RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403696.5

PRR5-204, Transcript of proline rich 5, humanhuman

TSL 3

Gene PRR5, Length 789 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR5-204ENST00000403696 NISCHQ9Y2I1 1504 aa59.99■■■■■ 7.19
PRR5-204ENST00000403696 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa53.42■■■■■ 6.14
PRR5-204ENST00000403696 ABCC9O60706 1549 aa52.28■■■■■ 5.96
PRR5-204ENST00000403696 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa50.29■■■■■ 5.64
PRR5-204ENST00000403696 NACADO15069 1562 aa50.21■■■■■ 5.63
PRR5-204ENST00000403696 DCAF8L2P0C7V8 631 aa50.07■■■■■ 5.61
PRR5-204ENST00000403696 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP49.96■■■■■ 5.59
PRR5-204ENST00000403696 MYO15BQ96JP2 1530 aa49.9■■■■■ 5.58
PRR5-204ENST00000403696 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa49.66■■■■■ 5.54
PRR5-204ENST00000403696 UNC13AQ9UPW8 1703 aa49.17■■■■■ 5.46
PRR5-204ENST00000403696 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP48.8■■■■■ 5.4
PRR5-204ENST00000403696 BICRAQ9NZM4 1560 aa48.77■■■■■ 5.4
PRR5-204ENST00000403696 SCRIBQ14160 1630 aa48.69■■■■■ 5.38
PRR5-204ENST00000403696 DNAJC5BQ9UF47 199 aa48.64■■■■■ 5.38
PRR5-204ENST00000403696 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa48.29■■■■■ 5.32
PRR5-204ENST00000403696 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP47.49■■■■■ 5.19
PRR5-204ENST00000403696 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa47.31■■■■■ 5.16
PRR5-204ENST00000403696 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.99■■■■■ 5.11
PRR5-204ENST00000403696 SMARCA4P51532 1647 aa46.57■■■■■ 5.05
PRR5-204ENST00000403696 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP46.52■■■■■ 5.04
PRR5-204ENST00000403696 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa46.33■■■■■ 5.01
PRR5-204ENST00000403696 NCAPD3P42695 1498 aa46.32■■■■■ 5.01
PRR5-204ENST00000403696 SMARCA2P51531 1590 aa46.29■■■■■ 5
PRR5-204ENST00000403696 MROH2BQ7Z745 1585 aa46.22■■■■■ 4.99
PRR5-204ENST00000403696 PEG3Q9GZU2 1588 aa46.14■■■■■ 4.98
PRR5-204ENST00000403696 HMGXB3Q12766 1538 aa46.11■■■■■ 4.97
PRR5-204ENST00000403696 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP45.94■■■■■ 4.95
PRR5-204ENST00000403696 WIZO95785 1651 aa45.72■■■■■ 4.91
PRR5-204ENST00000403696 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP45.66■■■■■ 4.9
PRR5-204ENST00000403696 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP45.25■■■■■ 4.83
PRR5-204ENST00000403696 NESP48681 1621 aa45.22■■■■■ 4.83
PRR5-204ENST00000403696 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa45.13■■■■■ 4.82
PRR5-204ENST00000403696 ERCC6Q03468 1493 aa45.07■■■■■ 4.81
PRR5-204ENST00000403696 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.95■■■■■ 4.79
PRR5-204ENST00000403696 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa44.95■■■■■ 4.79
PRR5-204ENST00000403696 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.81■■■■■ 4.76
PRR5-204ENST00000403696 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.72■■■■■ 4.75
PRR5-204ENST00000403696 CCDC88BA6NC98 1476 aa44.69■■■■■ 4.74
PRR5-204ENST00000403696 CFTRP13569 1480 aa44.68■■■■■ 4.74
PRR5-204ENST00000403696 CUX2O14529 1486 aa44.66■■■■■ 4.74
PRR5-204ENST00000403696 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44.59■■■■■ 4.73
PRR5-204ENST00000403696 FANCD2Q9BXW9 1451 aa44.44■■■■■ 4.7
PRR5-204ENST00000403696 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.4■■■■■ 4.7
PRR5-204ENST00000403696 PRDM2Q13029 1718 aa44.39■■■■■ 4.7
PRR5-204ENST00000403696 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP44.38■■■■■ 4.7
PRR5-204ENST00000403696 MRC2Q9UBG0 1479 aa44.36■■■■■ 4.69
PRR5-204ENST00000403696 WDR62O43379 1518 aa44.23■■■■■ 4.67
PRR5-204ENST00000403696 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP44.01■■■■■ 4.64
