RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591914.5

SMAD4-213, Transcript of SMAD family member 4, humanhuman

TSL 3

Gene SMAD4, Length 992 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4-213ENST00000591914 NISCHQ9Y2I1 1504 aa66.92■■■■■ 8.3
SMAD4-213ENST00000591914 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa59.67■■■■■ 7.14
SMAD4-213ENST00000591914 ABCC9O60706 1549 aa58.67■■■■■ 6.98
SMAD4-213ENST00000591914 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa56.31■■■■■ 6.6
SMAD4-213ENST00000591914 NACADO15069 1562 aa56.17■■■■■ 6.58
SMAD4-213ENST00000591914 DCAF8L2P0C7V8 631 aa55.93■■■■■ 6.54
SMAD4-213ENST00000591914 MYO15BQ96JP2 1530 aa55.77■■■■■ 6.52
SMAD4-213ENST00000591914 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP55.69■■■■■ 6.5
SMAD4-213ENST00000591914 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa55.39■■■■■ 6.46
SMAD4-213ENST00000591914 UNC13AQ9UPW8 1703 aa55.05■■■■■ 6.4
SMAD4-213ENST00000591914 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP54.74■■■■■ 6.35
SMAD4-213ENST00000591914 BICRAQ9NZM4 1560 aa54.65■■■■■ 6.34
SMAD4-213ENST00000591914 SCRIBQ14160 1630 aa54.37■■■■■ 6.29
SMAD4-213ENST00000591914 DNAJC5BQ9UF47 199 aa54.19■■■■■ 6.27
SMAD4-213ENST00000591914 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa54.06■■■■■ 6.24
SMAD4-213ENST00000591914 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP53.22■■■■■ 6.11
SMAD4-213ENST00000591914 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa53.08■■■■■ 6.09
SMAD4-213ENST00000591914 CECR2Q9BXF3 1484 aa52.77■■■■■ 6.04
SMAD4-213ENST00000591914 SMARCA4P51532 1647 aa52■■■■■ 5.92
SMAD4-213ENST00000591914 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP51.89■■■■■ 5.9
SMAD4-213ENST00000591914 NCAPD3P42695 1498 aa51.85■■■■■ 5.89
SMAD4-213ENST00000591914 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa51.8■■■■■ 5.88
SMAD4-213ENST00000591914 SMARCA2P51531 1590 aa51.73■■■■■ 5.87
SMAD4-213ENST00000591914 HMGXB3Q12766 1538 aa51.56■■■■■ 5.84
SMAD4-213ENST00000591914 MROH2BQ7Z745 1585 aa51.56■■■■■ 5.84
SMAD4-213ENST00000591914 PEG3Q9GZU2 1588 aa51.53■■■■■ 5.84
SMAD4-213ENST00000591914 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP51.35■■■■■ 5.81
SMAD4-213ENST00000591914 WIZO95785 1651 aa50.98■■■■■ 5.75
SMAD4-213ENST00000591914 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP50.85■■■■■ 5.73
SMAD4-213ENST00000591914 NESP48681 1621 aa50.69■■■■■ 5.7
SMAD4-213ENST00000591914 ERCC6Q03468 1493 aa50.59■■■■■ 5.69
SMAD4-213ENST00000591914 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa50.52■■■■■ 5.68
SMAD4-213ENST00000591914 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP50.43■■■■■ 5.66
SMAD4-213ENST00000591914 CADPSQ9ULU8 1353 aa50.29■■■■■ 5.64
SMAD4-213ENST00000591914 CUX2O14529 1486 aa50.22■■■■■ 5.63
SMAD4-213ENST00000591914 PDS5BQ9NTI5 1447 aa50.18■■■■■ 5.62
SMAD4-213ENST00000591914 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa50.08■■■■■ 5.61
SMAD4-213ENST00000591914 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP50.02■■■■■ 5.6
SMAD4-213ENST00000591914 CFTRP13569 1480 aa49.94■■■■■ 5.58
SMAD4-213ENST00000591914 CCDC88BA6NC98 1476 aa49.82■■■■■ 5.57
SMAD4-213ENST00000591914 FANCD2Q9BXW9 1451 aa49.71■■■■■ 5.55
SMAD4-213ENST00000591914 MRC2Q9UBG0 1479 aa49.69■■■■■ 5.55
SMAD4-213ENST00000591914 CEP164Q9UPV0 1460 aa49.69■■■■■ 5.54
SMAD4-213ENST00000591914 WDR62O43379 1518 aa49.56■■■■■ 5.52
SMAD4-213ENST00000591914 PRDM2Q13029 1718 aa49.53■■■■■ 5.52
SMAD4-213ENST00000591914 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP49.26■■■■■ 5.48
SMAD4-213ENST00000591914 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP49.2■■■■■ 5.47
SMAD4-213ENST00000591914 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa49.08■■■■■ 5.45
SMAD4-213ENST00000591914 TOPBP1Q92547 1522 aa48.88■■■■■ 5.42
