RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528032.5

ZNF48-204, Transcript of zinc finger protein 48, humanhuman

TSL 4

Gene ZNF48, Length 555 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF48-204ENST00000528032 NISCHQ9Y2I1 1504 aa60.64■■■■■ 7.3
ZNF48-204ENST00000528032 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa54.01■■■■■ 6.24
ZNF48-204ENST00000528032 ABCC9O60706 1549 aa52.71■■■■■ 6.03
ZNF48-204ENST00000528032 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa50.8■■■■■ 5.72
ZNF48-204ENST00000528032 NACADO15069 1562 aa50.74■■■■■ 5.71
ZNF48-204ENST00000528032 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP50.53■■■■■ 5.68
ZNF48-204ENST00000528032 DCAF8L2P0C7V8 631 aa50.51■■■■■ 5.68
ZNF48-204ENST00000528032 MYO15BQ96JP2 1530 aa50.47■■■■■ 5.67
ZNF48-204ENST00000528032 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa50.24■■■■■ 5.63
ZNF48-204ENST00000528032 UNC13AQ9UPW8 1703 aa49.63■■■■■ 5.54
ZNF48-204ENST00000528032 BICRAQ9NZM4 1560 aa49.22■■■■■ 5.47
ZNF48-204ENST00000528032 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP49.18■■■■■ 5.46
ZNF48-204ENST00000528032 SCRIBQ14160 1630 aa49.17■■■■■ 5.46
ZNF48-204ENST00000528032 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa48.83■■■■■ 5.41
ZNF48-204ENST00000528032 DNAJC5BQ9UF47 199 aa48.3■■■■■ 5.32
ZNF48-204ENST00000528032 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP47.94■■■■■ 5.26
ZNF48-204ENST00000528032 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa47.73■■■■■ 5.23
ZNF48-204ENST00000528032 CECR2Q9BXF3 1484 aa47.4■■■■■ 5.18
ZNF48-204ENST00000528032 SMARCA4P51532 1647 aa47.08■■■■■ 5.13
ZNF48-204ENST00000528032 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP47.03■■■■■ 5.12
ZNF48-204ENST00000528032 SMARCA2P51531 1590 aa46.79■■■■■ 5.08
ZNF48-204ENST00000528032 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa46.79■■■■■ 5.08
ZNF48-204ENST00000528032 NCAPD3P42695 1498 aa46.78■■■■■ 5.08
ZNF48-204ENST00000528032 MROH2BQ7Z745 1585 aa46.69■■■■■ 5.07
ZNF48-204ENST00000528032 PEG3Q9GZU2 1588 aa46.65■■■■■ 5.06
ZNF48-204ENST00000528032 HMGXB3Q12766 1538 aa46.61■■■■■ 5.05
ZNF48-204ENST00000528032 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP46.42■■■■■ 5.02
ZNF48-204ENST00000528032 WIZO95785 1651 aa46.2■■■■■ 4.99
ZNF48-204ENST00000528032 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP46.16■■■■■ 4.98
ZNF48-204ENST00000528032 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP45.77■■■■■ 4.92
ZNF48-204ENST00000528032 NESP48681 1621 aa45.6■■■■■ 4.89
ZNF48-204ENST00000528032 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa45.59■■■■■ 4.89
ZNF48-204ENST00000528032 ERCC6Q03468 1493 aa45.48■■■■■ 4.87
ZNF48-204ENST00000528032 CADPSQ9ULU8 1353 aa45.4■■■■■ 4.86
ZNF48-204ENST00000528032 PDS5BQ9NTI5 1447 aa45.26■■■■■ 4.84
ZNF48-204ENST00000528032 CCDC88BA6NC98 1476 aa45.17■■■■■ 4.82
ZNF48-204ENST00000528032 CFTRP13569 1480 aa45.15■■■■■ 4.82
ZNF48-204ENST00000528032 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa45.13■■■■■ 4.82
ZNF48-204ENST00000528032 CUX2O14529 1486 aa45.06■■■■■ 4.8
ZNF48-204ENST00000528032 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP45■■■■■ 4.79
ZNF48-204ENST00000528032 FANCD2Q9BXW9 1451 aa44.89■■■■■ 4.78
ZNF48-204ENST00000528032 PRDM2Q13029 1718 aa44.89■■■■■ 4.78
ZNF48-204ENST00000528032 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP44.87■■■■■ 4.77
ZNF48-204ENST00000528032 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.85■■■■■ 4.77
ZNF48-204ENST00000528032 MRC2Q9UBG0 1479 aa44.79■■■■■ 4.76
ZNF48-204ENST00000528032 WDR62O43379 1518 aa44.66■■■■■ 4.74
ZNF48-204ENST00000528032 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP44.43■■■■■ 4.7
ZNF48-204ENST00000528032 ABCC8Q09428 1581 aa44.22■■■■■ 4.67
ZNF48-204ENST00000528032 TOPBP1Q92547 1522 aa44.17■■■■■ 4.66
ZNF48-204ENST00000528032 DNMBPQ6XZF7 1577 aa44.16■■■■■ 4.66
