RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490386.1

CLEC3B-203, Transcript of C-type lectin domain family 3 member B, humanhuman

TSL 3

Gene CLEC3B, Length 708 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC3B-203ENST00000490386 NISCHQ9Y2I1 1504 aa71.43■■■■■ 9.03
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CLEC3B-203ENST00000490386 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa60.57■■■■■ 7.29
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CLEC3B-203ENST00000490386 DCAF8L2P0C7V8 631 aa60.21■■■■■ 7.23
CLEC3B-203ENST00000490386 MYO15BQ96JP2 1530 aa59.73■■■■■ 7.15
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CLEC3B-203ENST00000490386 UNC13AQ9UPW8 1703 aa58.9■■■■■ 7.02
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CLEC3B-203ENST00000490386 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa57.21■■■■■ 6.75
CLEC3B-203ENST00000490386 CECR2Q9BXF3 1484 aa57.08■■■■■ 6.73
CLEC3B-203ENST00000490386 NCAPD3P42695 1498 aa55.74■■■■■ 6.51
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CLEC3B-203ENST00000490386 SMARCA4P51532 1647 aa55.53■■■■■ 6.48
CLEC3B-203ENST00000490386 SMARCA2P51531 1590 aa55.45■■■■■ 6.47
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CLEC3B-203ENST00000490386 PEG3Q9GZU2 1588 aa55.06■■■■■ 6.4
CLEC3B-203ENST00000490386 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP55.05■■■■■ 6.4
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CLEC3B-203ENST00000490386 ERCC6Q03468 1493 aa54.73■■■■■ 6.35
CLEC3B-203ENST00000490386 NESP48681 1621 aa54.52■■■■■ 6.32
CLEC3B-203ENST00000490386 CUX2O14529 1486 aa54.5■■■■■ 6.32
CLEC3B-203ENST00000490386 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa54.31■■■■■ 6.28
CLEC3B-203ENST00000490386 WIZO95785 1651 aa54.27■■■■■ 6.28
CLEC3B-203ENST00000490386 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP54.12■■■■■ 6.25
CLEC3B-203ENST00000490386 PDS5BQ9NTI5 1447 aa54.11■■■■■ 6.25
CLEC3B-203ENST00000490386 CADPSQ9ULU8 1353 aa54.09■■■■■ 6.25
CLEC3B-203ENST00000490386 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa54■■■■■ 6.24
CLEC3B-203ENST00000490386 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP53.8■■■■■ 6.2
CLEC3B-203ENST00000490386 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP53.72■■■■■ 6.19
CLEC3B-203ENST00000490386 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa53.7■■■■■ 6.19
CLEC3B-203ENST00000490386 CFTRP13569 1480 aa53.52■■■■■ 6.16
CLEC3B-203ENST00000490386 MRC2Q9UBG0 1479 aa53.5■■■■■ 6.15
CLEC3B-203ENST00000490386 CEP164Q9UPV0 1460 aa53.39■■■■■ 6.14
CLEC3B-203ENST00000490386 FANCD2Q9BXW9 1451 aa53.38■■■■■ 6.14
CLEC3B-203ENST00000490386 WDR62O43379 1518 aa53.3■■■■■ 6.12
CLEC3B-203ENST00000490386 CCDC88BA6NC98 1476 aa53.15■■■■■ 6.1
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CLEC3B-203ENST00000490386 PRDM2Q13029 1718 aa52.74■■■■■ 6.03
CLEC3B-203ENST00000490386 ABCC8Q09428 1581 aa52.47■■■■■ 5.99
CLEC3B-203ENST00000490386 TOPBP1Q92547 1522 aa52.39■■■■■ 5.98
CLEC3B-203ENST00000490386 IFT140Q96RY7 1462 aa52.36■■■■■ 5.97
CLEC3B-203ENST00000490386 OSCARQ8IYS5 282 aa52.24■■■■■ 5.95
CLEC3B-203ENST00000490386 DNMBPQ6XZF7 1577 aa52.22■■■■■ 5.95
CLEC3B-203ENST00000490386 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP52.14■■■■■ 5.94
CLEC3B-203ENST00000490386 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP52.1■■■■■ 5.93
CLEC3B-203ENST00000490386 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP51.88■■■■■ 5.9
