSL 527.02■■□□□ 1.923e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 AGBL5-210ENST00000489683 1850 ntTSL 526.97■■□□□ 1.912e-11■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.893e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 PRR5-204ENST00000403696 789 ntTSL 326.82■■□□□ 1.883e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 C20orf27-203ENST00000399672 1734 ntAPPRIS P1 TSL 226.81■■□□□ 1.883e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.873e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.873e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 PTGES2-203ENST00000449878 803 ntTSL 526.71■■□□□ 1.873e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.873e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.863e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.863e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 NOTUM-202ENST00000425009 996 ntTSL 326.64■■□□□ 1.853e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 AGRN-206ENST00000477585 707 ntTSL 326.49■■□□□ 1.833e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.833e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 APBA2-209ENST00000559709 594 ntTSL 426.47■■□□□ 1.833e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.823e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 CCDC136-203ENST00000459946 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 326.39■■□□□ 1.813e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ICMT-202ENST00000474756 1227 ntTSL 226.14■■□□□ 1.783e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.773e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 CDR2-202ENST00000561630 711 ntTSL 526.08■■□□□ 1.773e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.763e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.763e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 C9orf3-207ENST00000445181 873 ntTSL 326.03■■□□□ 1.763e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 SHMT1-204ENST00000395682 570 ntTSL 225.83■■□□□ 1.732e-11■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 HDHD5-206ENST00000480451 1028 ntTSL 225.72■■□□□ 1.713e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 PRR5-209ENST00000457960 881 ntTSL 525.65■■□□□ 1.73e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.683e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 DTNBP1-209ENST00000513680 1518 ntTSL 525.52■■□□□ 1.688e-8■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.663e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 HDHD5-204ENST00000463033 643 ntTSL 325.4■■□□□ 1.663e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.663e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 TMEM241-211ENST00000578520 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 325.37■■□□□ 1.653e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 PTGES2-204ENST00000474124 873 ntTSL 525.24■■□□□ 1.633e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 PEX10-203ENST00000502666 653 ntTSL 325.2■■□□□ 1.623e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.623e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 STAT5A-210ENST00000590726 835 ntTSL 325.16■■□□□ 1.626e-8■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 C9orf3-216ENST00000478603 802 ntTSL 225.12■■□□□ 1.613e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.613e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 CUL4A-210ENST00000494985 292 ntTSL 525.08■■□□□ 1.63e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 PEX10-205ENST00000508384 611 ntTSL 325.07■■□□□ 1.63e-6■■■■■ 137.9
Retrieved 100 of 46,956 protein–RNA pairs in 1155.7 ms