SMAD4-213ENST00000591914 ABCC8Q09428 1581 aa48.85■■■■■ 5.41
SMAD4-213ENST00000591914 DNMBPQ6XZF7 1577 aa48.81■■■■■ 5.4
SMAD4-213ENST00000591914 IFT140Q96RY7 1462 aa48.67■■■■■ 5.38
SMAD4-213ENST00000591914 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP48.48■■■■■ 5.35
SMAD4-213ENST00000591914 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP48.45■■■■■ 5.35
SMAD4-213ENST00000591914 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP48.4■■■■■ 5.34
SMAD4-213ENST00000591914 CUX1P39880 1505 aa48.4■■■■■ 5.34
SMAD4-213ENST00000591914 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP48.28■■■■■ 5.32
SMAD4-213ENST00000591914 FGD5Q6ZNL6 1462 aa48.28■■■■■ 5.32
SMAD4-213ENST00000591914 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa48.23■■■■■ 5.31
SMAD4-213ENST00000591914 SOGA1O94964 1423 aa48.22■■■■■ 5.31
SMAD4-213ENST00000591914 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP48.14■■■■■ 5.31e-7■■■■□ 24.4
SMAD4-213ENST00000591914 OSCARQ8IYS5 282 aa48.04■■■■■ 5.28
SMAD4-213ENST00000591914 WDR97A6NE52 1622 aa48.01■■■■■ 5.28
SMAD4-213ENST00000591914 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP48■■■■■ 5.27
SMAD4-213ENST00000591914 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP47.93■■■■■ 5.26
SMAD4-213ENST00000591914 TOP2BQ02880 1626 aa47.89■■■■■ 5.26
SMAD4-213ENST00000591914 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa47.89■■■■■ 5.26
SMAD4-213ENST00000591914 SYNJ1O43426 1573 aa47.85■■■■■ 5.25
SMAD4-213ENST00000591914 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa47.81■■■■■ 5.24
SMAD4-213ENST00000591914 CHD1O14646 1710 aa47.73■■■■■ 5.23
SMAD4-213ENST00000591914 GRIN2BQ13224 1484 aa47.72■■■■■ 5.23
SMAD4-213ENST00000591914 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa47.7■■■■■ 5.23
SMAD4-213ENST00000591914 GAPVD1Q14C86 1478 aa47.66■■■■■ 5.22
SMAD4-213ENST00000591914 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa47.66■■■■■ 5.22
SMAD4-213ENST00000591914 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP47.64■■■■■ 5.22
SMAD4-213ENST00000591914 PBRM1Q86U86 1689 aa47.6■■■■■ 5.21
SMAD4-213ENST00000591914 FBLN2P98095 1184 aa47.57■■■■■ 5.21
SMAD4-213ENST00000591914 SYNJ2O15056 1496 aa47.46■■■■■ 5.19
SMAD4-213ENST00000591914 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP47.42■■■■■ 5.18
SMAD4-213ENST00000591914 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa47.34■■■■■ 5.17
SMAD4-213ENST00000591914 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa47.34■■■■■ 5.17
SMAD4-213ENST00000591914 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa47.34■■■■■ 5.17
SMAD4-213ENST00000591914 ARHGEF11O15085 1522 aa47.3■■■■■ 5.16
SMAD4-213ENST00000591914 TRIM41Q8WV44 630 aa47.24■■■■■ 5.15
SMAD4-213ENST00000591914 CLASP1Q7Z460 1538 aa47.24■■■■■ 5.15
SMAD4-213ENST00000591914 ERICH3Q5RHP9 1530 aa47.23■■■■■ 5.15
SMAD4-213ENST00000591914 ADAMTS12P58397 1594 aa47.22■■■■■ 5.15
SMAD4-213ENST00000591914 GRIN2AQ12879 1464 aa47.11■■■■■ 5.13
SMAD4-213ENST00000591914 FHAD1B1AJZ9 1412 aa47.11■■■■■ 5.13
SMAD4-213ENST00000591914 KIF27Q86VH2 1401 aa46.95■■■■■ 5.11
SMAD4-213ENST00000591914 NUP160Q12769 1436 aa46.93■■■■■ 5.1
SMAD4-213ENST00000591914 CEP170Q5SW79 1584 aa46.9■■■■■ 5.1
SMAD4-213ENST00000591914 ARAP1Q96P48 1450 aa46.9■■■■■ 5.1
SMAD4-213ENST00000591914 IGF1RP08069 1367 aa46.83■■■■■ 5.09
SMAD4-213ENST00000591914 CYB5RLQ6IPT4 315 aa46.82■■■■■ 5.09
SMAD4-213ENST00000591914 CUL7Q14999 1698 aa46.73■■■■■ 5.07
SMAD4-213ENST00000591914 SHROOM2Q13796 1616 aa46.64■■■■■ 5.06
SMAD4-213ENST00000591914 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa46.54■■■■■ 5.04
SMAD4-213ENST00000591914 ERCC6L2Q5T890 1561 aa46.53■■■■■ 5.04
SMAD4-213ENST00000591914 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa46.51■■■■■ 5.04
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