RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578520.5

TMEM241-211, Transcript of transmembrane protein 241, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene TMEM241, Length 692 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM241-211ENST00000578520 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.31■■■■■ 6.77
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TMEM241-211ENST00000578520 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.76■■■■■ 5.4
TMEM241-211ENST00000578520 NACADO15069 1562 aa48.47■■■■■ 5.35
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TMEM241-211ENST00000578520 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.88■■■■■ 5.26
TMEM241-211ENST00000578520 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.7■■■■■ 5.23
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TMEM241-211ENST00000578520 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.39■■■■■ 5.18
TMEM241-211ENST00000578520 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.27■■■■■ 5.16
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TMEM241-211ENST00000578520 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.74■■■■■ 5.07
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TMEM241-211ENST00000578520 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.92■■■■■ 4.94
TMEM241-211ENST00000578520 SMARCA4P51532 1647 aa44.71■■■■■ 4.75
TMEM241-211ENST00000578520 NCAPD3P42695 1498 aa44.66■■■■■ 4.74
TMEM241-211ENST00000578520 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.6■■■■■ 4.73
TMEM241-211ENST00000578520 SMARCA2P51531 1590 aa44.56■■■■■ 4.72
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TMEM241-211ENST00000578520 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.25■■■■■ 4.67
TMEM241-211ENST00000578520 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.23■■■■■ 4.67
TMEM241-211ENST00000578520 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.16■■■■■ 4.66
TMEM241-211ENST00000578520 ERCC6Q03468 1493 aa44.07■■■■■ 4.65
TMEM241-211ENST00000578520 NESP48681 1621 aa43.89■■■■■ 4.62
TMEM241-211ENST00000578520 CUX2O14529 1486 aa43.87■■■■■ 4.61
TMEM241-211ENST00000578520 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.71■■■■■ 4.59
TMEM241-211ENST00000578520 WIZO95785 1651 aa43.68■■■■■ 4.58
TMEM241-211ENST00000578520 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.49■■■■■ 4.55
TMEM241-211ENST00000578520 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.45■■■■■ 4.55
TMEM241-211ENST00000578520 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.38■■■■■ 4.53
TMEM241-211ENST00000578520 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.34■■■■■ 4.53
TMEM241-211ENST00000578520 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.31■■■■■ 4.52
TMEM241-211ENST00000578520 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.31■■■■■ 4.52
TMEM241-211ENST00000578520 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.18■■■■■ 4.5
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TMEM241-211ENST00000578520 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.94■■■■■ 4.46
TMEM241-211ENST00000578520 WDR62O43379 1518 aa42.93■■■■■ 4.46
TMEM241-211ENST00000578520 CFTRP13569 1480 aa42.92■■■■■ 4.46
TMEM241-211ENST00000578520 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.88■■■■■ 4.46
TMEM241-211ENST00000578520 PRDM2Q13029 1718 aa42.71■■■■■ 4.43
TMEM241-211ENST00000578520 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.6■■■■■ 4.41
TMEM241-211ENST00000578520 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.51■■■■■ 4.39
TMEM241-211ENST00000578520 TOPBP1Q92547 1522 aa42.11■■■■■ 4.33
TMEM241-211ENST00000578520 ABCC8Q09428 1581 aa42.04■■■■■ 4.32
TMEM241-211ENST00000578520 IFT140Q96RY7 1462 aa42.04■■■■■ 4.32
TMEM241-211ENST00000578520 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.03■■■■■ 4.32
TMEM241-211ENST00000578520 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.91■■■■■ 4.3
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TMEM241-211ENST00000578520 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.5■■■■■ 4.23
TMEM241-211ENST00000578520 CUX1P39880 1505 aa41.49■■■■■ 4.23
TMEM241-211ENST00000578520 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.49■■■■■ 4.23
TMEM241-211ENST00000578520 SOGA1O94964 1423 aa41.45■■■■■ 4.23
TMEM241-211ENST00000578520 CHD1O14646 1710 aa41.45■■■■■ 4.23
TMEM241-211ENST00000578520 WDR97A6NE52 1622 aa41.39■■■■■ 4.22
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TMEM241-211ENST00000578520 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.36■■■■■ 4.21
TMEM241-211ENST00000578520 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.36■■■■■ 4.21
TMEM241-211ENST00000578520 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.32■■■■■ 4.21
TMEM241-211ENST00000578520 ARHGEF11O15085 1522 aa41.24■■■■■ 4.19
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TMEM241-211ENST00000578520 GRIN2BQ13224 1484 aa41.12■■■■■ 4.17
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TMEM241-211ENST00000578520 PBRM1Q86U86 1689 aa41.1■■■■■ 4.17
TMEM241-211ENST00000578520 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.03■■■■■ 4.16
TMEM241-211ENST00000578520 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.01■■■■■ 4.16
TMEM241-211ENST00000578520 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41■■■■■ 4.15
TMEM241-211ENST00000578520 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.98■■■■■ 4.15
TMEM241-211ENST00000578520 SYNJ2O15056 1496 aa40.96■■■■■ 4.15
TMEM241-211ENST00000578520 SYNJ1O43426 1573 aa40.95■■■■■ 4.15
TMEM241-211ENST00000578520 TOP2BQ02880 1626 aa40.95■■■■■ 4.15
TMEM241-211ENST00000578520 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.93■■■■■ 4.14
TMEM241-211ENST00000578520 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.92■■■■■ 4.14
TMEM241-211ENST00000578520 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.91■■■■■ 4.14
TMEM241-211ENST00000578520 ARAP1Q96P48 1450 aa40.84■■■■■ 4.13
TMEM241-211ENST00000578520 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.8■■■■■ 4.12
TMEM241-211ENST00000578520 ADAMTS12P58397 1594 aa40.69■■■■■ 4.1
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TMEM241-211ENST00000578520 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.55■■■■■ 4.08
TMEM241-211ENST00000578520 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.49■■■■■ 4.07
TMEM241-211ENST00000578520 CEP170Q5SW79 1584 aa40.46■■■■■ 4.07
TMEM241-211ENST00000578520 NUP160Q12769 1436 aa40.43■■■■■ 4.06
TMEM241-211ENST00000578520 TRHP20396 242 aaPredicted RBP40.28■■■■■ 4.04
TMEM241-211ENST00000578520 SHROOM2Q13796 1616 aa40.27■■■■■ 4.04
TMEM241-211ENST00000578520 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.27■■■■■ 4.04
TMEM241-211ENST00000578520 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.11■■■■■ 4.01
TMEM241-211ENST00000578520 KIF27Q86VH2 1401 aa40.11■■■■■ 4.01
TMEM241-211ENST00000578520 CUL7Q14999 1698 aa40.08■■■■■ 4.01
TMEM241-211ENST00000578520 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP39.99■■■■□ 3.99
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