ZNF48-204ENST00000528032 IFT140Q96RY7 1462 aa43.92■■■■■ 4.62
ZNF48-204ENST00000528032 CUX1P39880 1505 aa43.83■■■■■ 4.61
ZNF48-204ENST00000528032 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP43.8■■■■■ 4.6
ZNF48-204ENST00000528032 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP43.71■■■■■ 4.59
ZNF48-204ENST00000528032 FGD5Q6ZNL6 1462 aa43.68■■■■■ 4.58
ZNF48-204ENST00000528032 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP43.66■■■■■ 4.58
ZNF48-204ENST00000528032 SOGA1O94964 1423 aa43.58■■■■■ 4.57
ZNF48-204ENST00000528032 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.58■■■■■ 4.57
ZNF48-204ENST00000528032 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa43.56■■■■■ 4.56
ZNF48-204ENST00000528032 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP43.55■■■■■ 4.56
ZNF48-204ENST00000528032 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP43.54■■■■■ 4.56
ZNF48-204ENST00000528032 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa43.5■■■■■ 4.55
ZNF48-204ENST00000528032 TOP2BQ02880 1626 aa43.49■■■■■ 4.55
ZNF48-204ENST00000528032 WDR97A6NE52 1622 aa43.46■■■■■ 4.55
ZNF48-204ENST00000528032 SYNJ1O43426 1573 aa43.44■■■■■ 4.54
ZNF48-204ENST00000528032 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP43.4■■■■■ 4.54
ZNF48-204ENST00000528032 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP43.3■■■■■ 4.52
ZNF48-204ENST00000528032 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa43.29■■■■■ 4.52
ZNF48-204ENST00000528032 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa43.14■■■■■ 4.5
ZNF48-204ENST00000528032 GRIN2BQ13224 1484 aa43.13■■■■■ 4.49
ZNF48-204ENST00000528032 GAPVD1Q14C86 1478 aa43.11■■■■■ 4.49
ZNF48-204ENST00000528032 OSCARQ8IYS5 282 aa43.09■■■■■ 4.49
ZNF48-204ENST00000528032 PBRM1Q86U86 1689 aa43.07■■■■■ 4.49
ZNF48-204ENST00000528032 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa43.05■■■■■ 4.48
ZNF48-204ENST00000528032 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP43.04■■■■■ 4.48
ZNF48-204ENST00000528032 CHD1O14646 1710 aa43■■■■■ 4.47
ZNF48-204ENST00000528032 SYNJ2O15056 1496 aa42.85■■■■■ 4.45
ZNF48-204ENST00000528032 FBLN2P98095 1184 aa42.84■■■■■ 4.45
ZNF48-204ENST00000528032 ERICH3Q5RHP9 1530 aa42.79■■■■■ 4.44
ZNF48-204ENST00000528032 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP42.77■■■■■ 4.44
ZNF48-204ENST00000528032 ADAMTS12P58397 1594 aa42.72■■■■■ 4.43
ZNF48-204ENST00000528032 KIF27Q86VH2 1401 aa42.64■■■■■ 4.42
ZNF48-204ENST00000528032 FHAD1B1AJZ9 1412 aa42.63■■■■■ 4.41
ZNF48-204ENST00000528032 GRIN2AQ12879 1464 aa42.56■■■■■ 4.4
ZNF48-204ENST00000528032 CLASP1Q7Z460 1538 aa42.55■■■■■ 4.4
ZNF48-204ENST00000528032 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa42.46■■■■■ 4.39
ZNF48-204ENST00000528032 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa42.46■■■■■ 4.39
ZNF48-204ENST00000528032 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa42.46■■■■■ 4.39
ZNF48-204ENST00000528032 ARHGEF11O15085 1522 aa42.45■■■■■ 4.39
ZNF48-204ENST00000528032 TRIM41Q8WV44 630 aa42.43■■■■■ 4.38
ZNF48-204ENST00000528032 IGF1RP08069 1367 aa42.42■■■■■ 4.38
ZNF48-204ENST00000528032 CUL7Q14999 1698 aa42.42■■■■■ 4.38
ZNF48-204ENST00000528032 NUP160Q12769 1436 aa42.38■■■■■ 4.38
ZNF48-204ENST00000528032 CEP170Q5SW79 1584 aa42.35■■■■■ 4.37
ZNF48-204ENST00000528032 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa42.19■■■■■ 4.34
ZNF48-204ENST00000528032 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa42.16■■■■■ 4.34
ZNF48-204ENST00000528032 SHROOM2Q13796 1616 aa42.09■■■■■ 4.33
ZNF48-204ENST00000528032 ARAP1Q96P48 1450 aa42.09■■■■■ 4.33
ZNF48-204ENST00000528032 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa41.98■■■■■ 4.31
ZNF48-204ENST00000528032 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa41.97■■■■■ 4.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.2 ms