RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498562.2

CUL4A-211, Transcript of cullin 4A, humanhuman

TSL 3

Gene CUL4A, Length 790 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4A-211ENST00000498562 NISCHQ9Y2I1 1504 aa64.96■■■■■ 7.99
CUL4A-211ENST00000498562 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa58.3■■■■■ 6.92
CUL4A-211ENST00000498562 ABCC9O60706 1549 aa58.06■■■■■ 6.89
CUL4A-211ENST00000498562 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa55.37■■■■■ 6.45
CUL4A-211ENST00000498562 NACADO15069 1562 aa55.03■■■■■ 6.4
CUL4A-211ENST00000498562 DCAF8L2P0C7V8 631 aa54.58■■■■■ 6.33
CUL4A-211ENST00000498562 MYO15BQ96JP2 1530 aa54.34■■■■■ 6.29
CUL4A-211ENST00000498562 DNAJC5BQ9UF47 199 aa54.29■■■■■ 6.28
CUL4A-211ENST00000498562 UNC13AQ9UPW8 1703 aa54.21■■■■■ 6.27
CUL4A-211ENST00000498562 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP54.01■■■■■ 6.24
CUL4A-211ENST00000498562 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP53.91■■■■■ 6.22
CUL4A-211ENST00000498562 BICRAQ9NZM4 1560 aa53.79■■■■■ 6.2
CUL4A-211ENST00000498562 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa53.7■■■■■ 6.19
CUL4A-211ENST00000498562 SCRIBQ14160 1630 aa53.09■■■■■ 6.09
CUL4A-211ENST00000498562 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa53.08■■■■■ 6.09
CUL4A-211ENST00000498562 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa52.51■■■■■ 6
CUL4A-211ENST00000498562 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP52.44■■■■■ 5.99
CUL4A-211ENST00000498562 CECR2Q9BXF3 1484 aa52.29■■■■■ 5.96
CUL4A-211ENST00000498562 NCAPD3P42695 1498 aa50.78■■■■■ 5.72
CUL4A-211ENST00000498562 SMARCA4P51532 1647 aa50.68■■■■■ 5.7
CUL4A-211ENST00000498562 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa50.65■■■■■ 5.7
CUL4A-211ENST00000498562 SMARCA2P51531 1590 aa50.53■■■■■ 5.68
CUL4A-211ENST00000498562 HMGXB3Q12766 1538 aa50.47■■■■■ 5.67
CUL4A-211ENST00000498562 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP50.43■■■■■ 5.66
CUL4A-211ENST00000498562 PEG3Q9GZU2 1588 aa50.21■■■■■ 5.63
CUL4A-211ENST00000498562 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP50.16■■■■■ 5.62
CUL4A-211ENST00000498562 ERCC6Q03468 1493 aa50.1■■■■■ 5.61
CUL4A-211ENST00000498562 MROH2BQ7Z745 1585 aa50.06■■■■■ 5.6
CUL4A-211ENST00000498562 CUX2O14529 1486 aa50.02■■■■■ 5.6
CUL4A-211ENST00000498562 NESP48681 1621 aa49.94■■■■■ 5.59
CUL4A-211ENST00000498562 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa49.73■■■■■ 5.55
CUL4A-211ENST00000498562 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa49.65■■■■■ 5.54
CUL4A-211ENST00000498562 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP49.49■■■■■ 5.51
CUL4A-211ENST00000498562 WIZO95785 1651 aa49.49■■■■■ 5.51
CUL4A-211ENST00000498562 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa49.37■■■■■ 5.49
CUL4A-211ENST00000498562 PDS5BQ9NTI5 1447 aa49.28■■■■■ 5.48
CUL4A-211ENST00000498562 CADPSQ9ULU8 1353 aa49.21■■■■■ 5.47
CUL4A-211ENST00000498562 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP49.05■■■■■ 5.44
CUL4A-211ENST00000498562 MRC2Q9UBG0 1479 aa48.9■■■■■ 5.42
CUL4A-211ENST00000498562 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP48.88■■■■■ 5.41
CUL4A-211ENST00000498562 WDR62O43379 1518 aa48.81■■■■■ 5.4
CUL4A-211ENST00000498562 CEP164Q9UPV0 1460 aa48.74■■■■■ 5.39
CUL4A-211ENST00000498562 CFTRP13569 1480 aa48.73■■■■■ 5.39
CUL4A-211ENST00000498562 FANCD2Q9BXW9 1451 aa48.68■■■■■ 5.38
CUL4A-211ENST00000498562 PRDM2Q13029 1718 aa48.35■■■■■ 5.33
CUL4A-211ENST00000498562 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP48.3■■■■■ 5.32
CUL4A-211ENST00000498562 CCDC88BA6NC98 1476 aa48.28■■■■■ 5.32
CUL4A-211ENST00000498562 TOPBP1Q92547 1522 aa47.8■■■■■ 5.24
CUL4A-211ENST00000498562 IFT140Q96RY7 1462 aa47.74■■■■■ 5.23
CUL4A-211ENST00000498562 ABCC8Q09428 1581 aa47.67■■■■■ 5.22
