RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545774.5

MVK-211, Transcript of mevalonate kinase, humanhuman

TSL 3

Gene MVK, Length 702 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVK-211ENST00000545774 NISCHQ9Y2I1 1504 aa65.59■■■■■ 8.09
MVK-211ENST00000545774 ABCC9O60706 1549 aa59.44■■■■■ 7.11
MVK-211ENST00000545774 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa59.07■■■■■ 7.05
MVK-211ENST00000545774 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa56.44■■■■■ 6.63
MVK-211ENST00000545774 DNAJC5BQ9UF47 199 aa56.16■■■■■ 6.58
MVK-211ENST00000545774 NACADO15069 1562 aa55.96■■■■■ 6.55
MVK-211ENST00000545774 DCAF8L2P0C7V8 631 aa55.47■■■■■ 6.47
MVK-211ENST00000545774 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP55.25■■■■■ 6.44
MVK-211ENST00000545774 UNC13AQ9UPW8 1703 aa55.12■■■■■ 6.41
MVK-211ENST00000545774 MYO15BQ96JP2 1530 aa55.1■■■■■ 6.41
MVK-211ENST00000545774 BICRAQ9NZM4 1560 aa54.8■■■■■ 6.36
MVK-211ENST00000545774 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP54.27■■■■■ 6.28
MVK-211ENST00000545774 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa54.21■■■■■ 6.27
MVK-211ENST00000545774 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa54.1■■■■■ 6.25
MVK-211ENST00000545774 SCRIBQ14160 1630 aa53.72■■■■■ 6.19
MVK-211ENST00000545774 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa53.7■■■■■ 6.19
MVK-211ENST00000545774 CECR2Q9BXF3 1484 aa53.63■■■■■ 6.18
MVK-211ENST00000545774 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP53.49■■■■■ 6.15
MVK-211ENST00000545774 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa51.96■■■■■ 5.91
MVK-211ENST00000545774 NCAPD3P42695 1498 aa51.68■■■■■ 5.86
MVK-211ENST00000545774 CUX2O14529 1486 aa51.48■■■■■ 5.83
MVK-211ENST00000545774 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa51.43■■■■■ 5.82
MVK-211ENST00000545774 ERCC6Q03468 1493 aa51.37■■■■■ 5.81
MVK-211ENST00000545774 SMARCA2P51531 1590 aa51.28■■■■■ 5.8
MVK-211ENST00000545774 SMARCA4P51532 1647 aa51.25■■■■■ 5.79
MVK-211ENST00000545774 HMGXB3Q12766 1538 aa51.24■■■■■ 5.79
MVK-211ENST00000545774 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP50.95■■■■■ 5.75
MVK-211ENST00000545774 NESP48681 1621 aa50.93■■■■■ 5.74
MVK-211ENST00000545774 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP50.9■■■■■ 5.74
MVK-211ENST00000545774 PEG3Q9GZU2 1588 aa50.81■■■■■ 5.72
MVK-211ENST00000545774 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa50.57■■■■■ 5.69
MVK-211ENST00000545774 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP50.54■■■■■ 5.68
MVK-211ENST00000545774 MROH2BQ7Z745 1585 aa50.51■■■■■ 5.68
MVK-211ENST00000545774 PDS5BQ9NTI5 1447 aa50.3■■■■■ 5.64
MVK-211ENST00000545774 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa50.27■■■■■ 5.64
MVK-211ENST00000545774 CADPSQ9ULU8 1353 aa50.06■■■■■ 5.6
MVK-211ENST00000545774 MRC2Q9UBG0 1479 aa49.88■■■■■ 5.57
MVK-211ENST00000545774 WIZO95785 1651 aa49.86■■■■■ 5.57
MVK-211ENST00000545774 WDR62O43379 1518 aa49.77■■■■■ 5.56
MVK-211ENST00000545774 CEP164Q9UPV0 1460 aa49.58■■■■■ 5.53
MVK-211ENST00000545774 FANCD2Q9BXW9 1451 aa49.48■■■■■ 5.51
MVK-211ENST00000545774 TRIM41Q8WV44 630 aa49.41■■■■■ 5.5
MVK-211ENST00000545774 CFTRP13569 1480 aa49.41■■■■■ 5.5
MVK-211ENST00000545774 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP49.32■■■■■ 5.49
MVK-211ENST00000545774 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP49.24■■■■■ 5.47
MVK-211ENST00000545774 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP49.09■■■■■ 5.45
MVK-211ENST00000545774 OSCARQ8IYS5 282 aa49.05■■■■■ 5.44
MVK-211ENST00000545774 PRDM2Q13029 1718 aa48.86■■■■■ 5.41
MVK-211ENST00000545774 CCDC88BA6NC98 1476 aa48.67■■■■■ 5.38