PRR5-204ENST00000403696 ABCC8Q09428 1581 aa43.74■■■■■ 4.59
PRR5-204ENST00000403696 TOPBP1Q92547 1522 aa43.73■■■■■ 4.59
PRR5-204ENST00000403696 DNMBPQ6XZF7 1577 aa43.69■■■■■ 4.58
PRR5-204ENST00000403696 IFT140Q96RY7 1462 aa43.48■■■■■ 4.55
PRR5-204ENST00000403696 CUX1P39880 1505 aa43.37■■■■■ 4.53
PRR5-204ENST00000403696 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP43.35■■■■■ 4.53
PRR5-204ENST00000403696 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP43.28■■■■■ 4.52
PRR5-204ENST00000403696 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP43.27■■■■■ 4.52
PRR5-204ENST00000403696 FGD5Q6ZNL6 1462 aa43.23■■■■■ 4.51
PRR5-204ENST00000403696 SOGA1O94964 1423 aa43.15■■■■■ 4.5
PRR5-204ENST00000403696 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa43.14■■■■■ 4.5
PRR5-204ENST00000403696 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP43.13■■■■■ 4.5
PRR5-204ENST00000403696 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP43.05■■■■■ 4.485e-6■■■■■ 46
PRR5-204ENST00000403696 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP43.01■■■■■ 4.482e-6■■■□□ 14.9
PRR5-204ENST00000403696 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa43■■■■■ 4.47
PRR5-204ENST00000403696 TOP2BQ02880 1626 aa43■■■■■ 4.47
PRR5-204ENST00000403696 SYNJ1O43426 1573 aa42.96■■■■■ 4.47
PRR5-204ENST00000403696 WDR97A6NE52 1622 aa42.96■■■■■ 4.47
PRR5-204ENST00000403696 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.91■■■■■ 4.46
PRR5-204ENST00000403696 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.82■■■■■ 4.45
PRR5-204ENST00000403696 TRIM41Q8WV44 630 aa42.79■■■■■ 4.44
PRR5-204ENST00000403696 OSCARQ8IYS5 282 aa42.75■■■■■ 4.43
PRR5-204ENST00000403696 GRIN2BQ13224 1484 aa42.68■■■■■ 4.42
PRR5-204ENST00000403696 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.68■■■■■ 4.42
PRR5-204ENST00000403696 GAPVD1Q14C86 1478 aa42.67■■■■■ 4.42
PRR5-204ENST00000403696 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.62■■■■■ 4.41
PRR5-204ENST00000403696 PBRM1Q86U86 1689 aa42.62■■■■■ 4.41
PRR5-204ENST00000403696 CHD1O14646 1710 aa42.61■■■■■ 4.41
PRR5-204ENST00000403696 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP42.59■■■■■ 4.41
PRR5-204ENST00000403696 FBLN2P98095 1184 aa42.48■■■■■ 4.39
PRR5-204ENST00000403696 SYNJ2O15056 1496 aa42.42■■■■■ 4.38
PRR5-204ENST00000403696 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP42.37■■■■■ 4.37
PRR5-204ENST00000403696 ERICH3Q5RHP9 1530 aa42.31■■■■■ 4.36
PRR5-204ENST00000403696 ADAMTS12P58397 1594 aa42.27■■■■■ 4.36
PRR5-204ENST00000403696 FHAD1B1AJZ9 1412 aa42.18■■■■■ 4.34
PRR5-204ENST00000403696 KIF27Q86VH2 1401 aa42.16■■■■■ 4.34
PRR5-204ENST00000403696 CLASP1Q7Z460 1538 aa42.15■■■■■ 4.34
PRR5-204ENST00000403696 GRIN2AQ12879 1464 aa42.13■■■■■ 4.34
PRR5-204ENST00000403696 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa42.11■■■■■ 4.33
PRR5-204ENST00000403696 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa42.11■■■■■ 4.33
PRR5-204ENST00000403696 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa42.11■■■■■ 4.33
PRR5-204ENST00000403696 ARHGEF11O15085 1522 aa42.09■■■■■ 4.33
PRR5-204ENST00000403696 IGF1RP08069 1367 aa42■■■■■ 4.31
PRR5-204ENST00000403696 NUP160Q12769 1436 aa41.95■■■■■ 4.31
PRR5-204ENST00000403696 CEP170Q5SW79 1584 aa41.93■■■■■ 4.3
PRR5-204ENST00000403696 CUL7Q14999 1698 aa41.93■■■■■ 4.3
PRR5-204ENST00000403696 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.78■■■■■ 4.28
PRR5-204ENST00000403696 ARAP1Q96P48 1450 aa41.74■■■■■ 4.27
PRR5-204ENST00000403696 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa41.74■■■■■ 4.27
PRR5-204ENST00000403696 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.74■■■■■ 4.27
PRR5-204ENST00000403696 SHROOM2Q13796 1616 aa41.67■■■■■ 4.26
PRR5-204ENST00000403696 ERCC6L2Q5T890 1561 aa41.54■■■■■ 4.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50 ms