CUL4A-211ENST00000498562 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP47.66■■■■■ 5.22
CUL4A-211ENST00000498562 DNMBPQ6XZF7 1577 aa47.66■■■■■ 5.22
CUL4A-211ENST00000498562 OSCARQ8IYS5 282 aa47.64■■■■■ 5.22
CUL4A-211ENST00000498562 TRIM41Q8WV44 630 aa47.58■■■■■ 5.21
CUL4A-211ENST00000498562 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP47.46■■■■■ 5.19
CUL4A-211ENST00000498562 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP47.4■■■■■ 5.18
CUL4A-211ENST00000498562 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP47.33■■■■■ 5.17
CUL4A-211ENST00000498562 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP47.21■■■■■ 5.154e-6■■■□□ 15.2
CUL4A-211ENST00000498562 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa47.15■■■■■ 5.14
CUL4A-211ENST00000498562 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa47.15■■■■■ 5.14
CUL4A-211ENST00000498562 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa47.15■■■■■ 5.14
CUL4A-211ENST00000498562 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa47.12■■■■■ 5.13
CUL4A-211ENST00000498562 CHD1O14646 1710 aa47.08■■■■■ 5.13
CUL4A-211ENST00000498562 SOGA1O94964 1423 aa47.05■■■■■ 5.12
CUL4A-211ENST00000498562 FGD5Q6ZNL6 1462 aa47.04■■■■■ 5.12
CUL4A-211ENST00000498562 CUX1P39880 1505 aa47.04■■■■■ 5.12
CUL4A-211ENST00000498562 ARHGEF11O15085 1522 aa47■■■■■ 5.11
CUL4A-211ENST00000498562 WDR97A6NE52 1622 aa46.94■■■■■ 5.1
CUL4A-211ENST00000498562 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP46.92■■■■■ 5.1
CUL4A-211ENST00000498562 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP46.87■■■■■ 5.09
CUL4A-211ENST00000498562 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa46.78■■■■■ 5.08
CUL4A-211ENST00000498562 FBLN2P98095 1184 aa46.78■■■■■ 5.08
CUL4A-211ENST00000498562 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP46.66■■■■■ 5.06
CUL4A-211ENST00000498562 GRIN2BQ13224 1484 aa46.65■■■■■ 5.06
CUL4A-211ENST00000498562 PBRM1Q86U86 1689 aa46.57■■■■■ 5.05
CUL4A-211ENST00000498562 ARAP1Q96P48 1450 aa46.55■■■■■ 5.04
CUL4A-211ENST00000498562 CLASP1Q7Z460 1538 aa46.54■■■■■ 5.04
CUL4A-211ENST00000498562 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa46.53■■■■■ 5.04
CUL4A-211ENST00000498562 CYB5RLQ6IPT4 315 aa46.51■■■■■ 5.04
CUL4A-211ENST00000498562 GAPVD1Q14C86 1478 aa46.51■■■■■ 5.04
CUL4A-211ENST00000498562 SYNJ1O43426 1573 aa46.5■■■■■ 5.03
CUL4A-211ENST00000498562 SYNJ2O15056 1496 aa46.5■■■■■ 5.03
CUL4A-211ENST00000498562 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa46.49■■■■■ 5.03
CUL4A-211ENST00000498562 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP46.48■■■■■ 5.03
CUL4A-211ENST00000498562 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa46.37■■■■■ 5.01
CUL4A-211ENST00000498562 TOP2BQ02880 1626 aa46.33■■■■■ 5.01
CUL4A-211ENST00000498562 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP46.3■■■■■ 5
CUL4A-211ENST00000498562 ADAMTS12P58397 1594 aa46.12■■■■■ 4.97
CUL4A-211ENST00000498562 GRIN2AQ12879 1464 aa46.08■■■■■ 4.97
CUL4A-211ENST00000498562 ERICH3Q5RHP9 1530 aa45.95■■■■■ 4.95
CUL4A-211ENST00000498562 CEP170Q5SW79 1584 aa45.94■■■■■ 4.94
CUL4A-211ENST00000498562 TRHP20396 242 aaPredicted RBP45.93■■■■■ 4.94
CUL4A-211ENST00000498562 FHAD1B1AJZ9 1412 aa45.93■■■■■ 4.94
CUL4A-211ENST00000498562 NUP160Q12769 1436 aa45.93■■■■■ 4.94
CUL4A-211ENST00000498562 ERCC6L2Q5T890 1561 aa45.81■■■■■ 4.92
CUL4A-211ENST00000498562 SHROOM2Q13796 1616 aa45.75■■■■■ 4.91
CUL4A-211ENST00000498562 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa45.48■■■■■ 4.87
CUL4A-211ENST00000498562 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP45.42■■■■■ 4.86
CUL4A-211ENST00000498562 KIF27Q86VH2 1401 aa45.36■■■■■ 4.85
CUL4A-211ENST00000498562 JPH4Q96JJ6 628 aa45.35■■■■■ 4.85
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