MVK-211ENST00000545774 IFT140Q96RY7 1462 aa48.62■■■■■ 5.37
MVK-211ENST00000545774 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP48.54■■■■■ 5.36
MVK-211ENST00000545774 TOPBP1Q92547 1522 aa48.49■■■■■ 5.35
MVK-211ENST00000545774 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa48.43■■■■■ 5.34
MVK-211ENST00000545774 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa48.43■■■■■ 5.34
MVK-211ENST00000545774 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa48.43■■■■■ 5.34
MVK-211ENST00000545774 ABCC8Q09428 1581 aa48.41■■■■■ 5.34
MVK-211ENST00000545774 DNMBPQ6XZF7 1577 aa48.29■■■■■ 5.32
MVK-211ENST00000545774 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP48.26■■■■■ 5.32
MVK-211ENST00000545774 ARHGEF11O15085 1522 aa48.24■■■■■ 5.31
MVK-211ENST00000545774 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP48.1■■■■■ 5.29
MVK-211ENST00000545774 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP48.05■■■■■ 5.281e-6■■■■□ 23.8
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MVK-211ENST00000545774 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP47.97■■■■■ 5.27
MVK-211ENST00000545774 CYB5RLQ6IPT4 315 aa47.89■■■■■ 5.26
MVK-211ENST00000545774 FBLN2P98095 1184 aa47.81■■■■■ 5.24
MVK-211ENST00000545774 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa47.78■■■■■ 5.24
MVK-211ENST00000545774 SOGA1O94964 1423 aa47.74■■■■■ 5.23
MVK-211ENST00000545774 ARAP1Q96P48 1450 aa47.73■■■■■ 5.23
MVK-211ENST00000545774 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP47.69■■■■■ 5.22
MVK-211ENST00000545774 WDR97A6NE52 1622 aa47.63■■■■■ 5.22
MVK-211ENST00000545774 FGD5Q6ZNL6 1462 aa47.59■■■■■ 5.21
MVK-211ENST00000545774 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa47.55■■■■■ 5.2
MVK-211ENST00000545774 TRHP20396 242 aaPredicted RBP47.49■■■■■ 5.19
MVK-211ENST00000545774 CUX1P39880 1505 aa47.48■■■■■ 5.19
MVK-211ENST00000545774 CLASP1Q7Z460 1538 aa47.46■■■■■ 5.19
MVK-211ENST00000545774 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP47.46■■■■■ 5.19
MVK-211ENST00000545774 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP47.42■■■■■ 5.18
MVK-211ENST00000545774 GRIN2BQ13224 1484 aa47.4■■■■■ 5.18
MVK-211ENST00000545774 SYNJ1O43426 1573 aa47.39■■■■■ 5.18
MVK-211ENST00000545774 SYNJ2O15056 1496 aa47.29■■■■■ 5.16
MVK-211ENST00000545774 GAPVD1Q14C86 1478 aa47.16■■■■■ 5.14
MVK-211ENST00000545774 PBRM1Q86U86 1689 aa47.14■■■■■ 5.14
MVK-211ENST00000545774 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa47.06■■■■■ 5.12
MVK-211ENST00000545774 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa47.01■■■■■ 5.12
MVK-211ENST00000545774 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP46.79■■■■■ 5.08
MVK-211ENST00000545774 GRIN2AQ12879 1464 aa46.78■■■■■ 5.08
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MVK-211ENST00000545774 NUP160Q12769 1436 aa46.66■■■■■ 5.06
MVK-211ENST00000545774 ERCC6L2Q5T890 1561 aa46.64■■■■■ 5.06
MVK-211ENST00000545774 TOP2BQ02880 1626 aa46.62■■■■■ 5.05
MVK-211ENST00000545774 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa46.62■■■■■ 5.05
MVK-211ENST00000545774 CEP170Q5SW79 1584 aa46.61■■■■■ 5.05
MVK-211ENST00000545774 FHAD1B1AJZ9 1412 aa46.56■■■■■ 5.04
MVK-211ENST00000545774 SHROOM2Q13796 1616 aa46.5■■■■■ 5.03
MVK-211ENST00000545774 ERICH3Q5RHP9 1530 aa46.48■■■■■ 5.03
MVK-211ENST00000545774 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP46.45■■■■■ 5.03
MVK-211ENST00000545774 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP46.22■■■■■ 4.99
MVK-211ENST00000545774 JPH4Q96JJ6 628 aa46.16■■■■■ 4.98
MVK-211ENST00000545774 KIF13AQ9H1H9 1805 aa46.08■■■■■ 4.97
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