CLEC3B-203ENST00000490386 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP51.82■■■■■ 5.89
CLEC3B-203ENST00000490386 SOGA1O94964 1423 aa51.77■■■■■ 5.88
CLEC3B-203ENST00000490386 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP51.76■■■■■ 5.88
CLEC3B-203ENST00000490386 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP51.76■■■■■ 5.881e-6■■■■□ 23.1
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CLEC3B-203ENST00000490386 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa51.67■■■■■ 5.86
CLEC3B-203ENST00000490386 CUX1P39880 1505 aa51.63■■■■■ 5.86
CLEC3B-203ENST00000490386 FGD5Q6ZNL6 1462 aa51.62■■■■■ 5.85
CLEC3B-203ENST00000490386 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP51.56■■■■■ 5.84
CLEC3B-203ENST00000490386 WDR97A6NE52 1622 aa51.45■■■■■ 5.83
CLEC3B-203ENST00000490386 FBLN2P98095 1184 aa51.42■■■■■ 5.82
CLEC3B-203ENST00000490386 GRIN2BQ13224 1484 aa51.23■■■■■ 5.79
CLEC3B-203ENST00000490386 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa51.21■■■■■ 5.79
CLEC3B-203ENST00000490386 CHD1O14646 1710 aa51.21■■■■■ 5.79
CLEC3B-203ENST00000490386 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa51.2■■■■■ 5.79
CLEC3B-203ENST00000490386 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa51.2■■■■■ 5.79
CLEC3B-203ENST00000490386 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa51.2■■■■■ 5.79
CLEC3B-203ENST00000490386 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP51.19■■■■■ 5.79
CLEC3B-203ENST00000490386 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP51.18■■■■■ 5.78
CLEC3B-203ENST00000490386 ARHGEF11O15085 1522 aa51.16■■■■■ 5.78
CLEC3B-203ENST00000490386 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa51.13■■■■■ 5.77
CLEC3B-203ENST00000490386 GAPVD1Q14C86 1478 aa51.1■■■■■ 5.77
CLEC3B-203ENST00000490386 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP51.1■■■■■ 5.77
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CLEC3B-203ENST00000490386 TOP2BQ02880 1626 aa50.95■■■■■ 5.75
CLEC3B-203ENST00000490386 CYB5RLQ6IPT4 315 aa50.91■■■■■ 5.74
CLEC3B-203ENST00000490386 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa50.88■■■■■ 5.74
CLEC3B-203ENST00000490386 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa50.87■■■■■ 5.73
CLEC3B-203ENST00000490386 SYNJ1O43426 1573 aa50.85■■■■■ 5.73
CLEC3B-203ENST00000490386 PBRM1Q86U86 1689 aa50.81■■■■■ 5.72
CLEC3B-203ENST00000490386 CLASP1Q7Z460 1538 aa50.77■■■■■ 5.72
CLEC3B-203ENST00000490386 ARAP1Q96P48 1450 aa50.68■■■■■ 5.7
CLEC3B-203ENST00000490386 GRIN2AQ12879 1464 aa50.52■■■■■ 5.68
CLEC3B-203ENST00000490386 FHAD1B1AJZ9 1412 aa50.52■■■■■ 5.68
CLEC3B-203ENST00000490386 ERICH3Q5RHP9 1530 aa50.5■■■■■ 5.67
CLEC3B-203ENST00000490386 ADAMTS12P58397 1594 aa50.46■■■■■ 5.67
CLEC3B-203ENST00000490386 NUP160Q12769 1436 aa50.36■■■■■ 5.65
CLEC3B-203ENST00000490386 CEP170Q5SW79 1584 aa50.21■■■■■ 5.63
CLEC3B-203ENST00000490386 TRHP20396 242 aaPredicted RBP50.19■■■■■ 5.63
CLEC3B-203ENST00000490386 KIF27Q86VH2 1401 aa50.12■■■■■ 5.61
CLEC3B-203ENST00000490386 IGF1RP08069 1367 aa50.04■■■■■ 5.6
CLEC3B-203ENST00000490386 JPH4Q96JJ6 628 aa49.99■■■■■ 5.59
CLEC3B-203ENST00000490386 SHROOM2Q13796 1616 aa49.96■■■■■ 5.59
CLEC3B-203ENST00000490386 ERCC6L2Q5T890 1561 aa49.94■■■■■ 5.59
CLEC3B-203ENST00000490386 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP49.85■■■■■ 5.57
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