RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488558.2

CUL4A-209, Transcript of cullin 4A, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CUL4A, Length 1,111 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4A-209ENST00000488558 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.4■■■■■ 6.78
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CUL4A-209ENST00000488558 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.64■■■■■ 5.38
CUL4A-209ENST00000488558 NACADO15069 1562 aa48.44■■■■■ 5.35
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CUL4A-209ENST00000488558 SCRIBQ14160 1630 aa46.73■■■■■ 5.07
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CUL4A-209ENST00000488558 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.93■■■■■ 4.94
CUL4A-209ENST00000488558 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.68■■■■■ 4.9
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CUL4A-209ENST00000488558 NCAPD3P42695 1498 aa44.66■■■■■ 4.74
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CUL4A-209ENST00000488558 SMARCA2P51531 1590 aa44.55■■■■■ 4.72
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CUL4A-209ENST00000488558 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.18■■■■■ 4.66
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CUL4A-209ENST00000488558 NESP48681 1621 aa43.7■■■■■ 4.59
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CUL4A-209ENST00000488558 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.63■■■■■ 4.58
CUL4A-209ENST00000488558 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.44■■■■■ 4.54
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CUL4A-209ENST00000488558 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.29■■■■■ 4.52
CUL4A-209ENST00000488558 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.27■■■■■ 4.52
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CUL4A-209ENST00000488558 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa42.92■■■■■ 4.46
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CUL4A-209ENST00000488558 WDR62O43379 1518 aa42.83■■■■■ 4.45
CUL4A-209ENST00000488558 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.83■■■■■ 4.45
CUL4A-209ENST00000488558 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.8■■■■■ 4.44
CUL4A-209ENST00000488558 PRDM2Q13029 1718 aa42.68■■■■■ 4.42
CUL4A-209ENST00000488558 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.65■■■■■ 4.42
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CUL4A-209ENST00000488558 ABCC8Q09428 1581 aa42.07■■■■■ 4.33
CUL4A-209ENST00000488558 TOPBP1Q92547 1522 aa42.05■■■■■ 4.32
CUL4A-209ENST00000488558 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.01■■■■■ 4.32
CUL4A-209ENST00000488558 IFT140Q96RY7 1462 aa41.97■■■■■ 4.31
CUL4A-209ENST00000488558 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.77■■■■■ 4.28
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CUL4A-209ENST00000488558 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.66■■■■■ 4.26
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CUL4A-209ENST00000488558 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.46■■■■■ 4.23
CUL4A-209ENST00000488558 WDR97A6NE52 1622 aa41.43■■■■■ 4.22
CUL4A-209ENST00000488558 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.42■■■■■ 4.225e-8■■■□□ 17.4
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CUL4A-209ENST00000488558 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.41■■■■■ 4.22
CUL4A-209ENST00000488558 CHD1O14646 1710 aa41.26■■■■■ 4.2
CUL4A-209ENST00000488558 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.23■■■■■ 4.19
CUL4A-209ENST00000488558 TRIM41Q8WV44 630 aa41.12■■■■■ 4.17
CUL4A-209ENST00000488558 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.09■■■■■ 4.17
CUL4A-209ENST00000488558 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.09■■■■■ 4.17
CUL4A-209ENST00000488558 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.09■■■■■ 4.17
CUL4A-209ENST00000488558 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.09■■■■■ 4.17
CUL4A-209ENST00000488558 GRIN2BQ13224 1484 aa41.08■■■■■ 4.17
CUL4A-209ENST00000488558 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.07■■■■■ 4.16
CUL4A-209ENST00000488558 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.07■■■■■ 4.16
CUL4A-209ENST00000488558 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.06■■■■■ 4.16
CUL4A-209ENST00000488558 TOP2BQ02880 1626 aa41.04■■■■■ 4.16
CUL4A-209ENST00000488558 ARHGEF11O15085 1522 aa41.01■■■■■ 4.16
CUL4A-209ENST00000488558 PBRM1Q86U86 1689 aa41.01■■■■■ 4.15
CUL4A-209ENST00000488558 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41■■■■■ 4.15
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CUL4A-209ENST00000488558 SYNJ1O43426 1573 aa40.95■■■■■ 4.15
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CUL4A-209ENST00000488558 NUP160Q12769 1436 aa40.42■■■■■ 4.06
CUL4A-209ENST00000488558 CEP170Q5SW79 1584 aa40.38■■■■■ 4.05
CUL4A-209ENST00000488558 SHROOM2Q13796 1616 aa40.24■■■■■ 4.03
CUL4A-209ENST00000488558 KIF27Q86VH2 1401 aa40.18■■■■■ 4.02
CUL4A-209ENST00000488558 CUL7Q14999 1698 aa40.13■■■■■ 4.01
CUL4A-209ENST00000488558 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.12■■■■■ 4.01
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CUL4A-209ENST00000488558 IGF1RP08069 1367 aa40.05■■■■■ 4
CUL4A-209ENST00000488558 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP39.9■■■■□ 3.98
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